Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06854
- Subject:
- NM_008938.1
- Aligned Length:
- 1038
- Identities:
- 908
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCGCTACTGAAAGTCAAGTTTGACCAGAAGAAGCGGGTCAAGTTGGCCCAAGGGCTCTGGCTCATGAACTG 74
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCTGCTCAAAGTCAAGTTTGACCAGAAGAAGCGGGTCAAGTTGGCCCAGGGGCTCTGGCTTATGAACTG 74
Query 75 GTTCTCCGTGTTGGCTGGCATCATCATCTTCAGCCTAGGACTGTTCCTGAAGATTGGACTCCGAAAGAGGAGCG 148
|.|.|||||||||||.||||||.||.||||||||.|.||.||||||.|||||||||.|||.||.||||||||||
Sbjct 75 GCTGTCCGTGTTGGCCGGCATCGTCCTCTTCAGCTTGGGGCTGTTCTTGAAGATTGAACTTCGCAAGAGGAGCG 148
Query 149 ATGTGATGAATAATTCTGAGAGCCATTTTGTGCCCAACTCATTGATAGGGATGGGGGTGCTATCCTGTGTCTTC 222
|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||.|||||||.||.||||||||||||
Sbjct 149 AAGTGATGAATAATTCTGAGAGCCACTTTGTGCCCAACTCCCTGATAGGGGTGGGGGTCCTGTCCTGTGTCTTC 222
Query 223 AACTCGCTGGCTGGGAAGATCTGCTACGACGCCCTGGACCCAGCCAAGTATGCCAGATGGAAGCCCTGGCTGAA 296
|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||
Sbjct 223 AACTCTCTGGCTGGGAAGATCTGCTATGATGCCCTGGACCCGGCCAAGTACGCCAAGTGGAAGCCCTGGCTGAA 296
Query 297 GCCGTACCTGGCTATCTGTGTCCTCTTCAACATCATCCTCTTCCTTGTGGCTCTCTGCTGCTTTCTGCTTCGGG 370
|||||||||||||.||||..||.||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 297 GCCGTACCTGGCTGTCTGCATCTTCTTTAACGTCATCCTCTTCCTGGTGGCTCTCTGCTGCTTTCTGTTGCGGG 370
Query 371 GCTCGCTGGAGAACACCCTGGGCCAAGGGCTCAAGAACGGCATGAAGTACTACCGGGACACAGACACCCCTGGC 444
||||.|||||||.||||||||...|.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct 371 GCTCCCTGGAGAGCACCCTGGCTTACGGACTCAAGAATGGGATGAAGTATTATCGGGATACGGACACCCCCGGC 444
Query 445 AGGTGTTTCATGAAGAAGACCATCGACATGCTGCAGATCGAGTTCAAATGCTGCGGCAACAACGGTTTTCGGGA 518
.||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 445 CGGTGCTTCATGAAAAAGACCATCGACATGCTCCAGATTGAGTTCAAGTGCTGTGGGAACAACGGCTTCCGGGA 518
Query 519 CTGGTTTGAGATTCAGTGGATCAGCAATCGCTACCTGGACTTTTCCTCCAAAGAAGTCAAAGATCGAATCAAGA 592
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 519 CTGGTTCGAGATTCAGTGGATCAGCAATCGCTACCTGGACTTCTCCTCCAAGGAGGTCAAAGATCGCATCAAGA 592
Query 593 GCAACGTGGATGGGCGGTACCTGGTGGACGGCGTCCCTTTCAGCTGCTGCAATCCTAGCTCGCCACGGCCCTGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 593 GCAACGTGGATGGGCGGTACCTGGTGGACGGCGTCCCTTTCAGCTGCTGCAACCCCAGCTCCCCGCGGCCCTGT 666
Query 667 ATCCAGTATCAGATCACCAACAACTCAGCACACTACAGTTACGACCACCAGACGGAGGAGCTCAACCTGTGGGT 740
||||||||.|||.|||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 667 ATCCAGTACCAGCTCACCAACAACTCGGCGCACTACAGCTATGACCATCAGACTGAGGAGCTCAACCTCTGGCT 740
Query 741 GCGTGGCTGCAGGGCTGCCCTGCTGAGCTACTACAGCAGCCTCATGAACTCCATGGGTGTCGTCACGCTCCTCA 814
|||.|||||||||||.||.|||||||..||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||.
Sbjct 741 GCGGGGCTGCAGGGCCGCTCTGCTGAATTACTACAGCAGCCTCATGAATTCCATGGGCGTCGTCACACTTCTCG 814
Query 815 TTTGGCTCTTCGAGGTGACCATTACAATTGGGCTGCGCTACCTACAGACGTCGCTGGATGGTGTGTCCAACCCC 888
|.||||||||.|||||||.|||.||....||.||.||||||||.||.||..|||||||..|||||||.|||||.
Sbjct 815 TCTGGCTCTTTGAGGTGAGCATCACTGCCGGACTCCGCTACCTCCACACAGCGCTGGAGAGTGTGTCTAACCCG 888
Query 889 GAGGAATCTGAGAGCGAGAGCGAGGGCTGGCTGCTGGAGAAGAGCGTGCCGGAGACCTGGAAGGCCTTTCTGGA 962
|||||..|.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGGACCCCGAGTGTGAGAGTGAGGGCTGGCTGCTGGAGAAGAGCGTGCCCGAGACCTGGAAGGCCTTTCTGGA 962
Query 963 GAGTGTGAAGAAGCTGGGCAAGGGCAACCAGGTGGAAGCCGAGGGCGCAGGCGCAGGCCAGGCCCCAGAGGCTG 1036
|||..|.|||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.||.||||.||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 963 GAGCTTTAAGAAGCTGGGCAAGAGCAATCAGGTGGAGGCTGAAGGTGCAGACGCAGGCCCGGCTCCAGAGGCTG 1036
Query 1037 GC 1038
||
Sbjct 1037 GC 1038