Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06791
• Subject: NM_001130168.2
• Aligned Length: 1049
• Identities: 758
• Gaps: 202

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||          
Sbjct    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAG----------  64

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACC--------CAAAGTTT----  136
                   ||||..||.||                       ||||||| |||.|        ||||  ||    
Sbjct   65  -------TGGAGACTCCC-----------------------AAGCCCT-CCATCTCCAGCAGCAAA--TTAAAC  105

Query  137  CCGAGGG-------GAAGGATGT--TCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATC---TTGCTGGCTACATC  198
            ||.||||       |.|||.|||  .||| .||.|||    .||   |||.|||.||   ..||..|||||.|.
Sbjct  106  CCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTT-AACCTGT----GAT---CCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTG  171

Query  199  TGGTACAAAGGACAACTG-ATGG-----ACCTCTACC-ATTACATTACATCATA---TGTAGTAGACGGTCAAA  262
            ||||     |||    || ||||     .||||  || ||..|      |||.|   ||.|||.|.|  |.|||
Sbjct  172  TGGT-----GGA----TGAATGGTCAGAGCCTC--CCTATGTC------TCACAGGTTGCAGTTGTC--TGAAA  226

Query  263  TAAATATATATGGGCCTGCATAC-ACTGGACGAGAAACAGTATATTCCAATGCA--TCCCTGCTGATCCAGAAT  333
            ..||.|     ||.||..|.|.| |.|||..|..|.|.||||     ||.||||  .||||    ||   ||||
Sbjct  227  CCAACA-----GGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTA-----CACTGCAGGACCCT----AT---GAAT  283

Query  334  GTCACCCGGGAAGACGCAGGATCCTATACCTTACACATCATAAAGCGAGGTGATAGGACTAG-AGGAGTAACTG  406
            ||      |.||.||   |||.||.|                       |||  ||..|.|| .|.|||.||  
Sbjct  284  GT------GAAATAC---GGAACCCA-----------------------GTG--AGTGCCAGCCGCAGTGAC--  321

Query  407  GATATTTCACCTTCAA----CTTATACCTGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAACTCAAAACCCAG  476
              ...||||||.|.||    ||    ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  322  --CCATTCACCCTGAATCTCCT----CCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAACTTAAAACCCAG  389

Query  477  GGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATG  550
            |||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  GGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATG  463

Query  551  GTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCAACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACG  624
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  GTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACG  537

Query  625  AGAAATGAAACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGAGATGGTGGCATGCACAGTGACCCAGTCACCCT  698
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||.|.||||.|||||||||||||
Sbjct  538  AGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAGTTACCCAGTCACCCT  611

Query  699  GAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCT  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  612  GAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCT  685

Query  773  ACTTGTCCTGCTTC-GCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCAATC  845
            |||||||||| ||| |||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  686  ACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATC  758

Query  846  AGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGAGGGCTCTATACTTGCTCTGTTCGTAACTCAG  919
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  759  AGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAG  832

Query  920  CCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG-CTCCTTCAGGAATAGGACGTCTACCTCT  992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||| ||            ||||.| ||||.  
Sbjct  833  CCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGACT------------GGACAT-TACCC--  891

Query  993  CATTAATCCAATA  1005
                         
Sbjct  892  -------------  891