Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06992
- Subject:
- NM_009271.3
- Aligned Length:
- 1630
- Identities:
- 1452
- Gaps:
- 29
Alignment
Query 1 ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA 74
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGGCAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGACGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCTCGGAAAACGTGCA 74
Query 75 CGGCGCTGGC-GGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGC 147
||| ||| ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 75 CGG----GGCAGGGGGCGCCTTCCCGGCCTCACAGACACCGAGCAAGCCCGCCTCCGCCGACGGCCACCGCGGG 144
Query 148 CCCAGCGCGGCCTTCG---CCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT 218
||||||||.||||||| |.|||||| ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 CCCAGCGCCGCCTTCGTGCCGCCCGCG---GCCGAGCCCAAGCTCTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT 215
Query 219 CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTA 292
|||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 216 CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGGCCTCTGGCAGGTGGGGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCAC 289
Query 293 GGACGGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACAC---------------- 350
||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 290 GGACAGAGACTGACCTGTCCTTCAAGAAAGGGGAGCGGCTGCAGATTGTCAATAACACGAGGAAGGTGGATGTC 363
Query 351 --AGAGGGAGACTGGTGGCTGGCCCACTCGCTCAGCACAGGACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGC 422
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 364 AGAGAGGGAGACTGGTGGCTGGCACACTCGCTGAGCACGGGACAGACCGGTTACATCCCCAGCAACTATGTGGC 437
Query 423 GCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCAAGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGC 496
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct 438 GCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTACTTTGGCAAGATCACTAGACGGGAATCAGAGCGGCTGCTGC 511
Query 497 TCAATGCAGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAAAGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCA 570
||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 512 TCAACGCCGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGAGGGAGAGTGAGACCACAAAAGGTGCCTACTGCCTCTCT 585
Query 571 GTGTCTGACTTCGACAACGCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTT 644
||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 586 GTATCCGACTTCGACAATGCCAAGGGCCTAAATGTGAAACACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGTTT 659
Query 645 CTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGCTGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCC 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 660 CTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGCTCGTGGCTTACTACTCCAAACATGCTGATGGCC 733
Query 719 TGTGCCACCGCCTCACCACCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCGCAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAG 792
||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||.||||||
Sbjct 734 TGTGTCACCGCCTCACTACCGTATGTCCCACATCCAAGCCTCAGACCCAGGGATTGGCCAAGGATGCGTGGGAG 807
Query 793 ATCCCTCGGGAGTCGCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTG 866
|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 808 ATCCCCCGGGAGTCCCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGTTGCTTCGGAGAGGTGTGGATGGGGACCTG 881
Query 867 GAACGGTACCACCAGGGTGGCCATCAAAACCCTGAAGCCTGGCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGG 940
||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 GAACGGCACCACGAGGGTTGCCATCAAAACTCTGAAGCCAGGCACCATGTCCCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGG 955
Query 941 CCCAGGTCATGAAGAAGCTGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTAC 1014
||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 956 CCCAAGTCATGAAGAAACTGAGGCACGAGAAACTGGTGCAGCTGTATGCTGTGGTGTCGGAAGAACCCATTTAC 1029
Query 1015 ATCGTCACGGAGTACATGAGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCT 1088
||.||.||.||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|||||||
Sbjct 1030 ATTGTGACAGAGTACATGAACAAGGGGAGTCTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAAACGGGCAAATATTTGCGGCT 1103
Query 1089 GCCTCAGCTGGTGGACATGGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCATGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACC 1162
.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1104 ACCCCAGCTGGTGGACATGTCTGCTCAGATCGCTTCAGGCATGGCCTATGTGGAGCGGATGAACTATGTGCACC 1177
Query 1163 GGGACCTTCGTGCAGCCAACATCCTGGTGGGAGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGG 1236
||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1178 GGGACCTTCGAGCCGCCAATATCCTAGTAGGGGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGTTGGCCCGG 1251
Query 1237 CTCATTGAAGACAATGAGTACACGGCGCGGCAAGGTGCCAAATTCCCCATCAAGTGGACGGCTCCAGAAGCTGC 1310
|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1252 CTCATAGAAGACAACGAATACACAGCCCGGCAAGGTGCCAAATTCCCCATCAAGTGGACCGCCCCTGAAGCTGC 1325
Query 1311 CCTCTATGGCCGCTTCACCATCAAGTCGGACGTGTGGTCCTTCGGGATCCTGCTGACTGAGCTCACCACAAAGG 1384
.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1326 TCTGTACGGCAGGTTCACCATCAAGTCGGATGTGTGGTCCTTTGGGATTCTGCTGACCGAGCTCACCACTAAGG 1399
Query 1385 GACGGGTGCCCTACCCTGGGATGGTGAACCGCGAGGTGCTGGACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCCTGC 1458
||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1400 GAAGAGTGCCCTATCCTGGGATGGTGAACCGTGAGGTTCTGGACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCTTGT 1473
Query 1459 CCGCCGGAGTGTCCCGAGTCCCTGCACGACCTCATGTGCCAGTGCTGGCGGAAGGAGCCTGAGGAGCGGCCCAC 1532
||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1474 CCCCCCGAGTGCCCCGAGTCCCTGCATGACCTTATGTGCCAGTGCTGGCGGAAGGAGCCCGAGGAGCGGCCCAC 1547
Query 1533 CTTCGAGTACCTGCAGGCCTTCCTGGAGGACTACTTCACGTCCACCGAGCCCCAGTACCAGCCCGGGGAGAACC 1606
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 CTTCGAGTACCTGCAGGCCTTCCTGGAAGACTACTTTACGTCCACTGAGCCACAGTACCAGCCCGGGGAGAACC 1621
Query 1607 TC 1608
|.
Sbjct 1622 TA 1623