Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06814
• Subject: XM_005250518.2
• Aligned Length: 2340
• Identities: 1994
• Gaps: 345

Alignment

Query    1  ATGGAGCAAGTGGAGATCCTGAGGAAATTCATCCAGAGGGTCCAGGCCATGAAGAGTCCTGACCACAATGGGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACAACTTCGCCCGGGACTTCATGCGGTTAAGAAGATTGTCTACCAAATATAGAACAGAAAAGATATATCCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGCCACTGGAGAAAAAGAAGAAAATGTTAAAAAGAACAGATACAAGGACATACTGCCATTTGATCACAGCCGA  222
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct    1  ------------------------ATGTTAAAAAGAACAGATACAAGGACATACTGCCAT--------------  36

Query  223  GTTAAATTGACATTAAAGACTCCTTCACAAGATTCAGACTATATCAATGCAAATTTTATAAAGGGCGTCTATGG  296
                                                                                      
Sbjct   37  --------------------------------------------------------------------------  36

Query  297  GCCAAAAGCATATGTAGCAACTCAAGGACCTTTAGCAAATACAGTAATAGATTTTTGGAGGATGATATGGGAGT  370
                                                                                      
Sbjct   37  --------------------------------------------------------------------------  36

Query  371  ATAATGTTGTGATCATTGTAATGGCCTGCCGAGAATTTGAGATGGGAAGGAAAAAATGTGAGCGCTATTGGCCT  444
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   37  -----------ATCATTGTAATGGCCTGCCGAGAATTTGAGATGGGAAGGAAAAAATGTGAGCGCTATTGGCCT  99

Query  445  TTGTATGGAGAAGACCCCATAACGTTTGCACCATTTAAAATTTCTTGTGAGGATGAACAAGCAAGAACAGACTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  TTGTATGGAGAAGACCCCATAACGTTTGCACCATTTAAAATTTCTTGTGAGGATGAACAAGCAAGAACAGACTA  173

Query  519  CTTCATCAGGACACTCTTACTTGAATTTCAAAATGAATCTCGTAGGCTGTATCAGTTTCATTATGTGAACTGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  CTTCATCAGGACACTCTTACTTGAATTTCAAAATGAATCTCGTAGGCTGTATCAGTTTCATTATGTGAACTGGC  247

Query  593  CAGACCATGATGTTCCTTCATCATTTGATTCTATTCTGGACATGATAAGCTTAATGAGGAAATATCAAGAACAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  CAGACCATGATGTTCCTTCATCATTTGATTCTATTCTGGACATGATAAGCTTAATGAGGAAATATCAAGAACAT  321

Query  667  GAAGATGTTCCTATTTGTATTCATTGCAGTGCAGGCTGTGGAAGAACAGGTGCCATTTGTGCCATAGATTATAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  GAAGATGTTCCTATTTGTATTCATTGCAGTGCAGGCTGTGGAAGAACAGGTGCCATTTGTGCCATAGATTATAC  395

Query  741  GTGGAATTTACTAAAAGCTGGGAAAATACCAGAGGAATTTAATGTATTTAATTTAATACAAGAAATGAGAACAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  GTGGAATTTACTAAAAGCTGGGAAAATACCAGAGGAATTTAATGTATTTAATTTAATACAAGAAATGAGAACAC  469

Query  815  AAAGGCATTCTGCAGTACAAACAAAGGAGCAATATGAACTTGTTCATAGAGCTATTGCCCAACTGTTTGAAAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  AAAGGCATTCTGCAGTACAAACAAAGGAGCAATATGAACTTGTTCATAGAGCTATTGCCCAACTGTTTGAAAAA  543

Query  889  CAGCTACAACTATATGAAATTCATGGAGCTCAGAAAATTGCTGATGGAGTGAATGAAATTAACACTGAAAACAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  CAGCTACAACTATATGAAATTCATGGAGCTCAGAAAATTGCTGATGGAGTGAATGAAATTAACACTGAAAACAT  617

Query  963  GATCAGCTCCATAGAGCCTGAAAAACAAGATTCTCCTCCTCCAAAACCACCAAGGACCCGCAGTTGCCTTGTTG  1036
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  GGTCAGCTCCATAGAGCCTGAAAAACAAGATTCTCCTCCTCCAAAACCACCAAGGACCCGCAGTTGCCTTGTTG  691

Query 1037  AAGGGGATGCTAAAGAAGAAATACTGCAGCCACCGGAACCTCATCCAGTGCCACCCATCTTGACACCTTCTCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  AAGGGGATGCTAAAGAAGAAATACTGCAGCCACCGGAACCTCATCCAGTGCCACCCATCTTGACACCTTCTCCC  765

Query 1111  CCTTCAGCTTTTCCAACAGTCACTACTGTGTGGCAGGACAATGATAGATACCATCCAAAGCCAGTGTTGCATAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  CCTTCAGCTTTTCCAACAGTCACTACTGTGTGGCAGGACAATGATAGATACCATCCAAAGCCAGTGTTGCATAT  839

Query 1185  GGTTTCATCAGAACAACATTCAGCAGACCTCAACAGAAACTATAGTAAATCAACAGAACTTCCAGGGAAAAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  GGTTTCATCAGAACAACATTCAGCAGACCTCAACAGAAACTATAGTAAATCAACAGAACTTCCAGGGAAAAATG  913

Query 1259  AATCAACAATTGAACAGATAGATAAAAAATTGGAACGAAATTTAAGTTTTGAGATTAAGAAGGTCCCTCTCCAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  AATCAACAATTGAACAGATAGATAAAAAATTGGAACGAAATTTAAGTTTTGAGATTAAGAAGGTCCCTCTCCAA  987

Query 1333  GAGGGACCAAAAAGTTTTGATGGGAACACACTTTTGAATAGGGGACATGCAATTAAAATTAAATCTGCTTCACC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  GAGGGACCAAAAAGTTTTGATGGGAACACACTTTTGAATAGGGGACATGCAATTAAAATTAAATCTGCTTCACC  1061

Query 1407  TTGTATAGCTGATAAAATCTCTAAGCCACAGGAATTAAGTTCAGATCTAAATGTCGGTGATACTTCCCAGAATT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  TTGTATAGCTGATAAAATCTCTAAGCCACAGGAATTAAGTTCAGATCTAAATGTCGGTGATACTTCCCAGAATT  1135

Query 1481  CTTGTGTGGACTGCAGTGTAACACAATCAAACAAAGTTTCAGTTACTCCACCAGAAGAATCCCAGAATTCAGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  CTTGTGTGGACTGCAGTGTAACACAATCAAACAAAGTTTCAGTTACTCCACCAGAAGAATCCCAGAATTCAGAC  1209

Query 1555  ACACCTCCAAGGCCAGACCGCTTGCCTCTTGATGAGAAAGGACATGTAACGTGGTCATTTCATGGACCTGAAAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  ACACCTCCAAGGCCAGACCGCTTGCCTCTTGATGAGAAAGGACATGTAACGTGGTCATTTCATGGACCTGAAAA  1283

Query 1629  TGCCATACCCATACCTGATTTATCTGAAGGCAATTCCTCAGATATCAACTATCAAACTAGGAAAACTGTGAGTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  TGCCATACCCATACCTGATTTATCTGAAGGCAATTCCTCAGATATCAACTATCAAACTAGGAAAACTGTGAGTT  1357

Query 1703  TAACACCAAGTCCTACAACACAAGTTGAAACACCTGATCTTGTGGATCATGATAACACTTCACCACTCTTCAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  TAACACCAAGTCCTACAACACAAGTTGAAACACCTGATCTTGTGGATCATGATAACACTTCACCACTCTTCAGA  1431

Query 1777  ACACCCCTCAGTTTTACTAATCCACTTCACTCTGATGACTCAGACTCAGATGAAAGAAACTCTGATGGTGCTGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432  ACACCCCTCAGTTTTACTAATCCACTTCACTCTGATGACTCAGACTCAGATGAAAGAAACTCTGATGGTGCTGT  1505

Query 1851  GACCCAGAATAAAACTAATATTTCAACAGCAAGTGCCACAGTTTCTGCTGCCACTAGTACTGAAAGCATTTCTA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506  GACCCAGAATAAAACTAATATTTCAACAGCAAGTGCCACAGTTTCTGCTGCCACTAGTACTGAAAGCATTTCTA  1579

Query 1925  CTAGGAAAGTATTGCCAATGTCCATTGCTAGACATAATATAGCAGGAACAACACATTCAGGTGCTGAAAAAGAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580  CTAGGAAAGTATTGCCAATGTCCATTGCTAGACATAATATAGCAGGAACAACACATTCAGGTGCTGAAAAAGAT  1653

Query 1999  GTTGATGTTAGTGAAGATTCACCTCCTCCCCTACCTGAAAGAACTCCTGAATCGTTTGTGTTAGCAAGTGAACA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654  GTTGATGTTAGTGAAGATTCACCTCCTCCCCTACCTGAAAGAACTCCTGAATCGTTTGTGTTAGCAAGTGAACA  1727

Query 2073  TAATACACCTGTAAGATCGGAATGGAGTGAACTTCAAAGTCAGGAACGATCTGAACAAAAAAAGTCTGAAGGCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728  TAATACACCTGTAAGATCGGAATGGAGTGAACTTCAAAGTCAGGAACGATCTGAACAAAAAAAGTCTGAAGGCT  1801

Query 2147  TGATAACCTCTGAAAATGAGAAATGTGATCATCCAGCGGGAGGTATTCACTATGAAATGTGCATAGAATGTCCA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802  TGATAACCTCTGAAAATGAGAAATGTGATCATCCAGCGGGAGGTATTCACTATGAAATGTGCATAGAATGTCCA  1875

Query 2221  CCTACTTTCAGTGACAAGAGAGAACAAATATCAGAAAATCCAACAGAAGCCACAGATATTGGTTTTGGTAATCG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1876  CCTACTTTCAGTGACAAGAGAGAACAAATATCAGAAAATCCAACAGAAGCCACAGATATTGGTTTTGGTAATCG  1949

Query 2295  ATGTGGAAAACCCAAAGGACCAAGAGATCCACCTTCAGAATGGACA  2340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950  ATGTGGAAAACCCAAAGGACCAAGAGATCCACCTTCAGAATGGACA  1995