Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07108
• Subject: NM_080386.4
• Aligned Length: 1354
• Identities: 1136
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGCGTGAATGCATCTCAGTCCACGTGGGGCAGGCAGGTGTCCAGATGGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTATTG  74
            |||||.||.||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CTTGGAACATGGGATTCAGCCTGATGGGCAGATGCCCAGTGACAAGACCATTGGTGGAGGGGACGACTCCTTCA  148
            |.|.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGCCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  CCACCTTCTTCTGTGAAACTGGTGCTGGAAAACACGTACCCCGGGCAGTTTTTGTGGATCTGGAGCCTACGGTC  222
            .|||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAGATCCG-AAATGGCCCATACCGACAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTCATCACTGGGAAAGAGGATG  295
            .|.|||||..|.|| |.|.||.|| |||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACC-TACAGGCAGCTCTTCCACCCGGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATG  295

Query  296  CTGCCAACAACTATGCCCGTGGTCACTATACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCCAGTGCTGGATCGGATCCGC  369
            |.|||||.||.||.|||.|.||.||.||.|||||.|||||||||||..||||||.|||.|||||.|||||||||
Sbjct  296  CAGCCAATAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGC  369

Query  370  AAGCTGTCTGACCAGTGCACAGGACTTCAGGGCTTCCTGGTGTTCCACAGCTTTGGTGGGGGCACTGGCTCTGG  443
            ||.|||.|.||.|.||||||||||||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  370  AAACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGG  443

Query  444  CTTCACCTCACTCCTGATGGAGCGGCTCTCTGTTGACTATGGCAAGAAATCCAAGCTGGAATTCTCCATCTACC  517
            .|||.|.||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||..||||.||||
Sbjct  444  GTTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACC  517

Query  518  CAGCCCCCCAGGTGTCTACAGCCGTGGTCGAGCCCTACAACTCTATCCTGACCACCCACACCACCCTGGAGCAC  591
            |||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  518  CAGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACAT  591

Query  592  TCAGACTGTGCCTTCATGGTGGACAACGAAGCAATCTATGACATCTGCCGCCGCAACCTAGACATCGAGCGCCC  665
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  592  TCTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCC  665

Query  666  AACCTACACCAACCTCAATCGCCTCATTAGCCAAATTGTCTCCTCCATCACAGCTTCTCTGCGCTTTGACGGGG  739
            .||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct  666  CACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACAGCCTCCCTGCGATTTGATGGGG  739

Query  740  CCCTCAATGTGGACCTGACAGAGTTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCTCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACC  813
            ||||.|||||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  CCCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACC  813

Query  814  TATGCACCAGTCATCTCTGCAGAAAAGGCATACCACGAGCAGCTGTCGGTGGCAGAGATCACCAATGCCTGCTT  887
            |||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TATGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTT  887

Query  888  TGAGCCTGCCAACCAGATGGTAAAGTGTGATCCCCGGCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCCTGCTGTACCGTG  961
            .|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|.|
Sbjct  888  CGAGCCAGCCAATCAAATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGG  961

Query  962  GAGATGTGGTGCCCAAGGATGTCAACGCTGCCATTGCCGCCATCAAGACCAAGCGCAGCATTCAGTTTGTGGAC  1035
            |.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.
Sbjct  962  GGGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTGGAT  1035

Query 1036  TGGTGCCCCACAGGCTTCAAGGTTGGTATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGGGGTGACCTGGCCAA  1109
            ||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1036  TGGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAA  1109

Query 1110  GGTGCAGCGTGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACGACCGCCATCGCCGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCACAAGT  1183
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1110  GGTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCATAAGT  1183

Query 1184  TCGACCTGATGTATGCCAAGAGGGCGTTTGTGCACTGGTATGTGGGTGAGGGCATGGAGGAGGGTGAGTTCTCC  1257
            ||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1184  TCGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCT  1257

Query 1258  GAGGCCCGTGAGGATATGGCTGCCCTGGAGAAGGATTATGAGGAGGTGGGCATCGACTCCTATGAGGACGAGGA  1331
            ||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||...||.|..||||.
Sbjct 1258  GAGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGC  1331

Query 1332  TGAGGGAGAAG----AG-----  1344
            |||   |||||    ||     
Sbjct 1332  TGA---AGAAGGCGAAGAATAC  1350