Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07108
• Subject: NM_006001.3
• Aligned Length: 1355
• Identities: 1140
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGCGTGAATGCATCTCAGTCCACGTGGGGCAGGCAGGTGTCCAGATGGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTATTG  74
            ||||||||.||.|||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct    1  ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CTTGGAACATGGGATTCAGCCTGATGGGCAGATGCCCAGTGACAAGACCATTGGTGGAGGGGACGACTCCTTCA  148
            |.||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  CCACCTTCTTCTGTGAAACTGGTGCTGGAAAACACGTACCCCGGGCAGTTTTTGTGGATCTGGAGCCTACGGTC  222
            .|||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAGATCCGAAATGG--CCCATACCGACAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTCATCACTGGGAAAGAGGAT  294
            .|.|||||..|.||.|..||  ||.|||  |.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATA--GGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGAT  294

Query  295  GCTGCCAACAACTATGCCCGTGGTCACTATACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCCAGTGCTGGATCGGATCCG  368
            ||.|||||.||.||.|||.|.||.||.||.|||||.||||||||||||.|.||||..||.|||||.||||||||
Sbjct  295  GCGGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCG  368

Query  369  CAAGCTGTCTGACCAGTGCACAGGACTTCAGGGCTTCCTGGTGTTCCACAGCTTTGGTGGGGGCACTGGCTCTG  442
            |||.|||.|.||.|.||||||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  369  CAAACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTG  442

Query  443  GCTTCACCTCACTCCTGATGGAGCGGCTCTCTGTTGACTATGGCAAGAAATCCAAGCTGGAATTCTCCATCTAC  516
            |.|||.|.||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||..||||.|||
Sbjct  443  GGTTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTAC  516

Query  517  CCAGCCCCCCAGGTGTCTACAGCCGTGGTCGAGCCCTACAACTCTATCCTGACCACCCACACCACCCTGGAGCA  590
            ||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  517  CCAGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACA  590

Query  591  CTCAGACTGTGCCTTCATGGTGGACAACGAAGCAATCTATGACATCTGCCGCCGCAACCTAGACATCGAGCGCC  664
            .||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  591  TTCTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTC  664

Query  665  CAACCTACACCAACCTCAATCGCCTCATTAGCCAAATTGTCTCCTCCATCACAGCTTCTCTGCGCTTTGACGGG  738
            |.||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  665  CCACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGG  738

Query  739  GCCCTCAATGTGGACCTGACAGAGTTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCTCGCATCCACTTCCCCCTGGCCAC  812
            |||||.|||||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GCCCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCAC  812

Query  813  CTATGCACCAGTCATCTCTGCAGAAAAGGCATACCACGAGCAGCTGTCGGTGGCAGAGATCACCAATGCCTGCT  886
            |||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  813  CTACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCT  886

Query  887  TTGAGCCTGCCAACCAGATGGTAAAGTGTGATCCCCGGCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCCTGCTGTACCGT  960
            |.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|.
Sbjct  887  TCGAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGG  960

Query  961  GGAGATGTGGTGCCCAAGGATGTCAACGCTGCCATTGCCGCCATCAAGACCAAGCGCAGCATTCAGTTTGTGGA  1034
            ||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||.|||.||||||||.||
Sbjct  961  GGGGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGA  1034

Query 1035  CTGGTGCCCCACAGGCTTCAAGGTTGGTATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGGGGTGACCTGGCCA  1108
            .||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1035  TTGGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCA  1108

Query 1109  AGGTGCAGCGTGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACGACCGCCATCGCCGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCACAAG  1182
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1109  AGGTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAG  1182

Query 1183  TTCGACCTGATGTATGCCAAGAGGGCGTTTGTGCACTGGTATGTGGGTGAGGGCATGGAGGAGGGTGAGTTCTC  1256
            |||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1183  TTCGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTC  1256

Query 1257  CGAGGCCCGTGAGGATATGGCTGCCCTGGAGAAGGATTATGAGGAGGTGGGCATCGACTCCTATGAGGACGAGG  1330
            .||||||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||...||.|.|||||
Sbjct 1257  TGAGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCCGAGG  1330

Query 1331  ATGAGGGAGAAG----AG-----  1344
            .|||   |||||    ||     
Sbjct 1331  CTGA---AGAAGGTGAAGAATAC  1350