Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06791
• Subject: NM_001031850.4
• Aligned Length: 1295
• Identities: 925
• Gaps: 313

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||||||.|.||||||.|||||.|..|||||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGACAACTGATGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAAATATATATGGGCCTGCATACACTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||   |||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCAAAT---TATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA  293

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAAGACGCAGGATCCTATACCTTACACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  294  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  367

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATAGGACTAGAGGAGTAACTGGATATT------TCACCTT-------------------  419
            |||||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||      |||||||                   
Sbjct  368  TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG  441

Query  420  -----------------CAACTTA--------------------------------------------------  426
                             |||||||                                                  
Sbjct  442  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  515

Query  427  -------------TACCT--------------------------------------------------------  431
                         |||||                                                        
Sbjct  516  TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  589

Query  432  --------------------------------------------------------------------------  431
                                                                                      
Sbjct  590  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  663

Query  432  --------------------------------------------GAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  461
                                                        |||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  664  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA  737

Query  462  CAACTCAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  535
            |||||.|||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  738  CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA  811

Query  536  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCAACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  609
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  812  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  885

Query  610  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGAGATGGTGGCATGCACAG  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||.|.|||
Sbjct  886  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  959

Query  684  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1033

Query  758  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  831
            ||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1034  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1107

Query  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGAGGGCTCTATACTTGCTC  905
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1108  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1181

Query  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTT--CA-GGAA  976
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||.|||.|  || ||||
Sbjct 1182  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCATGGAA  1255

Query  977  TAGGACGTCTACC--------TCTCATTAATCCAATA  1005
                      |||        ||||||          
Sbjct 1256  ----------ACCAGACAGAGTCTCAT----------  1272