Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06700
• Subject: XM_006505735.2
• Aligned Length: 2136
• Identities: 1567
• Gaps: 363

Alignment

Query    1  ATGGAGTCGCCAACAAAGGAGATTGAAGAATTTGAGAGCAACTCTCTGAAATACCTGCAACCGGAACAGATCGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAAATCTGGCTTCGGCTCCGCGGGCTGAGGAAATATAAGAAAACGTCC--CAG-----AGATTACGGTCTTTG  141
                                                       |.|.||  |||     || ||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGGCCTACAGTATTCAG-TTACGGTCTTTG  30

Query  142  GTCAAACAATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCT  215
            |||||.||||||||..||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   31  GTCAAGCAATTAGAACGAGGAGAGGCCTCTGTGGTAGACCTTAAGAAGAATCTGGAATATGCAGCCACAGTGCT  104

Query  216  TGAATCTGTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATG  289
            |||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  105  TGAATCTGTATATATTGATGAAACAAGGCGACTGCTGGATACAGAGGATGAGCTTAGTGACATTCAATCAGATG  178

Query  290  CTGTGCCTTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGC  363
            ||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  179  CTGTGCCTTCAGAAGTTCGGGATTGGCTGGCCTCCACCTTCACACGGCAGATGGGGATGATGCTTAGGAGAAGT  252

Query  364  GACGAGAAGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACG  437
            ||.|||||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  253  GATGAGAAGCCCAGGTTCAAGAGCATCGTCCATGCGGTGCAAGCTGGGATATTTGTGGAAAGAATGTACAGACG  326

Query  438  GACATCAAACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCAT  511
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|.||||||.|
Sbjct  327  GACATCAAACATGGTTGGGCTGAGCTATCCACCGGCTGTAATCGATGCATTGAAGGATGTGGATACGTGGTCCT  400

Query  512  TTGACGTCTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGT  585
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  401  TCGATGTCTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGAGATCATGCACTGAAGTTCATTTTCTATGAATTACTCACACGT  474

Query  586  TATGATCTGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATA  659
            |||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  475  TATGACCTGATCAGCCGTTTTAAGATACCGATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTCGAAGTGGGTTA  548

Query  660  CAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCT  733
            ||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  549  CAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATAACCTGATGCATGCAGCTGACGTCACACAGACTGTGCATTACCTCCTTT  622

Query  734  ATAAGACAGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGAC  807
            |||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  623  ATAAGACAGGAGTAGCAAACTGGCTGACAGAGCTGGAGATCTTTGCAATAATCTTTTCGGCTGCCATCCATGAC  696

Query  808  TACGAGCATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAG  881
            ||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  697  TATGAACATACTGGAACTACAAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCAGATCCAGCTATCCTGTACAATGACAG  770

Query  882  ATCTGTACTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGA  955
            ||||||.||||||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||.||.
Sbjct  771  ATCTGTCCTGGAGAACCACCACCTGAGTGCAGCCTACCGCCTTCTGCAGGAAGACGAAGAGATGAATATTCTGG  844

Query  956  TTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCT  1029
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  845  TTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACTTTGGTTATTGAGATGGTAATGGCCACAGATATGTCC  918

Query 1030  TGTCACTTCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTT  1103
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  919  TGTCATTTCCAGCAAATCAAAGCCATGAAGACAGCCCTGCAGCAACCAGAAGCAATTGAGAAGCCGAAAGCCTT  992

Query 1104  ATCCCTTATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGT  1177
            ||||||.|||.|.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  993  ATCCCTCATGTTACACACAGCAGACATCAGTCATCCTGCGAAAGCATGGGACCTGCACCACCGCTGGACCATGT  1066

Query 1178  CACTCCTGGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGAC  1251
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1067  CTCTCCTGGAGGAGTTCTTTAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCATTTTCTCCTCTTTGTGAC  1140

Query 1252  CGAAAGTCCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCT  1325
            .|||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1141  AGAAAGTCAACCATGGTTGCTCAGTCACAAGTGGGTTTTATTGACTTCATTGTGGAGCCCACCTTCACTGTGCT  1214

Query 1326  TACGGACATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGC  1399
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1215  CACGGACATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATTGACGAAAGCTCCCAGACTGGTGGGACAGGGCAGAGGA  1288

Query 1400  GTTCGAGTTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGT  1473
            |.||.||||||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||||||||||..|||||.|||||.||||||
Sbjct 1289  GATCAAGTTTGAACAGCATCAACTCATCAGATGCAAAGCGATCCGGTGTCAAGAGTTCTGGGTCAGATGGAAGT  1362

Query 1474  GCCCCGATCAACAATTCTGTCATCTCC-GTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACA  1546
            ||.||.||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1363  GCTCCCATCAACAATTCTGTCAT-TCCTGTTGACTATAAGAGTTTTAAAGCCACTTGGACTGAGGTGGTGCAGA  1435

Query 1547  TCAATCGGGAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGC  1620
            |||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1436  TCAATCGGGAGCGGTGGCGAGCCAAGGTACCCAAAGAAGAAAAAGCCAAGAAGGAAGCTGAAGAGAAGGCTCGC  1509

Query 1621  ATGGCCGCAGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGA  1694
            .||||.||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.|..||||||..||
Sbjct 1510  CTGGCTGCTGAGGAAAAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAAGCTGAACAAGGCACAACCAGCAAAGGCGA  1583

Query 1695  GAAAAAGACGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGA  1768
            |||||||||.||.||||||.|.||.|.||||||||||||||||||      |||..||||.|||||||||||||
Sbjct 1584  GAAAAAGACATCAGGAGAAGCCAAAAGTCAAGTCAATGGAACACG------CAAGGGTGATAACCCTCGTGGGA  1651

Query 1769  AAAATTCCAAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACA  1842
            |.||.|||||||..||.|||   .||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||.||
Sbjct 1652  AGAACTCCAAAGGAGAAAAG---GCAGGCGAAAAGCAGCAGAACGGTGACTTGAAAGACGGTAAAAATAAGGCA  1722

Query 1843  GACAAGAAGGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAACAGATGATTCACAAGAG--------------  1902
            |||||||||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||.|.|| ||||.              
Sbjct 1723  GACAAGAAGGATCACTCCAACACCGGAAATGAGTCAAAGAAAACAGATGGTACA-AAGAAGCGTTCTCATGGCT  1795

Query 1903  --------------------------------------------------------------------------  1902
                                                                                      
Sbjct 1796  CACCTGCTCCGAGCACTAGTTCCACAAGTCGCATTACCTTGCCAGTCATCAAGCCTCCTTTGCGTCACTTTAAG  1869

Query 1903  --------------------------------------------------------------------------  1902
                                                                                      
Sbjct 1870  CGTCCTGCTTATGCATCTAGCTCCTATGCACCTTCCGTCCCGAAGAAAACTGATGATCATCCTGTAAGATACAA  1943

Query 1903  ----------------------------------------------------------------  1902
                                                                            
Sbjct 1944  GATGCTGGATCAGCGGATCAAGATGAAAAAGATCCAGAACATCTCTCATCACTGGAACAAAAAA  2007