Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06863
• Subject: NM_001199003.1
• Aligned Length: 1471
• Identities: 1265
• Gaps: 71

Alignment

Query    1  ATGGCCCAGGGGAATAATTATGGGCAGACCAGCAACGGGGTGGCCGATGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG  74
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTCAGGGAAATAATTATGGACAGACCAGCAACGGGGTGGCGGACGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG  74

Query   75  AAAGATGGAAGACGTCATAGCACGGATGCAAGATGAAAAAAATGGAATTCCTATTCGTACGGTCAAAAGCTTTC  148
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  AAAGATGGAAGATGTCATAGCACGTATGCAAGACGAGAAAAACGGAATTCCCATCCGTACCGTCAAAAGCTTCC  148

Query  149  TTTCCAAGATACCTAGCGTCTTCTCTGGTTCAGACATTGTTCAATGGTTGATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT  222
            ||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTCCAAGATCCCCAGTGTGTTCTCCGGGTCAGACATTGTTCAATGGTTAATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT  222

Query  223  CCAGTGGAGGCGCTCCATTTGGGAACATTAATGGCTGCCCACGGCTACTTCTTTCCAATCTCAGATCATGTCCT  296
            |||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAGTGGAGGCTCTCCATTTGGGAACGCTAATGGCTGCCCATGGCTACTTCTTTCCCATCTCAGATCATGTCCT  296

Query  297  CACACTCAAGGATGATGGCACCTTTTACCGGTTTCAAACCCCCTATTTTTGGCCATCAAATTGTTGGGAGCCGG  370
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CACACTCAAGGATGACGGCACCTTCTACCGGTTTCAAACACCCTATTTTTGGCCGTCAAATTGTTGGGAGCCAG  370

Query  371  AAAACACAGATTATGCCGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCACGACTGGAGCTCGCAGACTAT  444
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||
Sbjct  371  AAAACACAGACTATGCTGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCAAGGCTAGAGCTAGCAGATTAT  444

Query  445  GAGGCTGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTCATGCAAGCAGAAGC  518
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGCCGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTTATGCAAGCAGAAGC  518

Query  519  ACAAGCAAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAGATTGAAAGGAAGATCCTTGACAGCCAAGAGAGAGCGTTCTGGG  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  519  ACAAGCTAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAAATTGAAAGGAAGATCCTCGATAGTCAAGAGAGAGCATTCTGGG  592

Query  593  ACGTGCACAGGCCCGTGCCTGGATGTGTAAATACAACTGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCAGAATGAGAAAC  666
            |.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  593  ATGTCCACAGGCCTGTGCCTGGATGTGTAAATACTACAGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCCGGATGAGAAAC  666

Query  667  CCCCACAAAACACGGAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGATATTAGAAGTCACAGTCCTACCCACACACCCAC  740
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  667  CCACACAAAACACGAAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGACATCCGAAGTCACAGTCCCACCCACACACCTAC  740

Query  741  ACCAGAAACTAAACCTCCAACAGAAGATGAGTTACAACAACAGATAAAATATTGGCAAATACAGTTAGATAGAC  814
            |||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCAGAAACCAAGCCTCCTACAGAAGATGAGCTGCACCAACAGATAAAATACTGGCAAATACAGTTAGATAGAC  814

Query  815  ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTCGCTGACAGTCTACTAAGTTACACGGAACAGTATTTAGAATACGACCCGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct  815  ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTTGCTGATAGTCTACTAAGCTATACGGAACAGTATGTAGAATATGACCCGTTT  888

Query  889  CTTTTGCCACCTGACCCTTCTAACCCATGGCTGTCCGATGACACCACTTTCTGGGAACTTGAGGCAAGCAAAGA  962
            |||.||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  CTTGTGCCGCCTGACCCTTCCAATCCATGGCTCTCAGATGATACGACTTTCTGGGAACTTGAAGCAAGCAAAGA  962

Query  963  ACCGAGCCAGCAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGCATGGACGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGAGAGAAC  1036
            |||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct  963  ACCAAGTCAACAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGTATGGATGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGCGAGAGC  1036

Query 1037  AGTTCCTTAAATTTCTAGAGTCAGAATTCAGCTCGGAAAATTTAAGATTCTGGCTGGCAGTGGAGGACCTGAAA  1110
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  AGTTCCTTAAGTTTCTAGAATCAGAATTCAGCTCAGAGAACTTAAGGTTCTGGTTGGCAGTGGAGGACCTGAAG  1110

Query 1111  AAGAGGCCTATTAAAGAAGTACCCTCAAGAGTTCAGGAAATATGGCAAGAGTTTCTGGCTCCCGGAGCCCCCAG  1184
            |..||||||||...|||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1111  AGAAGGCCTATCCGAGAGGTCCCCTCGAGAGTGCAGGAAATATGGCAAGAATTTCTGGCTCCTGGGGCCCCCAG  1184

Query 1185  TGCTATTAACTTGGATTCCAAGAGTTATGACAAAACCACACATAACGTGAAGGAACCTGGACGATACACATTTG  1258
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCATTAACTTGGATTCTAAGAGTTATGACAAGACCACACAGAATGTGAAGGAACCAGGACGATACACATTTG  1258

Query 1259  AAGATGCTCAGGAGCACATTTACAAACTGATGAAAAGTGATTCATACCCACGTTTTATAAGATCCAGTGCCTAT  1332
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1259  AAGATGCTCAGGAGCATATTTACAAGCTGATGAAGAGCGACTCATACCCCCGCTTTATAAGATCTAGTGCCTAC  1332

Query 1333  CAGGAGCTTCTACAGGCAAAGAAAAA-----GTCTGGAAA-----CTCAATGGATCGCAGAACATCTTTTGAAA  1396
            |||||.||||||||||||||||.|||     |.|..||||     |||.|     |||.|.||           
Sbjct 1333  CAGGAACTTCTACAGGCAAAGAGAAAGAGATGCCATGAAAGGCTGCTCCA-----CGCCGTAC-----------  1390

Query 1397  AATTTGCACAGAATGTGGGGAAATCTCTCACGTCCAAGAGGTTAACAAGCCTTGCTCAGTCTTAC  1461
              ||.||                          |||||         ||||||      |.||  
Sbjct 1391  --TTAGC--------------------------CCAAG---------AGCCTT------TGTT--  1410