Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06965
Subject:
XM_006530792.2
Aligned Length:
3336
Identities:
2823
Gaps:
177

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGAGCGGGCGGGGCGGGCCAGCCTGGGGCGGCGGGGACTGCCGGCTGGAGGCCGGGACCGCGGGCCAAGCG  74

Query    1  ------ATGCCTCACTTCACCGTGGTGCCAGTGGACGGGCCGAGGCGCGGCGACTATGACAACCTCGAGGGGCT  68
                  |||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCGCGATGCCTCACTTCACCGTGGTGCCGGTGGACGGGCCGCGACGCGGCGACTATGACAACCTCGAGGGGCT  148

Query   69  CAGTTGGGTGGACTACGGGGAGCGCGCCGAGCTGGATGACTCGGACGGACATGGCAACCACAGAGAGAGCAGCC  142
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||                            
Sbjct  149  CAGTTGGGTGGACTACGGCGAGCGCGCCGAGCGGGAAGACTCGGAC----------------------------  194

Query  143  CTTTTCTTTCCCCCTTGGAGGCTTCCAGAGGAATTGACTACTATGACAGGAACCTGGCACTGTTTGAGGAAGAG  216
                                                                               |||.|||
Sbjct  195  -------------------------------------------------------------------GGAGGAG  201

Query  217  CTGGACATCCGCCCAAAGGTATCGTCTCTTCTGGGAAAGCTCGTCAGCTACACCAACCTCACCCAGGGCGCCAA  290
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  202  CTGGACATCCGCCCAAAGGTGTCATCTCTCCTGGGCAAGCTTGTCAGCTATACCAACCTCACCCAAGGAGCCAA  275

Query  291  AGAGCATGAGGAGGCCGAGAGTGGGGAGGGCACCCGCCGGAGGGCAGCCGAGGCACCCAGCATGGGCACCCTCA  364
            .|||||.||||||||.||||||||.||.||...|||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  276  GGAGCACGAGGAGGCTGAGAGTGGAGAAGGTGGCCGACGGAGAGCTGCCAAGGCTCCCAGCATGGGCACACTCA  349

Query  365  TGGGGGTGTACCTGCCCTGCCTGCAGAATATCTTTGGGGTTATCCTCTTCCTGCGGCTGACCTGGATGGTGGGC  438
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  TGGGAGTGTACCTGCCCTGCCTGCAGAATATCTTTGGGGTCATCCTCTTCCTGCGGCTGACCTGGATGGTGGGC  423

Query  439  ACAGCAGGTGTGCTACAGGCCCTCCTCATCGTGCTTATCTGCTGCTGTTGTACCCTGCTGACGGCCATCTCCAT  512
            |||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  424  ACAGCTGGTGTGCTGCAGGCTCTCCTCATTGTCCTCATCTGCTGCTGCTGTACCCTGCTGACAGCCATCTCCAT  497

Query  513  GAGTGCCATCGCCACCAACGGTGTGGTTCCAGCTGGGGGCTCCTATTTCATGATCTCTCGTTCACTGGGGCCAG  586
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||..||||.||||
Sbjct  498  GAGCGCCATTGCCACCAACGGCGTGGTTCCAGCTGGTGGCTCGTACTTCATGATTTCCCGCTCTTTGGGACCAG  571

Query  587  AATTTGGAGGTGCTGTGGGCCTGTGCTTCTACCTGGGAACAACATTCGCAGCAGCCATGTACATCCTGGGGGCC  660
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  572  AATTCGGAGGTGCTGTGGGCCTGTGCTTCTACCTGGGGACGACATTTGCAGCAGCCATGTATATCCTAGGGGCC  645

Query  661  ATCGAGATCTTGCTGACCTACATTGCCCCACCAGCTGCCATTTTTTACCCATCGGGTGCTCATGACACGTCGAA  734
            ||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||..|.|||||||.|||.|.
Sbjct  646  ATTGAGATCTTGCTGACCTACATTGCTCCGCCAGCTGCCATCTTTTACCCATCGGGCACCCATGACATGTCAAG  719

Query  735  TGCCACTTTGAACAATATGCGTGTGTATGGGACCATTTTCCTGACCTTCATGACCCTGGTGGTGTTTGTGGGGG  808
            .|||||.|||||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  720  CGCCACCTTGAATAACATGAGAGTGTATGGGACCATTTTCCTGACTCTGATGACCCTAGTGGTGTTTGTCGGTG  793

Query  809  TCAAGTATGTGAACAAATTTGCCTCGCTCTTCCTGGCCTGTGTGATCATCTCCATCCTCTCCATCTATGCTGGG  882
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.
Sbjct  794  TCAAGTACGTGAACAAGTTTGCCTCGCTCTTCCTGGCCTGCGTGATCATCTCCATCCTTTCCATTTACGCGGGA  867

Query  883  GGCATAAAGTCTATATTTGACCCTCCCGTGTTTCCGGTATGCATGCTGGGCAACAGGACCCTGTCCCGGGACCA  956
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  868  GGCATCAAGTCCATTTTTGACCCTCCCGTGTTTCCGGTGTGTATGCTGGGCAATAGGACCCTGTCTCGGGACCA  941

Query  957  GTTTGACATCTGTGCCAAGACAGCTGTAGTGGACAATGAGACAGTGGCCACCCAGCTATGGAGTTTCTTCTGCC  1030
            |||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||
Sbjct  942  GTTTGACATCTGTGCCAAGACAGTCGTGGTGGACAATGAGACAGTGGCCACCCGGCTGTGGACTTTCTTCTGCC  1015

Query 1031  ACAGCCCCAACCTTACGACCGACTCCTGTGACCCCTACTTCATGCTCAACAATGTGACCGAGATCCCTGGCATC  1104
            ||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1016  ACAGCCCCAACCTTACTGCTGACTCCTGTGACCCCTACTTCCTGCTCAACAATGTGACAGAGATTCCTGGCATA  1089

Query 1105  CCCGGGGCAGCTGCTGGTGTGCTCCAGGAAAACCTGTGGAGCGCCTACCTGGAGAAGGGTGACATCGTGGAGAA  1178
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||
Sbjct 1090  CCTGGGGCAGCTGCTGGTGTGCTCCAGGAGAACCTCTGGAGCGCTTACCTGGAGAAGGGGGAGGTCGTGGAGAA  1163

Query 1179  GCATGGGCTGCCCTCCGCAGATGCCC-CGAGCCTGAAGGAGAGCCTGCCTCTGTACGTGGTCGCTGACATCGCC  1251
            ||||||||||||.|||.||||..||| || ||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1164  GCATGGGCTGCCGTCCACAGACACCCTCG-GCCTAAAGGAGAGCCTGTCCCTGTATGTGGTGGCTGACATCGCC  1236

Query 1252  ACATCCTTCACCGTGCTGGTCGGCATCTTCTTCCCTTCTGTAACAGGCATCATGGCTGGCTCAAACCGCTCTGG  1325
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1237  ACGTCCTTCACCGTGCTGGTTGGCATCTTTTTCCCTTCTGTGACAGGCATCATGGCTGGTTCAAACCGCTCCGG  1310

Query 1326  GGACCTTCGTGACGCCCAGAAGTCTATCCCTGTGGGGACCATTCTGGCCATCATTACAACTTCCCTCGTGTACT  1399
            |||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1311  GGATCTCCGTGACGCCCAGAAGTCTATCCCAGTGGGGACCATTCTGGCCATTGTTACCACTTCGCTGGTGTACT  1384

Query 1400  TCAGCAGTGTGGTTCTCTTTGGTGCCTGCATTGAGGGTGTGGTTCTCCGGGACAAGTATGGCGATGGTGTCAGC  1473
            |||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1385  TCAGCAGTGTGATCCTCTTCGGTGCCTGCATCGAGGGTGTGGTACTCCGGGACAAGTACGGTGATGGCGTCAGC  1458

Query 1474  AGGAACTTGGTGGTGGGCACACTGGCCTGGCCTTCACCCTGGGTCATCGTCATCGGCTCCTTCTTTTCAACGTG  1547
            ||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||..|.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1459  AGGAACCTGGTGGTGGGCACCCTGGCCTGGCCTTCGCCTTGGGTCATCGTGGTTGGCTCCTTCTTCTCAACATG  1532

Query 1548  TGGCGCTGGCCTCCAGAGCCTCACAGGGGCACCACGCCTATTGCAGGCCATTGCCAAGGACAACATCATCCCCT  1621
            |||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||..||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1533  TGGGGCTGGTCTCCAGAGCCTCACTGGGGCGCCACGTTTACTGCAAGCCATTGCCAAGGATAACATCATCCCCT  1606

Query 1622  TCCTCCGGGTGTTTGGCCACGGGAAGGTGAATGGTGAACCCACATGGGCACTCCTCCTGACGGCACTCATCGCC  1695
            |||||||||||||||||||.|||||.|..||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1607  TCCTCCGGGTGTTTGGCCATGGGAAAGCAAACGGTGAACCGACGTGGGCCCTCCTCCTGACAGCGCTCATCGCT  1680

Query 1696  GAGCTGGGCATCCTCATCGCCTCCCTCGACATGGTGGCCCCCATCTTATCCATGTTCTTTCTGATGTGCTACCT  1769
            ||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1681  GAGCTGGGCATCCTGATTGCTTCCCTTGACATGGTGGCCCCCATTCTGTCCATGTTCTTTCTGATGTGTTACCT  1754

Query 1770  GTTCGTGAACCTCGCCTGTGCGGTGCAGACACTCCTGAGGACCCCCAACTGGCGGCCCCGGTTCAAGTACTATC  1843
            .||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755  CTTTGTAAACTTGGCCTGTGCCGTGCAGACACTTCTGAGGACCCCCAACTGGCGGCCCCGGTTCAAGTACTATC  1828

Query 1844  ACTGGGCGCTGTCCTTCCTGGGCATGAGTCTCTGCCTGGCCCTTATGTTTGTCTCCTCCTGGTACTATGCCCTG  1917
            |||||.|..||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1829  ACTGGACATTGTCTTTCCTAGGCATGAGTCTCTGCCTGGCTCTTATGTTTGTCTCCTCCTGGTACTATGCCCTA  1902

Query 1918  GTGGCCATGCTCATCGCCGGCATGATCTACAAATACATCGAGTACCAAGGGGCTGAGAAGGAGTGGGGTGACGG  1991
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1903  GTGGCCATGCTCATCGCAGGCATGATCTACAAGTACATCGAGTACCAAGGGGCCGAGAAGGAGTGGGGCGATGG  1976

Query 1992  GATCCGAGGCCTGTCCCTGAGCGCTGCCCGCTACGCGCTGTTGCGGCTGGAGGAGGGGCCTCCTCACACCAAGA  2065
            |||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||.||.||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1977  GATCCGAGGCCTGTCCCTGAGTGCGGCACGCTATGCACTGCTGAGGCTGGAGGAAGGGCCTCCTCACACCAAGA  2050

Query 2066  ACTGGCGGCCGCAGCTGCTGGTGCTGCTGAAGCTGGACGAGGACCTCCACGTGAAGTACCCGCGGCTCCTCACC  2139
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2051  ACTGGCGGCCTCAGCTCCTGGTGCTGCTTAAGTTAGACGAAGATCTTCATGTGAAGTACCCCCGGCTCCTCACC  2124

Query 2140  TTCGCCTCCCAGCTCAAGGCTGGCAAGGGCCTGACCATTGTTGGTTCTGTCATCCAGGGGAGCTTCTTGGAGAG  2213
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||..|||||||
Sbjct 2125  TTCGCCTCCCAGCTGAAGGCCGGGAAGGGCCTGACAATCGTTGGCTCTGTCATCCAGGGCAGCTTTCTGGAGAG  2198

Query 2214  CTATGGCGAGGCTCAGGCCGCCGAGCAGACCATCAAGAACATGATGGAAATTGAGAAGGTGAAGGGCTTCTGCC  2287
            ||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 2199  CTATGGTGAAGCCCAGGCCGCTGAGCAGACCATCAAGAACATGATGGACATTGAGAAAGTCAAAGGCTTCTGCC  2272

Query 2288  AGGTGGTGGTGGCCAGCAAGGTGCGGGAGGGGCTGGCCCACCTCATCCAGTCCTGTGGCCTGGGAGGCATGCGG  2361
            ||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.|.
Sbjct 2273  AGGTAGTGGTGGCCAGCAAGGTTCGAGAGGGACTGGCCCACCTCATCCAGTCTTGCGGCCTGGGCGGCATGAGA  2346

Query 2362  CATAACTCCGTGGTGCTGGGCTGGCCCTACGGCTGGCGACAGAGCGAGGACCCCCGTGCCTGGAAGACCTTCAT  2435
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2347  CACAACTCCGTGGTGCTGGGCTGGCCCTATGGCTGGCGACAGAGTGAGGACCCACGTGCCTGGAAGACCTTTAT  2420

Query 2436  TGACACCGTGCGCTGCACTACGGCTGCCCACCTGGCCCTGCTCGTGCCCAAGAACATCGCCTTCTACCCCAGCA  2509
            ||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 2421  TGACACTGTGCGCTGCACCACAGCTGCCCACCTGGCCCTGCTGGTGCCAAAGAACATAGCTTTCTACCCCAGCA  2494

Query 2510  ACCACGAGCGCTACCTGGAGGGCCACATAGACGTGTGGTGGATCGTGCACGATGGTGGCATGCTCATGCTTCTG  2583
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2495  ACCACGAGCGCTACCTGGATGGCCATATCGACGTGTGGTGGATCGTGCATGATGGAGGCATGCTTATGCTGCTG  2568

Query 2584  CCCTTCCTGCTGCGCCAGCATAAGGTCTGGAGGAAGTGCCGGATGCGCATCTTCACAGTGGCCCAGATGGATGA  2657
            |||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2569  CCCTTTCTGCTGCGCCAGCATAAGGTTTGGAAGAAGTGCCGGATGCGCATTTTCACCGTGGCCCAGATGGATGA  2642

Query 2658  CAACAGCATCCAGATGAAGAAGGACCTGGCTGTCTTTCTGTACCATCTGCGCCTTGAGGCCGAGGTGGAGGTGG  2731
            ||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 2643  CAACAGCATCCAGATGAAGAAGGATCTGGCCATCTTCCTGTATCACCTCCGCCTGGAAGCTGAAGTGGAGGTGG  2716

Query 2732  TGGAGATGCATAACAGTGACATCTCTGCATACACCTACGAGCGGACGCTGATGATGGAGCAGCGGTCGCAGATG  2805
            |.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2717  TAGAGATGCACAACAGTGACATCTCTGCCTATACCTATGAGCGGACACTGATGATGGAGCAGCGGTCTCAGATG  2790

Query 2806  CTGCGGCAGATGAGACTGACCAAGACTGAGCGGGAGCGAGAAGCCCAGCTGGTCAAGGATCGGCACTCGGCCCT  2879
            ||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||||||||.||
Sbjct 2791  CTGCGGCAGATGAGGTTGACCAAAACTGAGCGGGATCGAGAGGCCCAGCTGGTAAAGGACAGGCACTCGGCTCT  2864

Query 2880  GAGGCTGGAGAGCCTGTACTCGGACGAGGAAGATGAGTCTGCAGTGGGGGCTGACAAGATCCAGATGACGTGGA  2953
            .||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||..|..|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865  TAGGCTGGAGAGCCTCTACTCCGACGAGGAGGAAGAGTCTGTGGCAGGGGCCGACAAGATCCAGATGACGTGGA  2938

Query 2954  CCAGGGACAAGTACATGACTGAGACCTGGGACCCCAGCCATGCCCCTGACAATTTCCGGGAGCTGGTGCACATT  3027
            ||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2939  CCAGAGACAAGTACATGGCTGAGCCCTGGGACCCCAGCCACGCCCCTGACAACTTCCGGGAGCTGGTGCACATT  3012

Query 3028  AAGCCGGACCAATCCAATGTGCGGCGCATGCACACTGCTGTGAAGCTCAATGAAGTCATTGTCACGCGCTCCCA  3101
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 3013  AAGCCGGACCAGTCCAACGTGCGGCGCATGCACACTGCTGTGAAGCTCAACGAGGTCATTGTCACGCGCTCCCA  3086

Query 3102  CGACGCCCGCCTGGTTCTCCTAAACATGCCTGGCCCACCCAGGAACAGTGAGGGCGACGAGAACTACATGGAGT  3175
            |||.|||||.||||||.|.||.||||||||||||||.||.|.||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3087  CGATGCCCGTCTGGTTTTGCTGAACATGCCTGGCCCCCCTAAGAACAGCGAGGGCGACGAGAACTACATGGAAT  3160

Query 3176  TCCTCGAGGTGCTGACCGAGGGCCTTGAGCGGGTGCTGTTGGTGCGCGGTGGTGGCCGTGAAGTCATCACCATC  3249
            ||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 3161  TCCTTGAAGTCCTAACCGAGGGCCTTGAACGGGTGTTGTTGGTGCGTGGCGGCGGCCGGGAAGTCATCACCATC  3234

Query 3250  TACTCC  3255
            ||.|||
Sbjct 3235  TATTCC  3240