Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06792
• Subject: NM_001206650.2
• Aligned Length: 1278
• Identities: 826
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||..||.||||||||.||||||||||||||||          
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCATATAACCTGGAAAGGGCTCCTGCTCACAG----------  64

Query   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444
                                                                        |||||||||||||.
Sbjct   65  ------------------------------------------------------------TGGAGACTCCCAAA  78

Query  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||...||||.|||||||||||||||
Sbjct   79  CCCTCCATCTCCAGCAGCAATTTCAACCCCAGGGAGGCCACGGAGGCTGTGATTTTAACCTGTGATCCTGAGAC  152

Query  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592
            ||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||..|||
Sbjct  153  TCCAGATGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGCTGTCTGAAA  226

Query  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  CCAACAGGACCCTCTACCTATTTGGTGTCACAAACTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  300

Query  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA  740
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct  301  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  374

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTCAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  448

Query  815  TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  888
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct  449  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACGCATTGAAAACAGGATCCTCATT  522

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  523  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  596

Query  963  TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.|||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  597  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  670

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  1110
            |||||.||||||||.|||||||||||||..||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct  671  CAGGACAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  744

Query 1111  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTTTCTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  818

Query 1185  TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCATGGAG  1258
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.||||||||   .|||       |
Sbjct  819  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCGTGACAGTCAGAGTCTCTG---ACTG-------G  882

Query 1259  ACCTGACAGAGTCTCAGTCA  1278
            ||.|.||..           
Sbjct  883  ACATTACCC-----------  891