Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06814
• Subject: NM_011203.2
• Aligned Length: 2361
• Identities: 1997
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGAGCAAGTGGAGATCCTGAGGAAATTCATCCAGAGGGTCCAGGCCATGAAGAGTCCTGACCACAATGGGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCAAGTGGAGATCCTGAGGAGGTTCATCCAGAGGGTCCAGGCCATGAAGAGTCCGGATCACAATGGGGA  74

Query   75  GGACAACTTCGCCCGGGACTTCATGCGGTTAAGAAGATTGTCTACCAAATATAGAACAGAAAAGATATATCCCA  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGACAACTTCGCCCGGGACTTCATGCGATTGAGAAGATTGTCTACCAAATATAGAACAGAAAAGATTTATCCCA  148

Query  149  CAGCCACTGGAGAAAAAGAAGAAAATGTTAAAAAGAACAGATACAAGGACATACTGCCATTTGATCACAGCCGA  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCCACTGGAGAAAAAGAAGAAAATGTTAAAAAGAACAGATATAAGGACATACTGCCATTTGATCACAGCCGA  222

Query  223  GTTAAATTGACATTAAAGACTCCTTCACAAGATTCAGACTATATCAATGCAAATTTTATAAAGGGCGTCTATGG  296
            |||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  223  GTTAAGTTGACTTTGAAGACTCCATCCCAAGATTCAGATTATATCAATGCAAATTTTATTAAGGGTGTGTATGG  296

Query  297  GCCAAAAGCATATGTAGCAACTCAAGGACCTTTAGCAAATACAGTAATAGATTTTTGGAGGATGATATGGGAGT  370
            |||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCAAAAGCATATGTGGCAACCCAAGGGCCTTTGGCGAATACAGTCATAGACTTCTGGAGGATGATATGGGAGT  370

Query  371  ATAATGTTGTGATCATTGTAATGGCCTGCCGAGAATTTGAGATGGGAAGGAAAAAATGTGAGCGCTATTGGCCT  444
            ||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  ATAATGTTGTGATCATCGTGATGGCCTGTCGAGAATTTGAGATGGGAAGGAAAAAGTGTGAGCGCTACTGGCCT  444

Query  445  TTGTATGGAGAAGACCCCATAACGTTTGCACCATTTAAAATTTCTTGTGAGGATGAACAAGCAAGAACAGACTA  518
            ||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  TTGTATGGAGAAGATCCTATAACATTTGCACCATTTAAAATTTCTTGTGAAAATGAACAAGCAAGAACCGACTA  518

Query  519  CTTCATCAGGACACTCTTACTTGAATTTCAAAATGAATCTCGTAGGCTGTATCAGTTTCATTATGTGAACTGGC  592
            |||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  CTTCATCCGAACACTTTTACTTGAATTTCAAAATGAATCCCGTCGGCTCTATCAGTTTCATTACGTGAACTGGC  592

Query  593  CAGACCATGATGTTCCTTCATCATTTGATTCTATTCTGGACATGATAAGCTTAATGAGGAAATATCAAGAACAT  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CAGACCATGATGTTCCTTCGTCATTTGATTCTATTCTGGACATGATAAGCTTAATGAGGAAATACCAAGAACAT  666

Query  667  GAAGATGTTCCTATTTGTATTCATTGCAGTGCAGGCTGTGGAAGAACAGGTGCCATTTGTGCCATAGATTATAC  740
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GAAGATGTGCCTATTTGTATTCATTGCAGTGCAGGCTGTGGACGAACAGGTGCTATTTGTGCCATAGATTACAC  740

Query  741  GTGGAATTTACTAAAAGCTGGGAAAATACCAGAGGAATTTAATGTATTTAATTTAATACAAGAAATGAGAACAC  814
            ||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGGAACTTACTGAAAGCAGGGAAAATTCCAGAGGAATTTAATGTATTTAATTTAATACAAGAAATGAGAACAC  814

Query  815  AAAGGCATTCTGCAGTACAAACAAAGGAGCAATATGAACTTGTTCATAGAGCTATTGCCCAACTGTTTGAAAAA  888
            |.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  AGAGGCACTCGGCAGTACAAACAAAGGAGCAGTATGAACTTGTTCATAGGGCTATTGCTCAACTGTTTGAAAAA  888

Query  889  CAGCTACAACTATATGAAATTCATGGAGCTCAGAAAATTGCTGATGGAGTGAATGAAATTAACACTGAAAACAT  962
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||   .||||||||||.|||||.||..||
Sbjct  889  CAGCTACAACTGTATGAAATTCATGGAGCACAGAAGATCGCTGATGG---TAATGAAATTACCACTGGAACTAT  959

Query  963  GATCAGCTCCAT--AGAGCCTGAAAAACAAGATTCTCCTCCTCCAAAACCACCAAGGACCCGCAGTTGCCTTGT  1034
            |.||||.|||||  |.|||  ||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||
Sbjct  960  GGTCAGTTCCATTGATAGC--GAGAAGCAAGACTCTCCTCCGCCAAAGCCACCGCGGACTCGAAGTTGCCTTGT  1031

Query 1035  TGAAGGGGATGCTAAAGAAGAAATACTGCAGCCACCGGAACCTCATCCAGTGCCACCCATCTTGACACCTTCTC  1108
            .|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||.||||.||.||.|
Sbjct 1032  AGAAGGGGATGCCAAGGAAGAAATACTACAGCCACCAGAACCTCACCCGGTGCCACCCATCCTGACGCCATCAC  1105

Query 1109  CCCCTTCAGCTTTTCCAACAGTCACTACTGTGTGGCAGGACAATGATAGATACCATCCAAAGCCAGTGTTGCAT  1182
            |.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||.|||.||.|||||.||||||||||||.||||.
Sbjct 1106  CTCCTTCAGCCTTCCCAACCGTTACCACTGTGTGGCAGGACAGTGACAGGTACCACCCAAAGCCAGTGCTGCAC  1179

Query 1183  ATGGTTTCATCAGAACAACATTCAGCAGACCTCAACAGAAACTATAGTAAATCAACAGAACTTCCA---GGGAA  1253
            ||||..|||.||||.|||||..||||.|||||||||||||.||||..|||||||.|.||   .|||   |||||
Sbjct 1180  ATGGCCTCACCAGAGCAACACCCAGCCGACCTCAACAGAAGCTATGATAAATCAGCGGA---CCCAATGGGGAA  1250

Query 1254  AAATGAATCAACAATTGAACAGATAGATAAAAAATTGGAACGAAATTTAAGTTTTGAGATTAAGAAGGTCCCTC  1327
            ||.|||||||.|.|||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1251  AAGTGAATCAGCTATTGAGCACATAGATAAGAAGTTAGAGCGCAATTTAAGTTTTGAGATTAAGAAAGTCCCTC  1324

Query 1328  TCCAAGAGGGACCAAAAAGTTTTGATGGGAACACACTTTTGAATAGGGGACATGCAATTAAAATTAAATCTGCT  1401
            |||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1325  TCCAAGAAGGGCCCAAAAGTTTTGATGGGAACACACTCTTGAATAGGGGACATGCGATTAAAATTAAATCTGCT  1398

Query 1402  TCACCTTGTATAGCTGATAAAATCTCTAAGCCACAGGAATTAAGTTCAGAT---CTAAATGTCGGTGATACTTC  1472
            |||.|||.|.|||.|||.|.||.||||||.||||||||.||||||.|||.|   |||||.||.|.||||...||
Sbjct 1399  TCATCTTCTGTAGTTGACAGAACCTCTAAACCACAGGAGTTAAGTGCAGGTGCCCTAAAGGTTGATGATGTATC  1472

Query 1473  CCAGAATTCTTGTGTGGACTGCAGTGTAACACAATCAAACAAAGTT--TCAGTTACTCCACCAGAAGAATCCCA  1544
            .|||||||||||.|.||||||.||||...|.||.|||.|||.||.|  |.|||     |..||||.||.|||||
Sbjct 1473  TCAGAATTCTTGCGCGGACTGTAGTGCGGCTCATTCACACAGAGCTGCTGAGT-----CGTCAGAGGAGTCCCA  1541

Query 1545  G---AATTCAGACACACCTCCAAGGCCAGACCGCTTGCCTCTTGATGAGAAAGGACATGTAACGTGGTCATTTC  1615
            |   ||.|||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct 1542  GAGCAACTCACACACACCTCCACGGCCAGACTGCTTGCCTCTCGATAAGAAAGGACACGTAACGTGGTCACTTC  1615

Query 1616  ATGGACCTGAAAATGCCATACCCATACCTGATTTATCTGAAGGCAATTCCTCAGAT-ATCAACTATCAAACTAG  1688
            ||||||||||||||||||.|||..||||.||.|.|.||||.|||||.|||.||||| ||| |.|.|||.|||..
Sbjct 1616  ATGGACCTGAAAATGCCACACCTGTACCCGACTCACCTGACGGCAAATCCCCAGATAATC-ATTCTCAGACTCT  1688

Query 1689  GAAAACTGTGAGTTTAACA-CCAAGTCCTACAACACAAGTTGAAACACCTGATCTTGTGGATCATGATAACACT  1761
            ||||||.|||||||..||| ||||.||| ||..||.|||..|||.|.|..||||||...||.||..|.||||..
Sbjct 1689  GAAAACCGTGAGTTCCACACCCAACTCC-ACCGCAGAAGAGGAAGCCCACGATCTTACAGAGCACCACAACAGC  1761

Query 1762  TCACCACTCTTCAGAACACCCCTCAGTTTTACTAATCCACTTCACTCTGATGACTCAGACTCAGATGAAAGAAA  1835
            ||.||.||.||.|.|.|.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|.|.|.|.
Sbjct 1762  TCCCCTCTGTTGAAAGCTCCCCTCAGCTTTACCAACCCTCTTCACTCTGACGACTCGGACTCAGACGGAGGGAG  1835

Query 1836  CTCTGATGGTGCTGTGACCCAGAATAAAACTAATATTTCAACAGCAAGTGCCACAGTTTCTGCTGCCACTAGTA  1909
            |||||||||||||||||||..|||.|||||||..|||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||.
Sbjct 1836  CTCTGATGGTGCTGTGACCAGGAACAAAACTAGCATTTCAACAGCAAGTGCCACAGTGTCTCCTGCCAGTAGTG  1909

Query 1910  CTGAAAGCATTTCTACTAGGAAAGTATTGCCAATGTCCATTGCTAGACATAATATAGCAGGAACAACACATTCA  1983
            ||||.||...||..|||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||..|..|||||||.||..|.||||||
Sbjct 1910  CTGAGAGTGCTTGCACTAGGAGAGTATTGCCGATGTCCATTGCCAGACAGGAAGTAGCAGGCACGCCGCATTCA  1983

Query 1984  GGTGCTGAAAAAGATGTTGATGTTAGTGAAGATTCACCTCCTCCCCTACCTGAAAGAACTCCTGAATCGTTTGT  2057
            ||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||.||||||||..||||||||.||||||||||.||.|||||
Sbjct 1984  GGTGCTGAGAAAGATGCTGATGTTAGTGAGGAGTCGCCTCCTCCTTTACCTGAACGAACTCCTGAGTCTTTTGT  2057

Query 2058  GTTAGCAAGTGAACATAATACACCTGTAAGATCGGAATGGAGTGAACTTCAAAGTCAGGAACGATCTGAACAAA  2131
            .||||||         .|||..|||||||||.|.||.|||..||||||||.||.||||||..|.||||||||||
Sbjct 2058  ATTAGCA---------GATATGCCTGTAAGACCTGAGTGGCATGAACTTCCAAATCAGGAGTGGTCTGAACAAA  2122

Query 2132  AAAAGTCTGAAGGCTTGATAACCTCTGAAAATGAGAAATGTGATCATCCAGCGGGAGGTATTCACTATGAAA--  2203
            ...|.|||||||||||||.||||||||.||||||.|||..||||      ||.||.||.||.|||    |.|  
Sbjct 2123  GGGAATCTGAAGGCTTGACAACCTCTGGAAATGAAAAACATGAT------GCAGGGGGCATCCAC----ACAGA  2186

Query 2204  ----TGTGCATAGAATGTCCACCTACTTTCAGTGACAAGAGAGAACAAATATCAGAAAATCCAACAGAAGCCAC  2273
                |.|||  |||.|.|||||||.|||||||||||||||.|||.||||||.||.|||.||||.||||||.|||
Sbjct 2187  GGCTTCTGC--AGACTCTCCACCTGCTTTCAGTGACAAGAAAGATCAAATAACAAAAAGTCCAGCAGAAGTCAC  2258

Query 2274  AGATATTGGTTTTGGTAATCGATGTGGAAAACCCAAAGGACCAAGAGATCCACCTTCAGAATGGACA  2340
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2259  AGATATTGGTTTTGGTAATCGCTGTGGAAAACCTAAAGGACCAAGAGAGCCACCTTCAGAATGGACA  2325