Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06791
Subject:
XM_017027001.2
Aligned Length:
1022
Identities:
917
Gaps:
40

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.|.|||.|..|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGACAACTGATGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||...||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAAATATATATGGGCCTGCATACACTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAAGACGCAGGATCCTATACCTTACACA  370
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATAGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCAACTTATACCTGAAGCTGCCCAAG  444
            |||||||||||.|.|||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||..||||||.|||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCCAAAGCTGTCCAAG  444

Query  445  CCCTACATCACCATCAACAACTCAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAG  518
            |||||||||||.||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTACATCACAATCAACAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAG  518

Query  519  TGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCAACCCATTG  592
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  519  TAAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTG  592

Query  593  AAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGA  666
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAACAGGATCCTCATTCTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGA  666

Query  667  GATGGTGGCATGCACAGTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTC  740
            .||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGGTGGCATCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTC  740

Query  741  ATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||||.|.||||
Sbjct  741  ATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATT  814

Query  815  TTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGA  888
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  815  CTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGT  888

Query  889  GGGCTCTATACTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTC  962
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct  889  GGGCTCTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTC  962

Query  963  TG----------------CTCCTTCAGG-AATAGGACGTCTACCTCTCATTAATCCAATA  1005
            ||                .|||||  || ||||||            .|||         
Sbjct  963  TGGTAAGTGGATCCCAGCATCCTT--GGCAATAGG------------GATT---------  999