Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06984
- Subject:
- NM_001242933.2
- Aligned Length:
- 1673
- Identities:
- 1551
- Gaps:
- 109
Alignment
Query 1 ATGGCGTCGGGTGGTGGTGGCTGTAGCGCTTCGGAGAGACTGCCTCCGCCCTTCCCCGGCCTGGAGCCGGAGTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCGGGTGGTGGTGGCTGTAGCGCTTCGGAGAGACTGCCTCCGCCCTTCCCCGGCCTGGAGCCGGAGTC 74
Query 75 CGAGGGGGCGGCCGGGGGATCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGACATTTTCACCGGCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAGGGGGCGGCCGGGGGATCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGACATTTTCACCGGCG 148
Query 149 CCGCGGTGGTCAGTAAACATCAGTCTCCAAAGATAACTACATCCCTTCTTCCCATCAACAATGGCTCCAAAGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGCGGTGGTCAGTAAACATCAGTCTCCAAAGATAACTACATCCCTTCTTCCCATCAACAATGGCTCCAAAGAA 222
Query 223 AATGGGATCCATGAAGAACAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAGCTATCCTTGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATGGGATCCATGAAGAACAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAGCTATCCTTGGA 296
Query 297 CAGCACACAAAATAATCAGAAGAAGGTGCTAGCCAAAACACTCATTTCTCTTCCTCCTCAGGAAGCCACAAATT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGCACACAAAATAATCAGAAGAAGGTGCTAGCCAAAACACTCATTTCTCTTCCTCCTCAGGAAGCCACAAATT 370
Query 371 CTTCGAAGCCCCAGCCAACCTATGAGGAGCTAGAGGAAGAAGAACAGGAGGATCAATTTGATTTGACAGTCGGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTTCGAAGCCCCAGCCAACCTATGAGGAGCTAGAGGAAGAAGAACAGGAGGATCAATTTGATTTGACAGTCGGT 444
Query 445 ATAACTGATCCTGAGAAGATAGGGGATGGTATGAATGCATATGTAGCCTACAAAGTTACAACACAGACAAGCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATAACTGATCCTGAGAAGATAGGGGATGGTATGAATGCATATGTAGCCTACAAAGTTACAACACAGACAAGCTT 518
Query 519 ACCATTGTTCAGAAGCAAACAGTTTGCAGTAAAAAGAAGATTTAGTGACTTTCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACCATTGTTCAGAAGCAAACAGTTTGCAGTAAAAAGAAGATTTAGTGACTTTCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTT 592
Query 593 CCGAGAAGCACTCTCAGAATGGCTTCATTGTCCCTCCACCCCCGGAGAAGAGCCTCATAGGGATGACAAAAGTG 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCGAGAAGCACTCTCAGAATGGCTTCATTGTCCCTCCGCCCCCGGAGAAGAGCCTCATAGGGATGACAAAAGTG 666
Query 667 AAAGTTGGGAAGGAAGATTCTTCTTCTGCAGAATTTCTTGAAAAACGGAGGGCCGCTTTAGAAAGGTACCTTCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAGTTGGGAAGGAAGATTCTTCTTCTGCAGAATTTCTTGAAAAACGGAGGGCCGCTTTAGAAAGGTACCTTCA 740
Query 741 GAGGATTGTAAATCATCCTACCATGTTACAGGACCCTGACGTCAGAGAGTTCTTGGAAAAAGAAGAGCTGCCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAGGATTGTAAATCATCCTACCATGTTACAGGACCCTGACGTCAGAGAGTTCTTGGAAAAAGAAGAGCTGCCAC 814
Query 815 GTGCCGTGGGTACCCAGACATTGAGTGGTGCTGGTCTCCTCAAGATGTTCAACAAAGCCACAGATGCCGTCAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGCCGTGGGTACCCAGACATTGAGTGGTGCTGGTCTCCTCAAGATGTTCAACAAAGCCACAGATGCCGTCAGC 888
Query 889 AAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTTGAGGAGAAGCTCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTTGAGGAGAAGCTCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCA 962
Query 963 GCGCTTACGGAAACTGCATGCTGTTGTAGAAACTCTAGTCAACCATAGGAAAGAGCTAGCGCTGAACACAGCCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCGCTTACGGAAACTGCATGCTGTTGTAGAAACTCTAGTCAACCATAGGAAAGAGCTAGCGCTGAACACAGCCC 1036
Query 1037 AGTTTGCAAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCTGAGGACAACACGGCATTGTCACGGGCACTCTCCCAGCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGTTTGCAAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCTGAGGACAACACGGCATTGTCACGGGCACTCTCCCAGCTG 1110
Query 1111 GCTGAGGTGGAAGAAAAAATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACAATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTGAGGTGGAAGAAAAAATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACAATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAGCT 1184
Query 1185 CCTGAGTGACTACATTCGCCTCCTGGCCATAGTCCGCGCTGCCTTCGACCAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTGAGTGACTACATTCGCCTCCTGGCCATAGTCCGCGCTGCCTTCGACCAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCT 1258
Query 1259 GGCAGGATGCCCAAGCCACACTGCAGAAGAAGCGGGAGGCCGAGGCTCGGCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGCAGGATGCCCAAGCCACACTGCAGAAGAAGCGGGAGGCCGAGGCTCGGCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGAT 1332
Query 1333 AAGCTGCAGCAGGCCAAGGACGAGATCCTCGAGTGGGAGTCTCGGGTGACTCAATATGAAAGGGACTTCGAGAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGCTGCAGCAGGCCAAGGACGAGATCCTCGAGTGGGAGTCTCGGGTGACTCAATATGAAAGGGACTTCGAGAG 1406
Query 1407 GATTTCAACAGTGGTCCGAAAAGAAGTGATACGGTTTGAGAAAGAGAAATCCAAGGACTTCAAGAACCACGTGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GATTTCAACAGTGGTCCGAAAAGAAGTGATACGGTTTGAGAAAGAGAAATCCAAGGACTTCAAGAACCACGTGA 1480
Query 1481 TCAAGTACCTTGAGACACTCCTTTACTCACAGCAGCA-GCTGGCAA--AGTACTGGGAA----GCCT------- 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||..| ||| |||||| |.||
Sbjct 1481 TCAAGTACCTTGAGACACTCCTTTACTCACAGCAGCAGGCTGGGGAGCAGT--TGGGAATCAGGTCTGGAATAC 1552
Query 1541 TCC-----------TTCCTGAGGCA----AAGGCCATCTCC--------------------------------- 1566
||| ||.|..|||.| |||....||||.
Sbjct 1553 TCCTAACCAAGAAGTTGCCCAGGTATAGTAAGTTTTTCTCTACCGTTCACAAGTTTTGTGCTGCTGCTTCCCTC 1626
Query 1567 --------------------------------------------- 1566
Sbjct 1627 TGGAAATGGGGTTTCTTTCTCTCCGCCTACCTCAGCTACCTGTTC 1671