Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06848
• Subject: NM_001193273.2
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1229
• Gaps: 384

Alignment

Query    1  ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGGCAGAACTATCCAGAGGAAGCTGATGGAACTTTGGATTGTATCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGGCTTTGACTTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCAGTTGGCTGTAATGATGGCCGAATTGTCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTGGGATTTCTTGACAAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTGTGTTCTTTATGCTGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGCCGAGATGGTCATAAACTCGTGAGTGCTTCCACTGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGCGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTGTGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCACGAGATCAGAACAAGGTTC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCAGTGGAC  444
                       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  -----------ATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCGGTGGAC  63

Query  445  GATGACTCCGATTTGAACGTTGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACGGGAAACGCAAAAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  GATGACTCCGATTTGAACGTTGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACGGGAAACGCAAAAGG  137

Query  519  CAAGATTTTGGTCCTAAAAACAGATTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTGACAACTGGAACAAGCAATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  CAAGATTTTGGTCCTAAAAACAGATTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTGACAACTGGAACAAGCAATA  211

Query  593  CCACAGCCATTAAGTCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTTTTAATTAACACGGCAGATCGAATAATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  CCACAGCCATTAAGTCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTTTTAATTAACACGGCAGATCGAATAATC  285

Query  667  AGAGTTTATGATGGCAGAGAAATCTTAACATGTGGAAGAGATGGAGAGCCTGAACCTATGCAGAAATTGCAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  AGAGTTTATGATGGCAGAGAAATCTTAACATGTGGAAGAGATGGAGAGCCTGAACCTATGCAGAAATTGCAGGA  359

Query  741  TTTGGTGAATAGGACCCCATGGAAGAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAATACATCGTGGCAGGTTCTGCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  TTTGGTGAATAGGACCCCATGGAAGAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAATACATCGTGGCAGGTTCTGCCC  433

Query  815  GGCAGCATGCCCTGTACATCTGGGAGAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATTCTCCATGGGACGAGAGGAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  GGCAGCATGCCCTGTACATCTGGGAGAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATTCTCCATGGGACGAGAGGAGAA  507

Query  889  CTCCTCTTGGATGTAGCTTGGCATCCTGTTCGACCCATCATAGCATCCATTTCCAGTGGAGTGGTATCTATCTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  CTCCTCTTGGATGTAGCTTGGCATCCTGTTCGACCCATCATAGCATCCATTTCCAGTGGAGTGGTATCTATCTG  581

Query  963  GGCACAGAATCAAGTAGAAAACTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAATTGGATGAAAATGTAGAATACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  GGCACAGAATCAAGTAGAAAACTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAATTGGATGAAAATGTAGAATACG  655

Query 1037  AAGAAAGGGAATCAGAGTTTGATATTGAAGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAGACAGGGGCTGATGCTGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  AAGAAAGGGAATCAGAGTTTGATATTGAAGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAGACAGGGGCTGATGCTGCA  729

Query 1111  GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGACCCTATTGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGACCCTATTGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA  803

Query 1185  TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCAGAAGAAAATCCTTACGGCCCCCCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCAGAAGAAAATCCTTACGGCCCCCCAC  877

Query 1259  CGGATGCAGTCCAAACCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCCTCAGCAGATGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  CGGATGCAGTCCAAACCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCCTCAGCAGATGGG  951

Query 1333  TCCCAGCCACCTAAGAAGAAACCCAAAACAACCAATATAGAACTTCAAGGAGTACCAAATGATGAAGTCCATCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  952  TCCCAGCCACCTAAGAAGAAACCCAAAACAACCAATATAGAACTTCAAGGAGTACCAAATGATGAAGTCCATCC  1025

Query 1407  ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG  1099

Query 1481  AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAGCGAAGGGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAGCGAAGGGT  1173

Query 1555  AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGCCCTTGACAGCAGGAGGAGCAATCTCAGAACTGTTA  1614
            |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGCCCTTGA---CAGGAGGAGCAATCTCAGAACTGTTA  1230