Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06975
- Subject:
- XM_006514020.3
- Aligned Length:
- 3732
- Identities:
- 3068
- Gaps:
- 342
Alignment
Query 1 ATGGCGGTGCGGAAGAAGGACGGCGGCCCCAACGTGAAGTACTACGAGGCCGCGGACACCGTGACCCAGTTCGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGTGCGGAAGAAGGACGGCGGCCCCAACGTGAAGTACTACGAGGCCGCGGACACCGTGACCCAGTTCGA 74
Query 75 CAACGTGCGGCTGTGGCTCGGCAAGAACTACAAGAAGTATATACAAGCTGAACCACCCACCAACAAGTCCCTGT 148
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 75 CAACGTGCGGCTCTGGCTCGGCAAGAACTACAAGAAGTACATACAAGCAGAACCGCCAACCAACAAGTCTCTGT 148
Query 149 CTAGCCTGGTTGTACAGTTGCTACAATTTCAGGAAGAAGTTTTTGGCAAACATGTCAGCAATGCACCGCTCACT 222
|.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 CCAGCCTGGTGGTGCAGTTGCTCCAGTTTCAGGAAGAGGTTTTTGGCAAACATGTCAGCAACGCACCGCTTACT 222
Query 223 AAACTGCCGATCAAATGTTTCCTAGATTTCAAAGCGGGAGGCTCCTTGTGCCACATTCTTGCAGCTGCCTACAA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAACTGCCGATCAAATGTTTCCTAGATTTCAAAGCAGGAGGATCCCTCTGCCATATTCTTGCAGCTGCCTACAA 296
Query 297 ATTCAAGAGTGACCAGGGATGGCGGCGTTACGATTTCCAGAATCCATCACGCATGGACCGCAATGTGGAAATGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATTCAAGAGTGACCAGGGATGGCGGCGTTACGATTTCCAGAATCCATCACGCATGGACCGCAATGTGGAAATGT 370
Query 371 TTATGACCATTGAGAAGTCCTTGGTGCAGAATAATTGCCTGTCTCGACCTAACATTTTTCTGTGCCCAGAAATT 444
|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 371 TCATGACCATTGAGAAGTCCTTGGTACAGAATAATTGCCTGTCACGACCTAACATTTTCCTCTGCCCAGAAATT 444
Query 445 GAGCCCAAACTACTAGGGAAATTAAAGGACATTATCAAGAGACACCAGGGAACAGTCACTGAGGATAAGAACAA 518
|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||..||.||||||||||||.|||
Sbjct 445 GAGCCCAAACTGCTAGGGAAATTAAAAGACATTGTTAAGAGACACCAGGGAACCATCTCTGAGGATAAGAGCAA 518
Query 519 TGCCTCCCATGTTGTGTATCCTGTCCCGGGGAATCTAGAAGAAGAGGAATGGGTACGACCAGTCATGAAGAGGG 592
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCCTCCCATGTTGTGTATCCTGTCCCAGGGAACCTAGAAGAAGAGGAATGGGTACGGCCAGTCATGAAGAGGG 592
Query 593 ATAAGCAGGTTCTTCTGCACTGGGGCTACTATCCTGACAGTTACGACACGTGGATCCCAGCGAGTGAAATTGAG 666
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 ATAAACAGGTTCTTCTGCACTGGGGCTACTATCCTGACAGCTACGACACGTGGATCCCAGCGAGTGAAATTGAA 666
Query 667 GCATCTGTGGAAGATGCTCCAACTCCTGAGAAACCTAGGAAGGTTCATGCAAAGTGGATCCTGGACACCGACAC 740
|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 GCATCTGTGGAGGACGCTCCCACTCCTGAGAAACCGAGGAAGGTCCATGCGAAGTGGATCCTCGACACCGACAC 740
Query 741 CTTCAATGAATGGATGAATGAGGAAGACTATGAAGTAAATGATGACAAAAACCCTGTCTCCCGCCGAAAGAAGA 814
.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||||.|||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct 741 ATTCAACGAGTGGATGAATGAGGAAGACTACGAAGTCAGTGACGACAAAAGCCCAGTCTCCCGCAGGAAGAAGA 814
Query 815 TTTCAGCCAAGACACTGACAGATGAGGTGAACAGCCCAGATTCAGATCGACGGGACAAGAAGGGGGGAAACTAT 888
|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 TCTCAGCCAAGACGCTGACAGACGAGGTAAACAGCCCAGATTCAGACAGACGAGACAAGAAGGGGGGCAACTAT 888
Query 889 AAGAAGAGGAAGCGCTCCCCCTCTCCTTCACCAACCCCAGAAGCAAAGAAGAAAAATGCTAAGAAAGGTCCCTC 962
|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 889 AAGAAGAGGAAGCGCTCTCCCTCTCCTTCACCCACCCCAGAGGCTAAGAAGAAAAACGCTAAGAAAGGACCCTC 962
Query 963 AACACCTTACACTAAGTCAAAGCGTGGCCACAGAGAAGAGGAGCAAGAAGACCTGACAAAGGACATGGACGAGC 1036
|||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 963 AACACCTTATACCAAGTCAAAGCGAGGCCACAGAGAAGAGGAACAAGAAGACCTGACAAAAGACATGGATGAGC 1036
Query 1037 CCTCACCAGTCCCCAATGTAGAAGAGGTGACACTTCCCAAAACAGTCAACACAAAGAAAGACTCAGAGTCGGCC 1110
||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1037 CCTCTCCAGTCCCAAACGTGGAAGAGGTGACACTCCCCAAAACAGTCAACACTAAAAAGGACTCTGAGTCAGCC 1110
Query 1111 CCAGTCAAAGGCGGCACCATGACCGACCTGGATGAACAGGAAGATGAAAGCATGGAGACGACGGGCAAGGATGA 1184
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1111 CCAGTCAAAGGCGGCACCATGACTGACCTGGATGAACAGGACGATGAAAGCATGGAGACCACCGGCAAGGACGA 1184
Query 1185 GGATGAGAACAGTACGGGGAACAAGGGAGAGCAGACCAAGAATCCAGACCTGCATGAGGACAATGTGACTGAAC 1258
||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185 GGATGAGAACAGCACGGGCAACAAAGGCGAGCAGACGAAGAACCCGGACCTGCATGAGGACAATGTGACCGAGC 1258
Query 1259 AGACCCACCACATCATCATTCCCAGCTACGCTGCCTGGTTTGACTACAATAGTGTTCATGCCATTGAGCGGAGG 1332
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259 AGACCCACCACATCATCATCCCCAGCTACGCCGCCTGGTTTGACTACAACAGCGTCCATGCCATTGAACGGAGG 1332
Query 1333 GCTCTCCCCGAGTTCTTCAACGGCAAGAACAAGTCCAAGACTCCAGAGATCTACCTGGCCTATCGAAACTTTAT 1406
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1333 GCTCTTCCTGAGTTCTTCAACGGCAAGAACAAGTCTAAGACTCCAGAGATCTACCTGGCGTATCGGAACTTCAT 1406
Query 1407 GATTGACACTTACCGACTGAACCCCCAAGAGTATCTTACCTCTACCGCCTGCCGCCGAAACCTAGCGGGTGATG 1480
|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||..|.||||||||||
Sbjct 1407 GATTGACACTTACCGACTGAATCCCCAGGAGTATCTAACATCTACTGCCTGTCGGCGGAATTTGGCGGGTGATG 1480
Query 1481 TCTGTGCCATCATGAGGGTCCATGCCTTCCTAGAACAGTGGGGTCTTATTAACTACCAGGTGGATGCTGAGAGT 1554
||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1481 TCTGCGCTATCATGAGGGTCCATGCCTTCCTGGAACAGTGGGGTCTTATTAACTACCAGGTAGATGCTGAGAGC 1554
Query 1555 CGACCAACCCCAATGGGGCCTCCGCCTACCTCTCACTTCCATGTCTTGGCTGACACACCATCAGGGCTGGTGCC 1628
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555 CGACCAACCCCAATGGGGCCTCCACCCACCTCTCACTTCCATGTCTTGGCGGACACACCATCAGGGCTGGTTCC 1628
Query 1629 TCTGCAGCCCAAGACACCTCAGGGCCGCCAGGTTGATGCTGATACCAAGGCTGGGCGAAAGGGCAAAGAGCTGG 1702
|||.|||||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCTTCAGCCGAAGCCTCCACAGGGCCGCCAGGTTGATGCTGACACCAAGGCTGGGCGGAAGGGCAAAGAGCTGG 1702
Query 1703 ATGACCTGGTGCCAGAGACGGCTAAGGGCAAGCCAGAGCTGCAGACCTCTGCTTCCCAACAAATGCTCAACTTT 1776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1703 ATGACCTGGTGCCAGAGACGGCTAAGGGCAAGCCAGAGCTGCAGAGCTCTGCTTCCCAGCAAATGCTGAACTTC 1776
Query 1777 CCTGACAAAGGCAAAGAGAAACCAACAGACATGCAAAACTTTGGGCTGCGCACAGACATGTACACAAAAAAGAA 1850
|||||.||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777 CCTGAGAAGGGCAAGGAGAAACCAGCAGACATGCAGAATTTTGGGCTGCGCACAGACATGTACACAAAGAAGAA 1850
Query 1851 TGTTCCCTCCAAGAGCAAGGCTGCAGCCAGTGCCACTCGTGAGTGGACAGAACAGGAAACCCTGCTTCTCCTGG 1924
.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1851 CGTCCCCTCCAAGAGCAAAGCTGCAGCAAGTGCCACTCGGGAATGGACGGAGCAGGAGACTCTGCTGCTCCTGG 1924
Query 1925 AGGCACTGGAAATGTACAAAGATGACTGGAACAAAGTGTCCGAGCATGTGGGAAGCCGCACACAGGACGAGTGC 1998
||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925 AGGCTTTGGAAATGTACAAGGACGACTGGAACAAAGTATCTGAGCACGTGGGAAGCCGCACGCAGGACGAGTGC 1998
Query 1999 ATCTTGCATTTTCTTCGTCTTCCCATTGAAGACCCATACCTGGAGGACTCAGAGGCCTCCCTAGGCCCCCTGGC 2072
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1999 ATCTTGCATTTTCTCCGCCTTCCCATTGAAGACCCATACCTGGAGGACTCGGAGGCTTCTCTAGGCCCTCTGGC 2072
Query 2073 CTACCAACCCATCCCCTTCAGTCAGTCGGGCAACCCTGTTATGAGCACTGTTGCCTTCCTGGCCTCTGTCGTCG 2146
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CTACCAACCCATCCCCTTCAGTCAGTCAGGCAACCCTGTTATGAGCACCGTTGCCTTCCTGGCCTCTGTCGTCG 2146
Query 2147 ATCCCCGAGTCGCCTCTGCTGCTGCAAAGTCAGCCCTAGAGGAGTTCTCCAAAATGAAGGAAGAGGTACCCACG 2220
||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2147 ATCCCCGAGTTGCCTCTGCTGCTGCGAAGTCAGCCCTAGAAGAGTTCTCAAAAATGAAGGAAGAGGTGCCCACA 2220
Query 2221 GCCTTGGTGGAGGCCCATGTTCGAAAAGTGGAAGAAGCAGCCAAAGTAACAGGCAAGGCGGACCCTGCCTTCGG 2294
||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2221 GCTTTGGTGGAAGCCCACGTGCGTAAGGTCGAAGAAGCGGCCAAAGTCACAGGCAAGGCCGACCCAGCCTTTGG 2294
Query 2295 TCTGGAAAGCAGTGGCATTGCAGGAACCACCTCTGATGAGCCTGAGCGGATTGAGGAGAGCGGGAATGACGAGG 2368
||||||.||.||.|||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||.||||
Sbjct 2295 TCTGGAGAGTAGCGGCATCGCAGGGACTGCCTCTGATGAGCCTGAGCGCATTGAGGAAAGCGGGACTGAGGAGG 2368
Query 2369 CTCGGGTGGAAGGCCAGGCCACAGATGAGAAGAAGGAGCCCAAGGAACCCCGAGAAGGAGGGGGTGCTATAGAG 2442
|.|||...||.||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||
Sbjct 2369 CACGGCCAGAGGGCCAGGCAGCAGATGAGAAGAAGGAGCCTAAGGAACCACGGGAAGGAGGGGGCGCTGTGGAG 2442
Query 2443 GAGGAAGCAAAAGAGAAAACCAGCGAGGCTCCCAAGAAGGATGAGGAGAAAGGGAAAGAAGGCGACAGTGAGAA 2516
||.||||||||.|||.|||..||.||||..||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2443 GAAGAAGCAAAGGAGGAAATAAGTGAGGTCCCCAAGAAAGATGAAGAGAAAGGGAAAGAAGGTGACAGTGAGAA 2516
Query 2517 GGAGTCCGAGAAGAGTGATGGAGACCCAATAGTCGATCCTGAGAAGGAGAAGGAGCCAAAGGAAGGGCAGGAGG 2590
||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||..|||||||||||||
Sbjct 2517 GGAGTCTGAGAAGAGTGACGGGGACCCGATAGTTGATCCTGAGAAAGACAAGGAACCAACAGAAGGGCAGGAGG 2590
Query 2591 AAGTGCTGAAGGAAGTGGTGGAGTCTGAGGGGGAAAGGAAGACAAAGGTGGAGCGGGACATTGGCGAGGGCAAC 2664
|||||||.||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 2591 AAGTGCTAAAGGAAGTGGCAGAGCCAGAGGGGGAGAGGAAAACCAAGGTGGAGCGTGACATTGGTGAAGGCAAC 2664
Query 2665 CTCTCCACCGCTGCTGCCGCCGCCCTGGCCGCCGCCGCAGTGAAAGCTAAGCACTTTGCTGCTGTTGAGGAAAG 2738
||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 2665 CTGTCCACAGCTGCAGCCGCAGCCCTGGCCGCTGCTGCAGTCAAGGCCAAGCACTTGGCTGCAGTTGAGGAGAG 2738
Query 2739 GAAGATCAAATCTTTGGTGGCCCTGCTGGTGGAGACCCAGATGAAAAAGTTGGAGATCAAACTTCGGCACTTTG 2812
.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 2739 AAAGATCAAGTCTTTGGTGGCTCTGCTGGTAGAGACCCAAATGAAGAAACTAGAGATCAAACTCCGACATTTTG 2812
Query 2813 AGGAGCTGGAGACTATCATGGACCGGGAGCGAGAAGCACTGGAGTATCAGAGGCAGCAGCTCCTGGCCGACAGA 2886
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 2813 AGGAGCTGGAGACAATAATGGACCGGGAGCGAGAGGCGCTGGAATACCAGAGGCAGCAGCTCCTGGCCGACCGG 2886
Query 2887 CAAGCCTTCCACATGGAGCAGCTGAAGTATGCGGAGATGAGGGCTCGGCAGCAGCACTTCCAACAGATGCACCA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2887 CAAGCCTTCCACATGGAGCAGCTGAAGTATGCAGAGATGAGGGCCCGGCAGCAGCACTTCCAGCAGATGCACCA 2960
Query 2961 ACAGCAGCAGCAGCCACCACCAGCCCTGCCCCCAGGCTCCCAGCCTATCCCCCCAACAGGGGCTGCTGGGCCAC 3034
.|||||||||||||..||||||.||.|||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 2961 GCAGCAGCAGCAGCAGCCACCAACCTTGCCCCCAGGCTCCCAGCCCATACCTCCCACCGGGGCTGCTGGACCAC 3034
Query 3035 CCGCAGTCCATGGCTTGGCTGTGGCTCCAGCCTCTGTAGTCCCTGCTCCTGCTGGCAGTGGGGCCCCTCCAGGA 3108
|..||||||||||..|.||||||.||||||||.||||.|.|.||||.|||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 3035 CTACAGTCCATGGTCTAGCTGTGCCTCCAGCCGCTGTGGCCTCTGCCCCTCCTGGCAGTGGGGCCCCTCCTGGA 3108
Query 3109 AGTTTGGGCCCTTCTGAACAGATTGGGCAGGCAGGGTCAACTGCAGGGCCACAGCAGCAGCAACCAGCTGGAGC 3182
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||..||||.|||||||||
Sbjct 3109 AGCTTGGGCCCTTCTGAACAGATTGGGCAGGCAGGGACAACTGCAGGGCCACAGCAGCCACAACAAGCTGGAGC 3182
Query 3183 CCCCCAGCCTGGGGCAGTCCCACCAGGGGTTCCCCCCCCTGGACCCCATGGCCCCTCACCGTTCCCCAACCAAC 3256
|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 CCCTCAGCCTGGGGCAGTCCCACCAGGGGTACCCCCCCCTGGACCCCATGGCCCCTCACCGTTCCCCAACCAAC 3256
Query 3257 AAACTCCTCCCTCAATGATGCCAGGGGCAGTGCCAGGCAGCGGGCACCCAGGCGTGGCG--------------- 3315
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CAACTCCTCCCTCAATGATGCCAGGGGCAGTGCCAGGCAGCGGGCACCCAGGCGTGGCGGGTAATGCTCCTTTG 3330
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3331 GGTTTGCCTTTTGGCATGCCGCCTCCTCCTCCTGCTGCTCCATCCGTCATCCCATTCGGTAGTCTAGCTGACTC 3404
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3405 CATTAGTATTAACCTTCCCCCTCCTCCTAACCTGCATGGGCATCACCACCATCTCCCGTTTGCCCCGGGCACTA 3478
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3479 TCCCCCCACCTAACCTGCCTGTGTCCATGGCGAACCCTCTACATCCTAACCTGCCGGCGACCACCACCATGCCA 3552
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3553 TCTTCCTTGCCTCTCGGGCCGGGGCTCGGATCCGCCGCAGCCCAGAGCCCTGCCATTGTGGCAGCTGTTCAGGG 3626
Query 3316 -------------------------------GACCCAGGCACCCCCCTGCCTCCAGACCCCACAGCCCCGAGCC 3358
||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 3627 CAACCTCCTGCCCAGTGCCAGCCCACTGCCAGACCCAGGCACCCCGCTGCCTCCAGACCCCACAGCTCCAAGCC 3700
Query 3359 CAGGCACGGTCACCCCTGTGCCACCTCCACAG 3390
|||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 CAGGCACAGTCACCCCTGTGCCACCTCCACAG 3732