Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06931
• Subject: NM_001318798.2
• Aligned Length: 2355
• Identities: 2057
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGCTTGTCGCCGGTCTTCTTCTCTGGGCTTCCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCCACCCAGGACCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTCCCGGCCACGCCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAAGAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAACT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCCTGCTCAACACAACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGAGGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCAAG  222
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------ATGTACGTGGGCAGCAAG  18

Query  223  GACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   19  GACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCACA  92

Query  297  GCGCATCGAGGAATGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   93  GCGCATCGAGGAATGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCAGC  166

Query  371  CCTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  167  CCTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCGGA  240

Query  445  CGCCGCGCCCAGGCCACACCATGGACCCAGACTCAGGCGGTCAGAGGCCGCGGCAGCAGAGCCACGGATGGTGC  518
            ||||||||                                                                  
Sbjct  241  CGCCGCGC------------------------------------------------------------------  248

Query  519  CCTCCGCCCGATGCCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGGGA  592
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  ---------------------------CCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGGGA  295

Query  593  AGGGCAAGTGTCCGTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  AGGGCAAGTGTCCGTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTGTG  369

Query  667  TACATCGATTTTATGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGATCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  TACATCGATTTTATGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGATCA  443

Query  741  GTACAACTCCCGGTGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GTACAACTCCCGGTGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAATG  517

Query  815  ATGATAAGCTTTACTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ATGATAAGCTTTACTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCATC  591

Query  889  GGGCGCATTTGCCTGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCGCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GGGCGCATTTGCCTGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCGCG  665

Query  963  GCTCGTCTGCTCTGTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GCTCGTCTGCTCTGTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCAGC  739

Query 1037  AGACCCAGGACGTGAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AGACCCAGGACGTGAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTGCC  813

Query 1111  GTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAACTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAACTA  887

Query 1185  CCAGTGGATGCCCTTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCCAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CCAGTGGATGCCCTTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCCAT  961

Query 1259  CTATGAAGTCCACCAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CTATGAAGTCCACCAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGGCC  1035

Query 1333  GTGTACCCTCTGCAGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GTGTACCCTCTGCAGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTGGA  1109

Query 1407  CCAGGTGGATGCAGCCGACGGGCGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CCAGGTGGATGCAGCCGACGGGCGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGTCA  1183

Query 1481  TTGTGCTGCCCAAGGATGACCAGGAGATGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAGCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  TTGTGCTGCCCAAGGATGACCAGGAGTTGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAGCA  1257

Query 1555  CCCGTCAAGACCATGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACACCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  CCCGTCAAGACCATGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACACCT  1331

Query 1629  GAGCCTGCACCGCTGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  GAGCCTGCACCGCTGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGCCT  1405

Query 1703  GGGATGGCCAGGCCTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  GGGATGGCCAGGCCTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACGGA  1479

Query 1777  AACCCCATCAGGCAGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGCGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  AACCCCATCAGGCAGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGCGT  1553

Query 1851  GGCCGGCAGCGCAGCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCGAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  GGCCGGCAGCGCAGCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCGAG  1627

Query 1925  ATCCTGGTGACCGGCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTGCGCACAGAGCAGGGCTTGTTGCTCCGT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  ATCCTGGTGACCGGCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTGCGCACAGAGCAGGGCTTGTTGCTCCGT  1701

Query 1999  GCACTGCAGCTCAGCGATCGTGGCCTCTACTCCTGCACAGCCACTGAGAACAACTTTAAGCACGTCGTCACACG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  GCACTGCAGCTCAGCGATCGTGGCCTCTACTCCTGCACAGCCACTGAGAACAACTTTAAGCACGTCGTCACACG  1775

Query 2073  AGTGCAGCTGCATGTACTGGGCCGGGACGCCGTCCATGCTGCCCTCTTCCCACCACTGTCCATGAGCGCCCCGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  AGTGCAGCTGCATGTACTGGGCCGGGACGCCGTCCATGCTGCCCTCTTCCCACCACTGTCCATGAGCGCCCCGC  1849

Query 2147  CACCCCCAGGCGCAGGCCCCCCAACGCCTCCTTACCAGGAGTTAGCCCAGCTGCTGGCCCAGCCAGAAGTGGGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  CACCCCCAGGCGCAGGCCCCCCAACGCCTCCTTACCAGGAGTTAGCCCAGCTGCTGGCCCAGCCAGAAGTGGGC  1923

Query 2221  CTCATCCACCAGTACTGCCAGGGTTACTGGCGCCATGTGCCCCCCAGCCCCAGGGAGGCTCCAGGGGCACCCCG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  CTCATCCACCAGTACTGCCAGGGTTACTGGCGCCATGTGCCCCCCAGCCCCAGGGAGGCTCCAGGGGCACCCCG  1997

Query 2295  GTCTCCTGAGCCCCAGGACCAGAAAAAGCCCCGGAACCGCCGGCACCACCCTCCGGACACA  2355
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998  GTCTCCTGAGCCCCAGGACCAGAAAAAGCCCCGGAACCGCCGGCACCACCCTCCGGACACA  2058