Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06732
• Subject: NM_016670.3
• Aligned Length: 1308
• Identities: 1145
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGATGGCTACACAGACATTAAGTATAGACAGCTATCAAGATGGGCAACAGATGCAAGTAGTAACAGAGTTAAA  74
            ||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGATGGCGACACAGACGCTAAGTATAGACAGCTATCAAGATGGACAGCAAATGCAGGTGGTCACGGAGTTAAA  74

Query   75  GACAGAACAAGATCCAAACTGCTCTGAACCCGATGCAGAAGGAGTGAGCCCTCCCCCTGTGGAGTCTCAGACCC  148
            .|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||||
Sbjct   75  AACAGAGCAAGATCCCAACTGCTCTGACCCAGATGCAGAAGGAGTGAGTCCTCCTCCCATCGAGTCTCAGACCC  148

Query  149  CGATGGATGTGGACAAGCAGGCCATTTATAGGCATCCACTATTTCCATTATTAGCTTTGTTGTTTGAAAAATGT  222
            |.|||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  CAATGGATGCCGACAAGCAGGCCATTTATAGGCATCCACTATTTCCGTTGCTAGCTTTGTTGTTTGAGAAGTGT  222

Query  223  GAACAATCTACACAGGGCTCTGAAGGCACAACTTCTGCCAGTTTTGATGTAGACATCGAAAATTTTGTAAGAAA  296
            ||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct  223  GAGCAGTCCACACAGGGCTCAGAAGGCACGACGTCTGCCAGCTTCGATGTGGACATTGAGAACTTTGTCAGGAA  296

Query  297  GCAAGAGAAGGAAGGGAAACCTTTCTTTTGTGAAGATCCAGAAACCGATAATTTAATGGTAAAAGCAATCCAGG  370
            ||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||..|||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  GCAAGAAAAGGATGGGAAACCCTTCTTCTGTGAAGATCCGGAAACTGACAACCTAATGGTGAAAGCAATCCAGG  370

Query  371  TTTTGCGCATTCATCTTCTTGAGCTGGAAAAGGTTAACGAACTCTGCAAAGATTTCTGCAGTCGATACATTGCT  444
            |..|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  TCCTGCGCATTCATCTTCTTGAACTGGAGAAGGTTAATGAGCTCTGTAAAGATTTCTGTAGTCGGTACATTGCT  444

Query  445  TGTCTGAAAACAAAAATGAACAGTGAAACTCTGTTGAGTGGAGAGCCTGGAAGCCCGTACTCACCAGTGCAGTC  518
            ||||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct  445  TGTCTGAAGACAAAAATGAACAGCGAGACCTTGTTGAGTGGGGAGCCTGGAAGTCCGTACTCCCCTGTGCAATC  518

Query  519  CCAGCAGATTCAAAGTGCCATCACAGGCACCATCAGCCCTCAGGGAATTGTGGTGCCGGCGTCCGCGCTGCAGC  592
            ||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.||.|
Sbjct  519  CCAGCAGATTCAGAGTGCCATCACAGGCACGCTCAGCCCCCAGGGAATCGTGGTGCCAGCATCAGCCCTACAAC  592

Query  593  AGGGAAACGTAGCCATGGCGACGGTGGCAGGTGGCACAGTGTATCAGCCTGTCACGGTCGTCACTCCCCAAGGC  666
            |||||||.|||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  AGGGAAATGTAACCATGGCAACAGTGGCAGGTGGCACAGTGTACCAGCCTGTCACCGTCGTCACTCCGCAAGGC  666

Query  667  CAAGTGGTCACACAGACATTGTCGCCTGGGACAATTAGGATCCAGAACTCCCAGCTTCAGTTACAGTTAAACCA  740
            |||||||||||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  CAAGTGGTCACGCAGGCATTATCTCCTGGGACAATTAGGATCCAGAACTCACAGCTGCAGTTGCAGTTGAACCA  740

Query  741  AGATCTCAGCATCTTGCATCAAGATGATGGTTCATCTAAGAACAAGAGGGGCGTCCTGCCAAAGCATGCCACGA  814
            |||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  741  AGACCTCAGCATCTTGCATCAAGAGGATGGCTCCTCCAAGAACAAGAGGGGTGTCCTGCCGAAGCACGCCACCA  814

Query  815  ACGTGATGCGGTCCTGGCTCTTCCAGCACATCGGGCATCCCTACCCAACAGAGGATGAGAAAAAACAGATTGCT  888
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  ACGTGATGCGGTCCTGGCTCTTTCAGCACATAGGGCATCCCTACCCAACAGAGGATGAGAAAAAGCAGATTGCT  888

Query  889  GCTCAGACAAATTTGACACTACTCCAAGTCAACAACTGGTTCATCAATGCCAGAAGACGAATTCTTCAGCCAAT  962
            ||||||||.|||.||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GCTCAGACGAATCTGACCCTGCTTCAAGTCAACAACTGGTTCATCAACGCGAGAAGACGAATTCTCCAGCCAAT  962

Query  963  GTTGGATTCAAGTTGTTCAGAGACCCCCAAAACAAAGAAAAAAACTGCTCAGAACCGGCCAGTTCAGAGGTTTT  1036
            |||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTGGATTCCAGCTGCTCAGAGACTCCAAAAACGAAGAAAAAACCTGCTCAGAACAGGCCAGTTCAGAGGTTTT  1036

Query 1037  GGCCTGATTCTATTGCATCAGGAGTCGCACAGCCACCGCCGAGCGAGCTCACCATGTCGGAAGGAGCTGTTGTC  1110
            ||||.||||||.|||||||||||||.|||||..||.|.||.||||||||..|||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1037  GGCCAGATTCTCTTGCATCAGGAGTGGCACAAGCAACACCCAGCGAGCTTGCCATGTCAGAAGGTGCCGTTGTG  1110

Query 1111  ACCATCACCACGCCCGTGAACATGAACGTGGACAGCCTTCAGTCTCTGTCCTCGGACGGGGCCACCCTGGCGGT  1184
            |||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  ACCATCACCACACCTGTAAACATGAATGTGGACAGCCTTCAGTCCCTGTCCTCAGACGGGGCCACCCTGGCCGT  1184

Query 1185  GCAGCAGGTCATGATGGCAGGGCAGAGCGAGGACGAGTCTGTGGACAGCACAGAGGAGGATGCGGGTGCCCTGG  1258
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|..||.|||||||
Sbjct 1185  ACAGCAGGTCATGATGGCAGGGCAGAGTGAGGACGAGTCGGTGGATAGCACAGAGGATGAGGGCGGCGCCCTGG  1258

Query 1259  CCCCTGCCCACATCAGCGGGCTGGTCTTGGAGAACAGTGACTCCCTGCAG  1308
            |.||..|.|||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1259  CGCCCACACACATCAGCGGGCTGGTGCTGGAGAACAGCGACTCCCTTCAG  1308