Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06839
- Subject:
- XM_006520646.3
- Aligned Length:
- 1915
- Identities:
- 1521
- Gaps:
- 158
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCAGTGGGGTGTTCCTTGGGATGGATGACCTGGATCCCATAGCCATCTGTAGCCTGTTTGAGGAGTGGGA 74
Query 1 ----------------------------------------------------------------------ATGG 4
||||
Sbjct 75 CCCTCAGACAGAGCGCTGCCAAGATGATCCGCCAGTTTACAGACCTGCAGGGGAGCCCGCCACTGCAGCCATGG 148
Query 5 CCTCGGAAGACATTGCCAAGCTGGCAGAGACACTTGCCAAGACTCAGGTGGCCGGGGGACAGCTGAGTTTCAAA 78
||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 149 CCTCTGAAGACATTGCCAAACTGGCAGAGACCCTGGCTAAAACTCAGGTAGCCGGAGGGCAGCTGAGTTTTAAG 222
Query 79 GGCAAGAGCCTCAAACTCAACACTGCAGAAGATGCTAAAGATGTGATTAAAGAGATTGAAGACTTTGACAGCTT 152
||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||.|
Sbjct 223 GGCAAGGGTCTCAAACTAAATACTGCAGAAGATGCTAAAGATGTGATTAAGGAGATTGAAGAGTTTGACGGCCT 296
Query 153 GGAGGCTCTGCGTCTGGAAGGCAACACAGTGGGCGTGGAAGCAGCCAGGGTCATCGCCAAGGCCTTAGAGAAGA 226
.||.|||||.||..||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGAAGCTCTACGATTGGAGGGCAACACGGTGGGCGTGGAAGCGGCCAGAGTCATCGCCAAGGCCTTAGAGAAGA 370
Query 227 AGTCGGAGTTGAAGCGCTGCCACTGGAGTGACATGTTCACGGGAAGGCTGCGGACCGAGATCCCACCAGCCCTG 300
||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||
Sbjct 371 AGTCTGAGCTGAAGCGATGCCACTGGAGTGACATGTTCACAGGAAGGCTTCGGTCTGAGATCCCACCAGCTCTG 444
Query 301 ATCTCACTAGGGGAAGGACTCATCACAGCTGGGGCTCAGCTGGTGGAGCTGGACTTAAGCGACAACGCATTCGG 374
||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||.||
Sbjct 445 ATCTCACTAGGGGAGGGACTCATCACTGCAGGAGCACAGCTGGTGGAACTGGACCTCAGTGACAACGCATTTGG 518
Query 375 GCCCGACGGTGTGCAAGGCTTCGAGGCCCTGCTCAAGAGCTCAGCCTGCTTCACCCTGCAGGAACTCAAGCTCA 448
.|||||.||.||||.|||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 ACCCGATGGAGTGCGAGGCTTCGAGGCCCTCCTCAAGAGCCCAGCCTGCTTCACCCTACAGGAACTCAAGCTTA 592
Query 449 ACAACTGTGGCATGGGCATTGGCGGCGGCAAGATCCTGGCTGCAGCTCTGACCGAATGTCACCGGAAATCCAGT 522
|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||
Sbjct 593 ACAACTGTGGCATGGGCATCGGGGGTGGCAAGATTCTGGCAGCAGCTCTGACTGAGTGTCACCGCAAGTCCAGT 666
Query 523 GCCCAAGGCAAGCCTCTGGCCCTGAAGGTCTTTGTGGCTGGCAGAAACCGTCTGGAGAATGATGGCGCCACTGC 596
||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 667 GCCCAAGGCAAGCCCCTGGCCCTGAAGGTGTTTGTGGCTGGCAGAAATCGCCTGGAGAATGACGGAGCCACTGC 740
Query 597 CTTGGCAGAAGCTTTTAGGGTCATCGGGACCCTGGAGGAGGTCCACATGCCACAGAATGGGATCAACCACCCTG 670
..||||||||||||||.||.||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 741 ACTGGCAGAAGCTTTTGGGATCATCGGGACTCTGGAAGAGGTGCATATGCCACAGAACGGAATTAACCATCCTG 814
Query 671 GCATCACTGCCCTGGCCCAGGCTTTCGCTGTCAACCCCCTGCTGCGGGTCATCAACCTGAATGACAACACCTTC 744
|..||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 GTGTCACAGCCCTGGCCCAGGCCTTTGCCATCAACCCCCTGTTGCGAGTCATCAACCTAAATGACAACACCTTC 888
Query 745 ACTGAGAAGGGCGCCGTGGCCATGGCCGAGACCTTGAAGACCTTGCGGCAGGTGGAGGTGATTAATTTTGGGGA 818
|||||||||||.|..|||||||||||.|||||..|||||||..||||.||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 889 ACTGAGAAGGGTGGGGTGGCCATGGCTGAGACTCTGAAGACTCTGCGACAAGTGGAAGTGATCAATTTTGGAGA 962
Query 819 CTGCCTGGTGCGCTCCAAGGGTGCAGTTGCCATTGCAGATGCCATCCGCGGCGGCCTGCCCAAGCTAAAGGAGC 892
|||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||..||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGCCTGGTGCGCTCTAAGGGTGCCGTTGCCATCGCAGATGCTGTCCGTGGTGGCCTGCCCAAGCTAAAGGAGC 1036
Query 893 TGAACTTGTCATTCTGTGAAATCAAGAGGGATGCTGCCCTGGCTGTTGCTGAGGCCATGGCAGACAAAGCTGAG 966
||||..||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||..||||.|||||.||||||
Sbjct 1037 TGAATCTGTCGTTCTGCGAAATCAAGAGAGATGCTGCCCTGGTTGTTGCTGAGGCTGTGGCCGACAAGGCTGAG 1110
Query 967 CTGGAGAAGCTGGACCTGAATGGCAACACCCTGGGAGAAGAAGGCTGTGAACAGCTTCAGGAGGTGCTGGAGGG 1040
|||||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||..|
Sbjct 1111 CTGGAGAAGCTGGACCTCAATGGCAATGCCCTCGGAGAAGAGGGCTGTGAGCAGCTTCAGGAGGTGATGGACAG 1184
Query 1041 CTTCAACATGGCCAAGGTGCTGGCGTCCCTCAGTGATGA------CGAGGACGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGAG 1108
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||| .|||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1185 CTTCAATATGGCCAAGGTGCTGGCATCCCTCAGTGATGATGAGGGAGAGGATGAAGATGAGGAGGAAGAAGGAG 1258
Query 1109 AAGAG---GAAGAAGAGGAAGCAGAAGAAGAGGAGGAGGAAGATGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAG 1179
||||| ||.||.|||||.|.|||.||||||||.|||||||||||.||.|||||| ||.||||||.|||||
Sbjct 1259 AAGAGGATGATGAGGAGGAGGAAGATGAAGAGGATGAGGAAGATGATGATGAGGAG---GAGGAGGAGCAGGAG 1329
Query 1180 GAGGAAGAAGAGCCTCAGCAGCGAGGG-CAGGGAGAGAAGTCAGCCACGCCCTCACGGAAGATTCTGGACCCTA 1252
||.||.||||||||||.||||.||||| ||||| |||.||.|.||.||.|||||..|||||||.||||||||||
Sbjct 1330 GAAGAGGAAGAGCCTCCGCAGAGAGGGTCAGGG-GAGGAGCCGGCTACACCCTCGAGGAAGATCCTGGACCCTA 1402
Query 1253 ACACTGGGGAGCCAGCTCCCGTGCTGTCCTCCCCACCTCCTGCAGACGTCTCCACCTTCCTGGCTTTTCCCTCT 1326
|||.||||||||||||||||||||||||||||||..||||..|||||.||||||||||||||.|.||.|||||.
Sbjct 1403 ACAGTGGGGAGCCAGCTCCCGTGCTGTCCTCCCCGACTCCCACAGACCTCTCCACCTTCCTGTCATTCCCCTCC 1476
Query 1327 CCAGAGAAGCTGCTGCGCCTAGGGCCCAAGAGCTCCGTGCTGATAGCCCAGCAGACTGACACGTCTGACCCCGA 1400
|||||||||||||||||.||.||.||||||..|||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1477 CCAGAGAAGCTGCTGCGTCTGGGTCCCAAGGTCTCGGTGCTGATAGTCCAGCAGACTGATACCTCCGACCCAGA 1550
Query 1401 GAAGGTGGTCTCTGCCTTCCTAAAGGTGTCATCTGTGTTCAAGGACGAAGCTACTGTGAGGATGGCAGTGCAGG 1474
||||||.||.||.||||||||.||||||.||||||||||||.|||.||.||..|.||.|.||..|||||||.||
Sbjct 1551 GAAGGTTGTTTCAGCCTTCCTGAAGGTGGCATCTGTGTTCAGGGATGACGCCTCAGTAAAGACCGCAGTGCTGG 1624
Query 1475 ATGCAGTAGATGCCCTGATGCAGAAGGCTTTCAACTCCTCGTCCTTCAACTCCAACACCTTCCTCACCAGGCTC 1548
||||..|.||||||||.|||.|||||||.||||.||.|||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1625 ATGCCATCGATGCCCTCATGAAGAAGGCCTTCAGCTGCTCCTCTTTCAATTCCAACACCTTCCTTACCAGGCTG 1698
Query 1549 CTCGTGCACATGGGTCTGCTCAAGAGTGAAGACAAGGTCAAGGCCATTGCCAACCTGTACGGCCCCCTGATGGC 1622
|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||.||||.|.|||||||||||||.
Sbjct 1699 CTCATCCACATGGGTCTGCTCAAGAGTGAAGACAAGATCAAGGCCATACCCAGCCTGCATGGCCCCCTGATGGT 1772
Query 1623 GCTGAACCACATGGTGCAGCAGGACTATTTCCCCAAGGCCCTTGCACCCCTGCTGCTGGCGTTCGTGACCAAGC 1696
|.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||.||||
Sbjct 1773 GTTGAACCACGTGGTGAGGCAGGACTATTTCCCCAAGGCCCTTGCACCCCTGCTCTTGGCATTTGTGACAAAGC 1846
Query 1697 CCAACAGCGCCCTGGAATCCTGCTCCTTCGCCCGCCACAGTCTGCTGCAGACGCTGTACAAGGTC 1761
||||..||||.||||||.||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|||||..||
Sbjct 1847 CCAATGGCGCGCTGGAAACCTGCTCCTTTGCCCGCCACAATCTGCTGCAGACGCTATACAACATC 1911