Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06863
- Subject:
- NM_001357129.1
- Aligned Length:
- 1471
- Identities:
- 1117
- Gaps:
- 230
Alignment
Query 1 ATGGCCCAGGGGAATAATTATGGGCAGACCAGCAACGGGGTGGCCGATGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG 74
|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCAGGGAAATAATTATGGACAGACCAGCAACGGGGTGGCGGACGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG 74
Query 75 AAAGATGGAAGACGTCATAGCACGGATGCAAGATGAAAAAAATGGAATTCCTATTCGTACGGTCAAAAGCTTTC 148
||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 AAAGATGGAAGATGTCATAGCACGTATGCAAGACGAGAAAAACGGAATTCCCATCCGTACCGTCAAAAGCTTCC 148
Query 149 TTTCCAAGATACCTAGCGTCTTCTCTGGTTCAGACATTGTTCAATGGTTGATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT 222
||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTTCCAAGATCCCCAGTGTGTTCTCCGGGTCAGACATTGTTCAATGGTTAATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT 222
Query 223 CCAGTGGAGGCGCTCCATTTGGGAACATTAATGGCTGCCCACGGCTACTTCTTTCCAATCTCAGATCATGTCCT 296
|||
Sbjct 223 CCA----------------------------------------------------------------------- 225
Query 297 CACACTCAAGGATGATGGCACCTTTTACCGGTTTCAAACCCCCTATTTTTGGCCATCAAATTGTTGGGAGCCGG 370
Sbjct 226 -------------------------------------------------------------------------- 225
Query 371 AAAACACAGATTATGCCGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCACGACTGGAGCTCGCAGACTAT 444
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 226 --------------GCTGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCAAGGCTAGAGCTAGCAGATTAT 285
Query 445 GAGGCTGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTCATGCAAGCAGAAGC 518
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 286 GAAGCCGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTTATGCAAGCAGAAGC 359
Query 519 ACAAGCAAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAGATTGAAAGGAAGATCCTTGACAGCCAAGAGAGAGCGTTCTGGG 592
||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 360 ACAAGCTAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAAATTGAAAGGAAGATCCTCGATAGTCAAGAGAGAGCATTCTGGG 433
Query 593 ACGTGCACAGGCCCGTGCCTGGATGTGTAAATACAACTGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCAGAATGAGAAAC 666
|.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 434 ATGTCCACAGGCCTGTGCCTGGATGTGTAAATACTACAGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCCGGATGAGAAAC 507
Query 667 CCCCACAAAACACGGAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGATATTAGAAGTCACAGTCCTACCCACACACCCAC 740
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 508 CCACACAAAACACGAAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGACATCCGAAGTCACAGTCCCACCCACACACCTAC 581
Query 741 ACCAGAAACTAAACCTCCAACAGAAGATGAGTTACAACAACAGATAAAATATTGGCAAATACAGTTAGATAGAC 814
|||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 ACCAGAAACCAAGCCTCCTACAGAAGATGAGCTGCACCAACAGATAAAATACTGGCAAATACAGTTAGATAGAC 655
Query 815 ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTCGCTGACAGTCTACTAAGTTACACGGAACAGTATTTAGAATACGACCCGTTT 888
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 656 ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTTGCTGATAGTCTACTAAGCTATACGGAACAGTATGTAGAATATGACCCGTTT 729
Query 889 CTTTTGCCACCTGACCCTTCTAACCCATGGCTGTCCGATGACACCACTTTCTGGGAACTTGAGGCAAGCAAAGA 962
|||.||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 730 CTTGTGCCGCCTGACCCTTCCAATCCATGGCTCTCAGATGATACGACTTTCTGGGAACTTGAAGCAAGCAAAGA 803
Query 963 ACCGAGCCAGCAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGCATGGACGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGAGAGAAC 1036
|||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 804 ACCAAGTCAACAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGTATGGATGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGCGAGAGC 877
Query 1037 AGTTCCTTAAATTTCTAGAGTCAGAATTCAGCTCGGAAAATTTAAGATTCTGGCTGGCAGTGGAGGACCTGAAA 1110
||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 878 AGTTCCTTAAGTTTCTAGAATCAGAATTCAGCTCAGAGAACTTAAGGTTCTGGTTGGCAGTGGAGGACCTGAAG 951
Query 1111 AAGAGGCCTATTAAAGAAGTACCCTCAAGAGTTCAGGAAATATGGCAAGAGTTTCTGGCTCCCGGAGCCCCCAG 1184
|..||||||||...|||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 952 AGAAGGCCTATCCGAGAGGTCCCCTCGAGAGTGCAGGAAATATGGCAAGAATTTCTGGCTCCTGGGGCCCCCAG 1025
Query 1185 TGCTATTAACTTGGATTCCAAGAGTTATGACAAAACCACACATAACGTGAAGGAACCTGGACGATACACATTTG 1258
|||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1026 TGCCATTAACTTGGATTCTAAGAGTTATGACAAGACCACACAGAATGTGAAGGAACCAGGACGATACACATTTG 1099
Query 1259 AAGATGCTCAGGAGCACATTTACAAACTGATGAAAAGTGATTCATACCCACGTTTTATAAGATCCAGTGCCTAT 1332
||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1100 AAGATGCTCAGGAGCATATTTACAAGCTGATGAAGAGCGACTCATACCCCCGCTTTATAAGATCTAGTGCCTAC 1173
Query 1333 CAGGAGCTTCTACAGGCAAAGAAAAA-----GTCTGGAAA-----CTCAATGGATCGCAGAACATCTTTTGAAA 1396
|||||.||||||||||||||||.||| |.|..|||| |||.| |||.|.||
Sbjct 1174 CAGGAACTTCTACAGGCAAAGAGAAAGAGATGCCATGAAAGGCTGCTCCA-----CGCCGTAC----------- 1231
Query 1397 AATTTGCACAGAATGTGGGGAAATCTCTCACGTCCAAGAGGTTAACAAGCCTTGCTCAGTCTTAC 1461
||.|| ||||| |||||| |.||
Sbjct 1232 --TTAGC--------------------------CCAAG---------AGCCTT------TGTT-- 1251