Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07108
Subject:
NM_207312.3
Aligned Length:
1354
Identities:
1128
Gaps:
14

Alignment

Query    1  ATGCGTGAATGCATCTCAGTCCACGTGGGGCAGGCAGGTGTCCAGATGGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTATTG  74
            |||||.||.||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CTTGGAACATGGGATTCAGCCTGATGGGCAGATGCCCAGTGACAAGACCATTGGTGGAGGGGACGACTCCTTCA  148
            |.|.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  CCACCTTCTTCTGTGAAACTGGTGCTGGAAAACACGTACCCCGGGCAGTTTTTGTGGATCTGGAGCCTACGGTC  222
            .|||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAGATCCG-AAATGGCCCATACCGACAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTCATCACTGGGAAAGAGGATG  295
            .|.|||||..|.|| |.|.||.|| |||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACC-TACAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATG  295

Query  296  CTGCCAACAACTATGCCCGTGGTCACTATACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCCAGTGCTGGATCGGATCCGC  369
            |.||||..||.||.|||.|.||.||.||.|||||.|||||||||||..||||||.|||.|||||.|||||||||
Sbjct  296  CAGCCAGTAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGC  369

Query  370  AAGCTGTCTGACCAGTGCACAGGACTTCAGGGCTTCCTGGTGTTCCACAGCTTTGGTGGGGGCACTGGCTCTGG  443
            ||.|||.|.||.|.||||||||||||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  370  AAACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGG  443

Query  444  CTTCACCTCACTCCTGATGGAGCGGCTCTCTGTTGACTATGGCAAGAAATCCAAGCTGGAATTCTCCATCTACC  517
            .|||.|.||.||.||.||||||||||||||.||.||.||..|||||||.||||||||.||.||..||||.||||
Sbjct  444  GTTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACAGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACC  517

Query  518  CAGCCCCCCAGGTGTCTACAGCCGTGGTCGAGCCCTACAACTCTATCCTGACCACCCACACCACCCTGGAGCAC  591
            |||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  518  CAGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTAACCACCCACACGACCCTGGAACAT  591

Query  592  TCAGACTGTGCCTTCATGGTGGACAACGAAGCAATCTATGACATCTGCCGCCGCAACCTAGACATCGAGCGCCC  665
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  592  TCTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCC  665

Query  666  AACCTACACCAACCTCAATCGCCTCATTAGCCAAATTGTCTCCTCCATCACAGCTTCTCTGCGCTTTGACGGGG  739
            .||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct  666  CACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGATGGGG  739

Query  740  CCCTCAATGTGGACCTGACAGAGTTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCTCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACC  813
            ||||.|||||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  CCCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTCGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACC  813

Query  814  TATGCACCAGTCATCTCTGCAGAAAAGGCATACCACGAGCAGCTGTCGGTGGCAGAGATCACCAATGCCTGCTT  887
            ||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TACGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTT  887

Query  888  TGAGCCTGCCAACCAGATGGTAAAGTGTGATCCCCGGCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCCTGCTGTACCGTG  961
            .|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||.||.|||||.|.|
Sbjct  888  CGAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCATGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGG  961

Query  962  GAGATGTGGTGCCCAAGGATGTCAACGCTGCCATTGCCGCCATCAAGACCAAGCGCAGCATTCAGTTTGTGGAC  1035
            |.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||.||||||||||||||||||..||.|||||||||||.
Sbjct  962  GGGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAATGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACTATCCAGTTTGTGGAT  1035

Query 1036  TGGTGCCCCACAGGCTTCAAGGTTGGTATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGGGGTGACCTGGCCAA  1109
            ||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1036  TGGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAA  1109

Query 1110  GGTGCAGCGTGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACGACCGCCATCGCCGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCACAAGT  1183
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1110  GGTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGTCCATAAGT  1183

Query 1184  TCGACCTGATGTATGCCAAGAGGGCGTTTGTGCACTGGTATGTGGGTGAGGGCATGGAGGAGGGTGAGTTCTCC  1257
            ||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1184  TCGATCTCATGTATGCCAAGTGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCT  1257

Query 1258  GAGGCCCGTGAGGATATGGCTGCCCTGGAGAAGGATTATGAGGAGGTGGGCATCGACTCCTATGAGGACGAGGA  1331
            ||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||||.|||.|||||||||.|.||.|||...||.|..||||.
Sbjct 1258  GAGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTGTGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGC  1331

Query 1332  TGAGGGAGAAG----AG-----  1344
            |||   |||||    ||     
Sbjct 1332  TGA---AGAAGGCGAAGCATAC  1350