Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06818
- Subject:
- XM_017027062.1
- Aligned Length:
- 3345
- Identities:
- 2781
- Gaps:
- 561
Alignment
Query 1 ATGGCTGGGGCTGGCGGGGGCCTCGGGGTCTGGGGGAACCTGGTGCTGCTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAGGGCGCCTGCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTGGAGACGGCGGCACAACA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGACGGCCCAGACCCACAG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAACAT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAGCT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------ATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAGCT 31
Query 593 CCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCAGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 CCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCAGC 105
Query 667 TCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCACCTACTGCGTTCAGTGCACTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 TCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCGACCTACTGCGTTCAGTGCACTGG 179
Query 741 AGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 AGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCAT 253
Query 815 TGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAGCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254 TGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAGCT 327
Query 889 CCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328 CCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGA 401
Query 963 TGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 TGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCA 475
Query 1037 CAGCATACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGAAG 1110
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 CAGCACACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGAAG 549
Query 1111 AATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 AATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATGGA 623
Query 1185 GACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTACT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624 GACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTACT 697
Query 1259 GGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGAGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 698 GGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGAGA 771
Query 1333 CTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAATGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772 CTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAATGT 845
Query 1407 CAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTTGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 846 CAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTTGC 919
Query 1481 GCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGACT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 920 GCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGACT 993
Query 1555 GACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCACCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 994 GACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCACCT 1067
Query 1629 CACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 CACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGAGG 1141
Query 1703 TCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCCAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 TCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCCAC 1215
Query 1777 TCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCGAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 TCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCGAA 1289
Query 1851 TTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGCTGTACA 1924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1290 TTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGTTGTACA 1363
Query 1925 ATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAGAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364 ATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAGAC 1437
Query 1999 ACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAGGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 ACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAGGG 1511
Query 2073 AGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGCTG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512 AGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGCTG 1585
Query 2147 TGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGGTC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1586 TGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGGTC 1659
Query 2221 GTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTGTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 GTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTGTT 1733
Query 2295 TCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACTCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734 TCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACTCA 1807
Query 2369 GGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1808 GGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGG 1881
Query 2443 GACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTGGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1882 GACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTGGC 1955
Query 2517 TTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCTGA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1956 TTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCTGA 2029
Query 2591 AGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGGAG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030 AGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGGAG 2103
Query 2665 TTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGCCA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2104 TTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGCCA 2177
Query 2739 CACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTCGC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2178 CACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTCGC 2251
Query 2813 AGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGGAA 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2252 AGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGGAA 2325
Query 2887 CTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2326 CTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCA 2399
Query 2961 CGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 CGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGG 2473
Query 3035 AGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2474 AGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTG 2547
Query 3109 CTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2548 CTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTT 2621
Query 3183 GATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGG 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2622 GATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGG 2695
Query 3257 CCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696 CCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCC 2769
Query 3331 CACAAGTTGGAGGTC 3345
|||||||||||||||
Sbjct 2770 CACAAGTTGGAGGTC 2784