Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06866
- Subject:
- NR_033909.1
- Aligned Length:
- 612
- Identities:
- 419
- Gaps:
- 139
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------------ATGGT 5
|||||
Sbjct 1 TGCCCCTGAACCCCAGAACAACCAGCTGGATCAATTCTCATAGGAGCCACAGCGCGGAGACTGTGAAACATGGT 74
Query 6 TCCAAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGGGCTTATGGGTGTGGAGGGCTCACTCCATG 79
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCAAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGGGCTTCTGGCTGTGGAGGGCTCACTCCATG 148
Query 80 CCAGACCCCCACAGTTTACGAGGGCTCAGTGGTTTGCCATCCAGCACATCAGTCTGAACCCCCCTCGATGCACC 153
.||.|||.|||||||||||..||||||||.||||||.|.|| |||||||..|||||..|..|.|||||||
Sbjct 149 TCAAACCTCCACAGTTTACCTGGGCTCAGGGGTTTGACGTC-----CATCAGTAGGAACCAGCTCCAATGCACC 217
Query 154 ATTGCAATGCGGGCAATTAACAATTATCGATGGCGTTGCAAAAACCAAAATACTTTTCTTCGTACAACTTTTGC 227
|.|||||||||||.||||||||||||||.|.||||.||.||||||||||||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct 218 AATGCAATGCGGGTAATTAACAATTATCAACGGCGATGGAAAAACCAAAATACTTTTCTTCTTGCAACTTTTGC 291
Query 228 TAATGTAGTTAATGTTTGTGGTAACCAAAGTATACGCTGCCCTCATAACAGAACTCTCAACAATTGTCATCGGA 301
||||||||||||||||||||||||||.||.||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 292 TAATGTAGTTAATGTTTGTGGTAACCCAACTATAACCTGCCCTCATAACAGAACTCTCAACAATTGTCATCATA 365
Query 302 GTAGATTCCGGGTGCCTTTACTCCACTGTGACCTCATAAATCCAGGTGCACAGAATATTTCAAACTGCAGGTAT 375
||.||.|||.||||||||||.|..|||||.||||||.||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 GTGGAGTCCAGGTGCCTTTAATGTACTGTAACCTCACAACTCCAAGTCCACAGAATATTTCAAACTGCAGGTAT 439
Query 376 --GCAGACAGACCAGGAAGGAGGTTCTATGTAGTTGCATGTGACAACAGAGAT---CCACGGGATTCTCCACGG 444
|||||| |||||.||..|.|||||||.|||||||||||||||||||.||| |.||||||..||||||.|
Sbjct 440 GCGCAGAC--ACCAGCAAACATGTTCTATATAGTTGCATGTGACAACAGGGATCAACGACGGGACCCTCCACAG 511
Query 445 TATCCTGTGGTTCCAGTTCACCTGGATACCACCATC-------------------------------------- 480
|||||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 512 TATCCAGTGGTTCCAGTTCACCTGGATACCATCATCTAAGCTCCTGTATCAGCACTCCTCGTCATCACTCATCT 585
Query 481 -------------------- 480
Sbjct 586 GCCAAGCTCCTCAATCATAG 605