Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07000
- Subject:
- NM_001173525.1
- Aligned Length:
- 1615
- Identities:
- 1548
- Gaps:
- 62
Alignment
Query 1 ATGGAGGAATCTGTGAACCAAATGCAGCCACTGAATGAGAAGCAGATAGCCAATTCTCAGGATGGATATGTATG 74
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGAATCTGTAAACCAAATGCAGCCACTGAATGAGAAGCAGATAGCCAATTCTCAGGATGGATATGTATG 74
Query 75 GCAAGTCACTGACATGAATCGACTACACCGGTTCTTATGTTTCGGTTCTGAAGGTGGGACTTATTATATCAAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAAGTCACTGACATGAATCGACTACACCGGTTCTTATGTTTCGGTTCTGAAGGTGGGACTTATTATATCAAAG 148
Query 149 AACAGAAGTTGGGCCTTGAAAATGCTGAAGCTTTAATTAGATTGATTGAAGATGGCAGAGGATGTGAAGTGATA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAGAAGTTGGGCCTTGAAAATGCTGAAGCTTTAATTAGATTGATTGAAGATGGCAGAGGATGTGAAGTGATA 222
Query 223 CAAGAAATAAAGTCATTTAGTCAAGAAGGCAGAACCACAAAGCAAGAGCCTATGCTCTTTGCACTTGCCATTTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGAAATAAAGTCATTTAGTCAAGAAGGCAGAACCACAAAGCAAGAGCCTATGCTCTTTGCACTTGCCATTTG 296
Query 297 TTCCCAGTGCTCCGACATAAGCACAAAACAAGCAGCATTTAAAGCTGTTTCTGAAGTTTGTCGCATTCCTACCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCCCAGTGCTCCGACATAAGCACAAAACAAGCAGCATTTAAAGCTGTTTCTGAAGTTTGTCGCATTCCTACCC 370
Query 371 ATCTCTTTACTTTTATCCAGTTTAAGAAAGATCTGAAGGAAAGCATGAAATGTGGCATGTGGGGTCGTGCCCTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCTCTTTACTTTTATCCAGTTTAAGAAAGATCTGAAGGAAAGCATGAAATGTGGCATGTGGGGTCGTGCCCTC 444
Query 445 CGGAAGGCTATAGCGGACTGGTACAATGAGAAAGGTGGCATGGCCCTTGCTCTGGCAGTTACAAAATATAAACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGGAAGGCTATAGCGGACTGGTACAATGAGAAAGGTGGCATGGCCCTTGCTCTGGCAGTTACAAAATATAAACA 518
Query 519 GAGAAATGGCTGGTCTCACAAAGATCTATTAAGATTGTCACATCTTAAACCTTCCAGTGAAGGACTTGCAATTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAGAAATGGCTGGTCTCACAAAGATCTATTAAGATTGTCACATCTTAAACCTTCCAGTGAAGGACTTGCAATTG 592
Query 593 TGACCAAATATATTACAAAGGGCTGGAAAGAAGTTCATGAATTGTATAAAGAAAAAGCACTCTCTGTGGAGACT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGACCAAATATATTACAAAGGGCTGGAAAGAAGTTCATGAATTGTATAAAGAAAAAGCACTCTCTGTGGAGACT 666
Query 667 GAAAAATTATTAAAGTATCTGGAGGCTGTAGAGAAAGTGAAGCGCACAAGAGATGAGCTAGAAGTCATTCATCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAAAATTATTAAAGTATCTGGAGGCTGTAGAGAAAGTGAAGCGCACAAGAGATGAGCTAGAAGTCATTCATCT 740
Query 741 AATAGAAGAACATAGATTAGTTAGAGAACATCTTTTAACAAATCACTTAAAGTCTAAAGAGGTATGGAAGGCTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AATAGAAGAACATAGATTAGTTAGAGAACATCTTTTAACAAATCACTTAAAGTCTAAAGAGGTATGGAAGGCTT 814
Query 815 TGTTACAAGAAATGCCGCTTACTGCATTACTAAGGAATCTAGGAAAGATGACTGCTAATTCAGTACTTGAACCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGTTACAAGAAATGCCGCTTACTGCATTACTAAGGAATCTAGGAAAGATGACTGCTAATTCAGTACTTGAACCA 888
Query 889 GGAAATTCAGAAGTATCTTTAGTATGTGAAAAACTGTGTAATGAAAAACTATTAAAAAAGGCTCGTATACATCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAAATTCAGAAGTATCTTTAGTATGTGAAAAACTGTGTAATGAAAAACTATTAAAAAAGGCTCGTATACATCC 962
Query 963 ATTTCATATTTTGATCGCATTAGAAACTTACAAGACAGGTCATGGTCTCAGAGGGAAACTGAAGTGGCGCCCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTTCATATTTTGATCGCATTAGAAACTTACAAGACAGGTCATGGTCTCAGAGGGAAACTGAAGTGGCGCCCTG 1036
Query 1037 ATGAAGAAATTTTGAAAGCATTGGATGCTGCTTTTTATAAAACATTTAAGACAGTTGAACCAACTGGAAAACGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGAAGAAATTTTGAAAGCATTGGATGCTGCTTTTTATAAAACATTTAAGACAGTTGAACCAACTGGAAAACGT 1110
Query 1111 TTCTTACTAGCTGTTGATGTCAGTGCTTCTATGAACCAAAGAGTTTTGGGTAGTATACTCAACGCTAGTACAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTCTTACTAGCTGTTGATGTCAGTGCTTCTATGAACCAAAGAGTTTTGGGTAGTATACTCAACGCTAGTACAGT 1184
Query 1185 TGCTGCAGCAATGTGCATGGTTGTCACACGAACAGAAAAAGATTCTTATGTAGTTGCTTTTTCCGATGAAATGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCTGCAGCAATGTGCATGGTTGTCACACGAACAGAAAAAGATTCTTATGTAGTTGCTTTTTCCGATGAAATGG 1258
Query 1259 TACCATGTCCAGTGACTACAGATATGACCTTACAACAGGTTTTAATGGCTATGAGTCAGATCCCAGCAGGTGGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TACCATGTCCAGTGACTACAGATATGACCTTACAACAGGTTTTAATGGCTATGAGTCAGATCCCAGCAGGTGGA 1332
Query 1333 ACTGATTGCTCTCTTCCAATGATCTGGGCTCAGAAGACAAACACACCTGCTGATGTCTTCATTGTATTCACTGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTGATTGCTCTCTTCCAATGATCTGGGCTCAGAAGACAAACACACCTGCTGATGTCTTCATTGTATTCACTGA 1406
Query 1407 TAATGAGACCTTTGCTGGAGGTGTCCATCCTGCTATTGCTCTGAGGGAGTATCGAAAGAAAATGGATATTCCAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAATGAGACCTTTGCTGGAGGTGTCCATCCTGCTATTGCTCTGAGGGAGTATCGAAAGAAAATGGATATTCCAG 1480
Query 1481 CTAAATTGATTGTTTGTGGAATGACATCAAATGGTTTCACCATTGCAGACCCAGATGATAGAGGCA-TGTTGGA 1553
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|| |||...|
Sbjct 1481 CTAAATTGATTGTTTGTGGAATGACATCAAATGGTTTCACCATTGCAGACCCAGATGATAGAGACACTGTAAAA 1554
Query 1554 TATGTGCGGCTTTGATACTGGAGCTCTGGATGTAATTCGAAATTTCACATTAGATATGATT 1614
Sbjct 1555 ------------------------------------------------------------- 1554