Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06931
• Subject: XM_017313227.1
• Aligned Length: 2529
• Identities: 1908
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGCTTGTCGCCGGTCTTC-TTCTCTGGGCTTCCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCC-ACCCAGGAC  72
            ||||||||| .|.|.|||| |.||||||||||||||.||||||||||||||||| |.||.|||| |.|||||||
Sbjct    1  ATGCTTGTC-ACTGCCTTCATCCTCTGGGCTTCCCTGCTGACCGGGGCCTGGCC-TGCTACCCCTATCCAGGAC  72

Query   73  CACCTCCCGGCCACGCCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAAGAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAA  146
            ||.||.||.|||||.||..|.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct   73  CAGCTTCCAGCCACACCTAGAGTCCGACTGTCATTCAAAGAACTTAAGGCCACCGGTACCGCCCACTTCTTCAA  146

Query  147  CTTCCTGCTCAACACAACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGAGGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCA  220
            |||.|||||||||||.||.||||||.|||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  147  CTTTCTGCTCAACACTACAGACTACAGAATCCTGCTCAAGGATGAGGACCATGACCGCATGTATGTGGGCAGCA  220

Query  221  AGGACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCA  294
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  221  AGGACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCATGACATCAACCGAGAGCCCCTTATTATCCATTGGGCAGCCTCCCCG  294

Query  295  CAGCGCATCGAGGAATGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCA  368
            ||||||||.|||||.|||.|.||.|||||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  295  CAGCGCATTGAGGAGTGCATACTGTCAGGCAAGGATGGCAATGGAGAGTGTGGTAACTTCGTCCGGCTCATCCA  368

Query  369  GCCCTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCG  442
            |||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  369  GCCTTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGTGGGACCGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGTG  442

Query  443  GACGCCGCGCCCAGGCCACACCATGGACCCAGACTCAGGCGGTCAGAGGCCGCGGCAGCAGAGCCACGGATGGT  516
            |.||.|||||                                                                
Sbjct  443  GCCGTCGCGC----------------------------------------------------------------  452

Query  517  GCCCTCCGCCCGATGCCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGG  590
                                         .||||||||||||||||||||||||||||||..|||.||||||||
Sbjct  453  -----------------------------ACAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGAAACTGGAGTCAGG  497

Query  591  GAAGGGCAAGTGTCCGTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTG  664
            .||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  498  AAAAGGCAAATGTCCCTATGACCCCAAGCTGGACACAGCCTCAGCCCTCATCAATGAGGAACTCTATGCAGGAG  571

Query  665  TGTACATCGATTTTATGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGAT  738
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  572  TGTACATCGATTTTATGGGTACCGATGCAGCCATTTTCCGCACGCTGGGGAAGCAGACAGCCATGCGCACAGAT  645

Query  739  CAGTACAACTCCCGGTGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAA  812
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  646  CAGTACAACTCCCGGTGGCTCAATGATCCTTCCTTCATACATGCTGAGCTCATCCCTGACAGTGCAGAGCGCAA  719

Query  813  TGATGATAAGCTTTACTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCA  886
            |||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||.|||.||.|||||.|||||||
Sbjct  720  TGACGATAAACTCTACTTCTTCTTCCGAGAGCGCTCGGCAGAGGCGCCACAGAACCCTGCTGTGTATGCCCGCA  793

Query  887  TCGGGCGCATTTGCCTGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCG  960
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  794  TCGGGCGCATCTGCCTCAACGATGACGGTGGCCATTGCTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCT  867

Query  961  CGGCTCGTCTGCTCTGTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCA  1034
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  868  CGGCTCGTCTGCTCCGTGCCAGGCGAGGATGGTATTGAGACCCACTTCGACGAACTCCAGGATGTGTTTGTCCA  941

Query 1035  GCAGACCCAGGACGTGAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTG  1108
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  942  GCAGACCCAGGACGTCAGGAACCCAGTCATTTATGCTGTCTTTACCTCTTCAGGCTCTGTGTTCCGAGGGTCTG  1015

Query 1109  CCGTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAAC  1182
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1016  CAGTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATCCGCATGGTCTTCAATGGGCCTTTTGCTCACAAGGAGGGCCCCAAC  1089

Query 1183  TACCAGTGGATGCCCTTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCC  1256
            ||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  TATCAATGGATGCCCTTCTCAGGAAAGATGCCCTATCCTCGGCCTGGCACATGCCCTGGTGGAACCTTCACGCC  1163

Query 1257  ATCTATGAAGTCCACCAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGG  1330
            .||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||..||.||.|||||||||||||
Sbjct 1164  CTCGATGAAGTCCACTAAGGACTACCCTGATGAAGTGATCAACTTCATGCGCACTCATCCGCTCATGTACCAGG  1237

Query 1331  CCGTGTACCCTCTGCAGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTG  1404
            ||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||.|||
Sbjct 1238  CCGTCTACCCGCTCCAGCGGCGACCCCTGGTGGTCCGTACAGGCGCTCCCTACCGCCTCACCACTGTCGCTGTG  1311

Query 1405  GACCAGGTGGATGCAGCCGACGGGCGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGT  1478
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  GACCAGGTGGATGCAGCTGATGGACGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGT  1385

Query 1479  CATTGTGCTGCCCAAGGATGACCAGGAGATGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAG  1552
            |||.||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1386  CATCGTGCTGCCCAAGGACGACCAGGAGGTGGAAGAGCTGATGCTAGAGGAAGTGGAGGTCTTCAAGGAACCAG  1459

Query 1553  CACCCGTCAAGACCATGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACAC  1626
            ||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  CACCTGTTAAGACCATGACCATCTCTTCCAAGAGGCAACAACTGTATGTGGCCTCAGCCGTGGGTGTCACACAC  1533

Query 1627  CTGAGCCTGCACCGCTGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGC  1700
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1534  CTGAGCCTGCACCGCTGCCAGGCCTATGGAGCTGCCTGTGCCGACTGCTGCCTTGCCCGCGATCCCTACTGTGC  1607

Query 1701  CTGGGATGGCCAGGCCTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACG  1774
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1608  CTGGGATGGCCAGGCCTGCTCTCGCTACACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGTCGCCGGCAAGATGTCCGCCACG  1681

Query 1775  GAAACCCCATCAGGCAGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGC  1848
            |.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1682  GGAACCCTATCAGACAGTGCCGTGGTTTCAATTCCAATGCAAACAAGAATGCCGTAGAGTCTGTGCAGTACGGA  1755

Query 1849  GTGGCCGGCAGCGCAGCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCG  1922
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1756  GTGGCCGGCAGCGCAGCTTTCCTTGAGTGTCAGCCCCGCTCACCTCAAGCCACTGTCAAGTGGCTGTTCCAGCG  1829

Query 1923  AGATCCTGGTGACCGGCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTG-------------------------  1971
            ||||||..||||.||||||||.|||.|       |||      ||||||                         
Sbjct 1830  AGATCCCAGTGATCGGCGCCGTGAGGT-------GAG------TTCCTGTGTCCTTTCCCCACCCCCCACCCCC  1890

Query 1972  -CGCACAGAGCAGGGCT-TGTTGCTCCGTGCACT---GCAGCT------CAGCGATCGTGGCCTCTACTCCTGC  2034
             |.|.|||    ||||| ||.|||.|||||.| |   |.||.|      |||||   |||      |.||||  
Sbjct 1891  ACCCCCAG----GGGCTATGCTGCACCGTGGA-TATGGGAGTTCTTTTACAGCG---GTG------AGTCCT--  1948

Query 2035  ACAGCCACTGAGA-ACAACTTTA--AGCACGTCGTCACACGAGTGCAGCTGCATGTACTGGGCCGGGACGC---  2102
                    ||||| |.||.|.||  ||  .||.|.||..|..|.|||||  |..|.||||    ||||.||   
Sbjct 1949  --------TGAGAGAGAAATGTACTAG--TGTGGCCAGCCTGGGGCAGC--CCAGCACTG----GGGAGGCAAA  2006

Query 2103  CGTCCATGCTGCCCTCTT---------CCCA-------CCACTG-------TCCATGAGCGCCCCGCCA----C  2149
            .|  ||.||.|..|||||         .|||       |.||.|       ||||.||||.||||.|||    .
Sbjct 2007  GG--CAGGCGGATCTCTTGAGTTCAAGGCCAGTCTGGTCTACAGAGCAAGTTCCAGGAGCACCCCACCAGGGCT  2078

Query 2150  CCCCAGGCGCAGGCCCCCCAA--------------CGCCTCCTTAC-----CAGGAGTTAGCCCAGCT--GCTG  2202
            .|||||    ||...|||.||              ||..||..|||     | ||.||||..||..||  ..||
Sbjct 2079  ACCCAG----AGAAACCCAAAAGAACAAAAAATTCCGTATCTGTACTCTGTC-GGGGTTATACCTTCTTGTTTG  2147

Query 2203  GCCCAGCCAGAAGTGGGCCTCATCCACCAGTA----------CTGCCAGGG----TTACTGG-------CGCCA  2255
            |..||.|   |.|||||  |.| .|.||||||          |||   .||    ||.||||       |.||.
Sbjct 2148  GAACATC---ACGTGGG--TGA-GCTCCAGTATATGGAAATTCTG---TGGATATTTTCTGGGAAAGCCCTCCC  2212

Query 2256  TGTGCCCCCCAGCCCCAGG-GAGGCTCCA---GGG----GCACCCCGGTCTCC---------------------  2300
            .|||..||.|..|||..|| .|.|||  |   |||    |||....|||.|.|                     
Sbjct 2213  CGTGTTCCTCTTCCCGTGGAAATGCT--ATGCGGGTGTCGCAATTGGGTATTCTCATTAAATGGAAATTCTGTG  2284

Query 2301  TGAGCCCCA----------------GGACCAGAAA--AAGCCCCGGAACCGCCGGC---ACC---ACCCTCCGG  2350
            ||.||.|||                .|..||||||  |.||||    ||||||..|   |||   ||||.|.||
Sbjct 2285  TGCGCTCCAAAATTTTCTCATTCATTGTTCAGAAACCACGCCC----ACCGCCCCCCCAACCCCAACCCCCGGG  2354

Query 2351  ACA-CA-------  2355
            .|| ||       
Sbjct 2355  TCATCATCCTTCC  2367