Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07046
• Subject: NM_001145398.2
• Aligned Length: 917
• Identities: 776
• Gaps: 121

Alignment

Query   1  ATGTCCGACGCGGGCGGCGGAAAGAAGCCGCCTGTGGACCCGCAGGCAGGACCCGGTCCGGGGCCGGGGCGCGC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  AGCTGGGGAAAGGGGCCTGTCGGGGTCCTTCCCCCT--GGTCCTGAAGAAGCTGATGGAGAACCCCCCGC----  142
                     |.||.|.||              |||  ||||||.|||...|||.|||||.||.|.|.||    
Sbjct   1  ----------ATGGACATG--------------CCTGAGGTCCTCAAGTCCCTGCTGGAGCACTCTCTGCCTTG  50

Query 143  GC--GAGGCGCGCCTCGATAAGGAAAAGGGGAAGGAAAAGCTGGAGGAGGACGAGGCCGCAGCCGCCAGCACCA  214
           ||  |||..|.|....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  51  GCCAGAGAAGAGAACAGATAAGGAAAAGGGGAAGGAAAAGCTGGAGGAGGACGAGGCCGCAGCCGCCAGCACCA  124

Query 215  TGGCTGTCTCAGCCTCCCTCATGCCACCCATCTGGGACAAGACCATCCCATATGATGGCGAATCTTTCCACCTG  288
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125  TGGCTGTCTCAGCCTCCCTCATGCCACCCATCTGGGACAAGACCATCCCATATGATGGCGAATCTTTCCACCTG  198

Query 289  GAGTACATGGACCTGGATGAGTTCCTGCTGGAGAATGGCATCCCCGCCAGCCCCACCCACCTGGCCCACAACCT  362
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199  GAGTACATGGACCTGGATGAGTTCCTGCTGGAGAATGGCATCCCCGCCAGCCCCACCCACCTGGCCCACAACCT  272

Query 363  GCTGCTGCCTGTAGCAGAGCTAGAAGGGAAGGAGTCTGCCAGCTCTTCCACAGCATCCCCACCATCCTCCTCCA  436
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273  GCTGCTGCCTGTAGCAGAGCTAGAAGGGAAGGAGTCTGCCAGCTCTTCCACAGCATCCCCACCATCCTCCTCCA  346

Query 437  CTGCCATCTTTCAGCCCTCTGAAACTGTGTCCAGCACAGAATCTTCCCTGGAGAAGGAGAGGGAGACTCCCAGT  510
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 347  CTGCCATCTTTCAGCCCTCTGAAACCGTGTCCAGCACAGAATCTTCCCTGGAGAAGGAGAGGGAGACTCCCAGT  420

Query 511  CCCATCGACCCCAATTGTGTGGAAGTGGATGTGAACTTCAATCCGGACCCCGCCGACCTGGTGCTCTCCAGTGT  584
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421  CCCATCGACCCCAATTGTGTGGAAGTGGATGTGAACTTCAATCCGGACCCCGCCGACCTGGTGCTCTCCAGTGT  494

Query 585  GCCAGGCGGGGAGCTCTTCAACCCTCGGAAGCACAAGTTTGCTGAGGAGGACCTGAAGCCCCAGCCTATGATCA  658
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495  GCCAGGCGGGGAGCTCTTCAACCCTCGGAAGCACAAGTTTGCTGAGGAGGACCTGAAGCCCCAGCCTATGATCA  568

Query 659  AAAAGGCCAAGAAGGTCTTTGTCCCCGACGAGCAGAAGGATGAAAAGTACTGGACAAGACGCAAGAAGAACAAC  732
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569  AAAAGGCCAAGAAGGTCTTTGTCCCCGACGAGCAGAAGGATGAAAAGTACTGGACAAGACGCAAGAAGAACAAC  642

Query 733  GTGGCAGCTAAACGGTCACGGGATGCCCGGCGCCTGAAAGAGAATCAGATCACCATCCGGGCAGCCTTCCTGGA  806
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643  GTGGCAGCTAAACGGTCACGGGATGCCCGGCGCCTGAAAGAGAATCAGATCACCATCCGGGCAGCCTTCCTGGA  716

Query 807  GAAGGAGAACACAGCCCTGCGGACGGAGGTGGCCGAGCTACGCAAGGAGGTGGGCAAGTGCAAGACCATCGTGT  880
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717  GAAGGAGAACACAGCCCTGCGGACGGAGGTGGCCGAGCTACGCAAGGAGGTGGGCAAGTGCAAGACCATCGTGT  790

Query 881  CCAAGTATGAGACC---------------  894
           ||||||||||||||               
Sbjct 791  CCAAGTATGAGACCAAATACGGGCCCTTG  819