Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06700
- Subject:
- XM_017012265.1
- Aligned Length:
- 2256
- Identities:
- 1859
- Gaps:
- 363
Alignment
Query 1 ATG--------GAGTCGCCAACAAAGGAGATTG-----------------AAGAATTTGAGAGC---------- 39
||| |||.|.|| |||||.||| ||||||...|||.|
Sbjct 1 ATGGGAAGACTGAGGCTCC-----AGGAGGTTGCAAATGAAGCTGGAGACAAGAATGCCAGACCACTGGCCCGC 69
Query 40 ---------------------AACTCTCT---GAAATACCTGCAACCGGA-------ACAG--------ATCGA 74
||||.||| |||.|.||| ||.| || |||| |..||
Sbjct 70 TTCTCTCGGTCTAAGTCACAGAACTGTCTGTGGAACTCCCT-CATC--GATGGGCTCACAGGGAATGTCAAGGA 140
Query 75 GAA------------AATCTG-------GCTTCGGCTCC--GCGG--------GCTGAGGAAAT---------- 109
||| ||| || .|.|||.|.|| |.|| |||||.|||.|
Sbjct 141 GAAGCCAAGGCCAACAAT-TGTCCATGACCCTCGACCCCCAGAGGAGATCCTAGCTGATGAATTGCCACAGCTG 213
Query 110 -ATA---------------AGAAAACGTCCCAGAGATTACGGTCTTTGGTCAAACAATTAGAGAGAGGGGAAGC 167
||| .|||.||.|||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 GATAGCCCAGAAGTCTTGGTGAAGACATCCTTCAGATTACGGTCTTTGGTCAAACAATTAGAGAGAGGGGAAGC 287
Query 168 TTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCTGTGTATATTGATGAAACAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 TTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCTGTGTATATTGATGAAACAA 361
Query 242 GGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCCTTCTGAGGTCCGAGACTGG 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 GGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCCTTCTGAGGTCCGAGACTGG 435
Query 316 CTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGAAGCCCCGGTTCAAGAGCAT 389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 CTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGAAGCCCCGGTTCAAGAGCAT 509
Query 390 CGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCAAACATGGTTGGACTGAGCT 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 CGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCAAACATGGTTGGACTGAGCT 583
Query 464 ATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCATTTGACGTCTTTTCCCTCAATGAGGCC 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 ATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCCTTTGACGTCTTTTCCCTCAATGAGGCC 657
Query 538 AGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATCTGATCAGCCGTTTCAAGAT 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 AGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATCTGATCAGCCGTTTCAAGAT 731
Query 612 CCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATA 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 CCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATA 805
Query 686 ACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGACAGGAGTGGCGAACTGGCTG 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 ACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGACAGGAGTGGCGAACTGGCTG 879
Query 760 ACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGCATACCGGAACCACCAACAA 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 ACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGCATACCGGAACCACCAACAA 953
Query 834 TTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTACTGGAGAATCACCATTTAA 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 TTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTACTGGAGAATCACCATTTAA 1027
Query 908 GTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGG 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 GTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGG 1101
Query 982 GAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACTTCCAACAAATCAAAGCAAT 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 GAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACTTCCAACAAATCAAAGCAAT 1175
Query 1056 GAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTTATGCTGCATACAGCAGATA 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 GAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTTATGCTGCATACAGCAGATA 1249
Query 1130 TTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCTGGAGGAGTTCTTCAGACAG 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 TTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCTGGAGGAGTTCTTCAGACAG 1323
Query 1204 GGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGTCCACTATGGTTGCTCAGTC 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 GGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGTCCACTATGGTTGCTCAGTC 1397
Query 1278 ACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGACATGACCGAGAAGATTGTGA 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 ACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGACATGACCGAGAAGATTGTGA 1471
Query 1352 GTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAGTTTGAATAGCATCAGCTCG 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 GTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAGTTTGAATAGCATCAGCTCG 1545
Query 1426 TCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGATCAACAATTCTGTCATCTC 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 TCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGATCAACAATTCTGTCATCTC 1619
Query 1500 CGTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGGGAGAGATGGAGGGCCAAGG 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 CGTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGGGAGAGATGGAGGGCCAAGG 1693
Query 1574 TACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCATGGCCGCAGAGGAGCAGCAAAAGGAA 1647
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 TACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCCTGGCCGCAGAGGAGCAGCAAAAGGAA 1767
Query 1648 ATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGACGTCTGGAGAAACTAAGAA 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 ATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGACGTCTGGAGAAACTAAGAA 1841
Query 1722 TCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAATTCCAAAGCCGAGAAGTCATCAG 1795
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 TCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAACTCCAAAGCCGAGAAGTCATCAG 1915
Query 1796 GAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAAGGATCACTCTAACATCGGA 1869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 GAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAAGGATCACTCTAACATCGGA 1989
Query 1870 AATGATTCAAAGAAAACAGATGATTCACAAGAG----------------------------------------- 1902
||||||||||||||||||||||...||.||.||
Sbjct 1990 AATGATTCAAAGAAAACAGATGGCACAAAACAGCGTTCTCACGGCTCACCAGCCCCAAGCACCAGCTCCACGTG 2063
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2064 TCGCCTTACGTTGCCAGTCATCAAGCCTCCTTTGCGTCATTTTAAACGCCCTGCTTACGCATCTAGCTCCTATG 2137
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2138 CACCTTCAGTCTCAAAGAAAACTGATGAGCATCCTGCAAGGTACAAGATGCTGGATCAGAGGATCAAAATGAAA 2211
Query 1903 ------------------------------------ 1902
Sbjct 2212 AAGATTCAGAACATCTCACATAACTGGAACAGAAAA 2247