Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06866
Subject:
NR_033909.1
Aligned Length:
612
Identities:
419
Gaps:
139

Alignment

Query   1  ---------------------------------------------------------------------ATGGT  5
                                                                                |||||
Sbjct   1  TGCCCCTGAACCCCAGAACAACCAGCTGGATCAATTCTCATAGGAGCCACAGCGCGGAGACTGTGAAACATGGT  74

Query   6  TCCAAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGGGCTTATGGGTGTGGAGGGCTCACTCCATG  79
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCCAAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGGGCTTCTGGCTGTGGAGGGCTCACTCCATG  148

Query  80  CCAGACCCCCACAGTTTACGAGGGCTCAGTGGTTTGCCATCCAGCACATCAGTCTGAACCCCCCTCGATGCACC  153
           .||.|||.|||||||||||..||||||||.||||||.|.||     |||||||..|||||..|..|.|||||||
Sbjct 149  TCAAACCTCCACAGTTTACCTGGGCTCAGGGGTTTGACGTC-----CATCAGTAGGAACCAGCTCCAATGCACC  217

Query 154  ATTGCAATGCGGGCAATTAACAATTATCGATGGCGTTGCAAAAACCAAAATACTTTTCTTCGTACAACTTTTGC  227
           |.|||||||||||.||||||||||||||.|.||||.||.||||||||||||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct 218  AATGCAATGCGGGTAATTAACAATTATCAACGGCGATGGAAAAACCAAAATACTTTTCTTCTTGCAACTTTTGC  291

Query 228  TAATGTAGTTAATGTTTGTGGTAACCAAAGTATACGCTGCCCTCATAACAGAACTCTCAACAATTGTCATCGGA  301
           ||||||||||||||||||||||||||.||.||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 292  TAATGTAGTTAATGTTTGTGGTAACCCAACTATAACCTGCCCTCATAACAGAACTCTCAACAATTGTCATCATA  365

Query 302  GTAGATTCCGGGTGCCTTTACTCCACTGTGACCTCATAAATCCAGGTGCACAGAATATTTCAAACTGCAGGTAT  375
           ||.||.|||.||||||||||.|..|||||.||||||.||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366  GTGGAGTCCAGGTGCCTTTAATGTACTGTAACCTCACAACTCCAAGTCCACAGAATATTTCAAACTGCAGGTAT  439

Query 376  --GCAGACAGACCAGGAAGGAGGTTCTATGTAGTTGCATGTGACAACAGAGAT---CCACGGGATTCTCCACGG  444
             ||||||  |||||.||..|.|||||||.|||||||||||||||||||.|||   |.||||||..||||||.|
Sbjct 440  GCGCAGAC--ACCAGCAAACATGTTCTATATAGTTGCATGTGACAACAGGGATCAACGACGGGACCCTCCACAG  511

Query 445  TATCCTGTGGTTCCAGTTCACCTGGATACCACCATC--------------------------------------  480
           |||||.|||||||||||||||||||||||||.||||                                      
Sbjct 512  TATCCAGTGGTTCCAGTTCACCTGGATACCATCATCTAAGCTCCTGTATCAGCACTCCTCGTCATCACTCATCT  585

Query 481  --------------------  480
                               
Sbjct 586  GCCAAGCTCCTCAATCATAG  605