Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06818
• Subject: XR_001753730.1
• Aligned Length: 3972
• Identities: 3326
• Gaps: 637

Alignment

Query    1  ---------------ATGGCTGGGGCTGGCGGGG-------------------GCCTCGGGGT--CTGGG----  34
                           ||||        |||||||                   .||||||..|  |||||    
Sbjct    1  ATGCAAGGGTGACTCATGG--------GGCGGGGACCAGCCGCTCCTCCCAGCCCCTCGGCCTCACTGGGCGGA  66

Query   35  GGAACCTGGT------GCTG------------------------CTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGG  78
            |||  .||||      ||||                        |.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  GGA--GTGGTTGAGAGGCTGACTCCGTTTTCTCTGGGTTCCCTCCAGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGG  138

Query   79  GCGCCT---------------------GCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAG  131
            ||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  GCGCCTGACCTTCCTTCCCAATTCTCAGCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAG  212

Query  132  CTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTG  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  CTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTG  286

Query  206  GAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCA  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  GAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCA  360

Query  280  TTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGC  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGC  434

Query  354  TCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCG  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  TCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCG  508

Query  428  ACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGC  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  ACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGC  582

Query  502  ACAGCACACACCAACATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAA  575
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  ACAGCACACACTAACATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAA  656

Query  576  GAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGG  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  GAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGG  730

Query  650  AGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCACCTAC  723
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  731  AGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCGACCTAC  804

Query  724  TGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGG  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  TGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGG  878

Query  798  CCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTG  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  CCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTG  952

Query  872  TCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTG  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  TCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTG  1026

Query  946  ACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAG  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  ACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAG  1100

Query 1020  AGCAGGGACTCGAAGCACAGCATACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTT  1093
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  AGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTT  1174

Query 1094  CCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTG  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  CCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTG  1248

Query 1168  AGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCC  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  AGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCC  1322

Query 1242  TCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCA  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  TCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCA  1396

Query 1316  GTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGT  1389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  GTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGT  1470

Query 1390  GGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAA  1463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  GGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAA  1544

Query 1464  CAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGG  1537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  CAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGG  1618

Query 1538  TCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCT  1611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619  TCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCT  1692

Query 1612  GGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGC  1685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693  GGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGC  1766

Query 1686  CACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGG  1759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767  CACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGG  1840

Query 1760  CCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGG  1833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841  CCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGG  1914

Query 1834  CAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGA  1907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915  CAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGA  1988

Query 1908  ACCCGGGACGCTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTG  1981
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  ACCCGGGACGTTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTG  2062

Query 1982  CGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATC  2055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063  CGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATC  2136

Query 2056  TGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATC  2129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137  TGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATC  2210

Query 2130  TTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCT  2203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211  TTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCT  2284

Query 2204  GGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTT  2277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285  GGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTT  2358

Query 2278  GTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCA  2351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359  GTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCA  2432

Query 2352  GCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACG  2425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433  GCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACG  2506

Query 2426  TCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGC  2499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507  TCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGC  2580

Query 2500  CAGTCTCAGATGGTGGCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTG  2573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581  CAGTCTCAGATGGTGGCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTG  2654

Query 2574  GTCCCGGGTGCCCCTGAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTC  2647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655  GTCCCGGGTGCCCCTGAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTC  2728

Query 2648  TCTGGAGCCCCCAGGAGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTG  2721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729  TCTGGAGCCCCCAGGAGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTG  2802

Query 2722  TGGGAACAGCAGAGCCACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTA  2795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803  TGGGAACAGCAGAGCCACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTA  2876

Query 2796  CTGGCCTCTGGACTCGCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGA  2869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877  CTGGCCTCTGGACTCGCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGA  2950

Query 2870  ACTGGACGGTGCGGGAACTGCTGCTCC--------------------------TCCAGGTGGAGGAGCAGAAGA  2917
            |||||||||||||||||||||||||||                          |||||||||||||||||||||
Sbjct 2951  ACTGGACGGTGCGGGAACTGCTGCTCCTCCAGAGCCTGTGAGTGCTCCCTCCTTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGA  3024

Query 2918  CACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTG  2991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3025  CACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTG  3098

Query 2992  GCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGC  3065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099  GCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGC  3172

Query 3066  TGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTG  3139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173  TGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTG  3246

Query 3140  GGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTTGATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTC  3213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3247  GGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTTGATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTC  3320

Query 3214  CTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGA  3287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3321  CTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGA  3394

Query 3288  TGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCCCACAAGTTGGAGGTC----------------  3345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 3395  TGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCCCACAAGTTGGAGGTCTAAGTGACGAGGGGGC  3468

Query 3346  --------------------------------------------------------------------------  3345
                                                                                      
Sbjct 3469  TGGGTCGGCAGCCCAGGCATCCTCAAGCTCTGGACACCCACTTGAGCCCAGATTCCTGGAAGAGCAGAGGGCTG  3542

Query 3346  --------------------------------------------------------------------------  3345
                                                                                      
Sbjct 3543  GGCTCCCAGACTCCTGGGTGCTGTGGGAGGAGGGGGCTGGTATCCCAAACTCTGGTTTCCCCAGGAGAGAGTGG  3616

Query 3346  --------------------------------------------------------------------------  3345
                                                                                      
Sbjct 3617  TCTGGTGGGCTTCAGATGAGTCCTATGGGAGCTGGGGATCTGGATTCCTGGTTCCCTGAAGGAGGAGAGGGATG  3690

Query 3346  --------------------------------------------------------------------------  3345
                                                                                      
Sbjct 3691  ATAGCTTGGATTCCCTAGGTCTTTCCAGGATGCAGAAAGAAACAGGCTGGGGCCTGGATTCTGAGGCAGGAAGG  3764

Query 3346  --------------------------------------------------------------------------  3345
                                                                                      
Sbjct 3765  AATTTGGGTCTGGAGTTCTGGCTACTTGAGGACCAAAGGCAGGAAGGATCCTGCCTTGATTTTACTTCAGAAAC  3838

Query 3346  --------------------------------------------------------------------------  3345
                                                                                      
Sbjct 3839  CAAATCAGTCTTCTATAATCTGGGGTCGGAGGGAGTCCCTGTGCCCAAGGTCTCTCTGCACCCCACCATCCACA  3912

Query 3346  --------------------------------------------------  3345
                                                              
Sbjct 3913  TGTATTTTTCCTTCTATCCCATAATTTATTAAATCACTGTTCTCCCCAGA  3962