Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06818
• Subject: XM_017027058.1
• Aligned Length: 3400
• Identities: 3326
• Gaps: 65

Alignment

Query    1  ATGGCTGGGGCTGGCGGGG-------------------GCCTCGGGGT--CTGGG----GGAACCTGGT-----  44
            ||||        |||||||                   .||||||..|  |||||    |||  .||||     
Sbjct    1  ATGG--------GGCGGGGACCAGCCGCTCCTCCCAGCCCCTCGGCCTCACTGGGCGGAGGA--GTGGTTGAGA  64

Query   45  -GCTG------------------------CTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGGGCGCCTGCCCCCAAC  93
             ||||                        |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  GGCTGACTCCGTTTTCTCTGGGTTCCCTCCAGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGGGCGCCTGCCCCCAAC  138

Query   94  CCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCT  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  CCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCT  212

Query  168  AGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTGGAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAG  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  AGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTGGAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAG  286

Query  242  CCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGA  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  CCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGA  360

Query  316  GTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCA  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCA  434

Query  390  GACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTG  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  GACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTG  508

Query  464  AGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAACATCACCGTGGATGGACTTGAA  537
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  AGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACTAACATCACCGTGGATGGACTTGAA  582

Query  538  CCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGC  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  CCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGC  656

Query  612  CACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGG  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  CACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGG  730

Query  686  AGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCACCTACTGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAG  759
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  AGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCGACCTACTGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAG  804

Query  760  ACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTG  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  ACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTG  878

Query  834  GGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACC  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  GGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACC  952

Query  908  TGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAAC  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  TGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAAC  1026

Query  982  TCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCATACACCAACATCAC  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1027  TCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAACATCAC  1100

Query 1056  CGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCC  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  CGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCC  1174

Query 1130  GGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCC  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  GGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCC  1248

Query 1204  ATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGA  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  ATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGA  1322

Query 1278  CGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGT  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  CGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGT  1396

Query 1352  ACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCC  1425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  ACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCC  1470

Query 1426  AACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGG  1499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  AACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGG  1544

Query 1500  CCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCA  1573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  CCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCA  1618

Query 1574  CCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGG  1647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619  CCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGG  1692

Query 1648  AATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGA  1721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693  AATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGA  1766

Query 1722  AACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACT  1795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767  AACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACT  1840

Query 1796  GGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGC  1869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841  GGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGC  1914

Query 1870  AGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGCTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGA  1943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915  AGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGTTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGA  1988

Query 1944  GAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCT  2017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  GAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCT  2062

Query 2018  GTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAG  2091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063  GTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAG  2136

Query 2092  TTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGG  2165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137  TTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGG  2210

Query 2166  GCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCT  2239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211  GCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCT  2284

Query 2240  GCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCTG  2313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285  GCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCTG  2358

Query 2314  CTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAGCTC  2387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359  CTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAGCTC  2432

Query 2388  CCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTTTTG  2461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433  CCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTTTTG  2506

Query 2462  CAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTGGCTTCGGCTTCAGAGAACAAC  2535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507  CAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTGGCTTCGGCTTCAGAGAACAAC  2580

Query 2536  GCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCTGAAGCCCATCCATGAGGAGCC  2609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581  GCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCTGAAGCCCATCCATGAGGAGCC  2654

Query 2610  AGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGGAGTTCATTGCAACCCAGGGTC  2683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655  AGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGGAGTTCATTGCAACCCAGGGTC  2728

Query 2684  CCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGCCACACCCTGGTCATGCTGACC  2757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729  CCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGCCACACCCTGGTCATGCTGACC  2802

Query 2758  AACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTCGCAGCCCTGCACCCATGGGCA  2831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803  AACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTCGCAGCCCTGCACCCATGGGCA  2876

Query 2832  CCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGGAACTGCTGCTCCTCCAGGTGG  2905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877  CCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGGAACTGCTGCTCCTCCAGGTGG  2950

Query 2906  AGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCACGGCGTTCCCTCCTCCCCA  2979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2951  AGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCACGGCGTTCCCTCCTCCCCA  3024

Query 2980  GACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGGAGGGAGGCCCACCCATTGT  3053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3025  GACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGGAGGGAGGCCCACCCATTGT  3098

Query 3054  GCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTGCTCCGGCAGCTGCAGTCCG  3127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099  GCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTGCTCCGGCAGCTGCAGTCCG  3172

Query 3128  AGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTTGATGGTGCAGACTGAGGCT  3201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173  AGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTTGATGGTGCAGACTGAGGCT  3246

Query 3202  CAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCAGCCGAGAAGGAAGT  3275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3247  CAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCAGCCGAGAAGGAAGT  3320

Query 3276  CCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCCCACAAGTTGGAGGTC  3345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3321  CCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCCCACAAGTTGGAGGTC  3390