Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06818
• Subject: XM_017027061.1
• Aligned Length: 3421
• Identities: 2794
• Gaps: 620

Alignment

Query    1  ATGGCTGGGGCTGGCGGGG-------------------GCCTCGGGGT--CTGGG----GGAACCTGGT-----  44
            ||||        |||||||                   .||||||..|  |||||    |||  .||||     
Sbjct    1  ATGG--------GGCGGGGACCAGCCGCTCCTCCCAGCCCCTCGGCCTCACTGGGCGGAGGA--GTGGTTGAGA  64

Query   45  -GCTG------------------------CTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGGGCGCCT---------  84
             ||||                        |.||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct   65  GGCTGACTCCGTTTTCTCTGGGTTCCCTCCAGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGGGCGCCTGACCTTCCT  138

Query   85  ------------GCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAG  146
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  TCCCAATTCTCAGCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAG  212

Query  147  CTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTGGAGACGGCGGCACAA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  CTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTGGAGACGGCGGCACAA  286

Query  221  CAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCT  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  CAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCT  360

Query  295  GTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAG  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAG  434

Query  369  GAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGACGGCCCAGACCCAC  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  GAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGACGGCCCAGACCCAC  508

Query  443  AGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAAC  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  509  AGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACTAAC  582

Query  517  ATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAG  590
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  583  ATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGA-----------------  639

Query  591  CTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCA  664
                                                                                      
Sbjct  640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query  665  GCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCACCTACTGCGTTCAGTGCACT  738
                                                                                      
Sbjct  640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query  739  GGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTC  812
                                                                                      
Sbjct  640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query  813  ATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAG  886
                                                                                      
Sbjct  640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query  887  CTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCC  960
                                                                                      
Sbjct  640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query  961  GATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAG  1034
                                                                                      
Sbjct  640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 1035  CACAGCATACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGA  1108
                                                                                     |
Sbjct  640  -------------------------------------------------------------------------A  640

Query 1109  AGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATG  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  AGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATG  714

Query 1183  GAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTA  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  715  GAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTA  788

Query 1257  CTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGA  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  CTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGA  862

Query 1331  GACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAAT  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  GACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAAT  936

Query 1405  GTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTT  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  937  GTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTT  1010

Query 1479  GCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGA  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  GCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGA  1084

Query 1553  CTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCAC  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085  CTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCAC  1158

Query 1627  CTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGA  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159  CTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGA  1232

Query 1701  GGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCC  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233  GGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCC  1306

Query 1775  ACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCG  1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307  ACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCG  1380

Query 1849  AATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGCTGTA  1922
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1381  AATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGTTGTA  1454

Query 1923  CAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAG  1996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455  CAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAG  1528

Query 1997  ACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAG  2070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529  ACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAG  1602

Query 2071  GGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGC  2144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603  GGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGC  1676

Query 2145  TGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGG  2218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677  TGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGG  1750

Query 2219  TCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTG  2292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751  TCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTG  1824

Query 2293  TTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACT  2366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1825  TTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACT  1898

Query 2367  CAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGA  2440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1899  CAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGA  1972

Query 2441  GGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTG  2514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973  GGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTG  2046

Query 2515  GCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCT  2588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2047  GCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCT  2120

Query 2589  GAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGG  2662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2121  GAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGG  2194

Query 2663  AGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGC  2736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195  AGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGC  2268

Query 2737  CACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTC  2810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269  CACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTC  2342

Query 2811  GCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGG  2884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2343  GCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGG  2416

Query 2885  AACTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGAT  2958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417  AACTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGAT  2490

Query 2959  CACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCAT  3032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491  CACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCAT  2564

Query 3033  GGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCC  3106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565  GGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCC  2638

Query 3107  TGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCG  3180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639  TGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCG  2712

Query 3181  TTGATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCA  3254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713  TTGATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCA  2786

Query 3255  GGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGG  3328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2787  GGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGG  2860

Query 3329  CCCACAAGTTGGAGGTC  3345
            |||||||||||||||||
Sbjct 2861  CCCACAAGTTGGAGGTC  2877