Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07117
• Subject: XM_006537785.3
• Aligned Length: 1182
• Identities: 1007
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGCTGGATCTGGCCTTGGAGGGAATGGCCGTCTTCGGGTTCGTCCTCTTCTTGGTGCTGTGGCTGAT  74
            ||||||||||||||.||||||..|||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCTGCTGGACCTGGCCCAGGAGGGAATGGCCTTGTTCGGCTTCGTGCTCTTCGTGGTGCTGTGGCTGAT  74

Query   75  GCATTTCATGGCTATCATCTACACCCGATTACACCTCAACAAGAAGGCAACTGACAAACAGCCTTATAGCAAGC  148
            ||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  GCATTTCATGTCCATCATCTACACCCGGTTACACCTCAACAAGAAGGCAACAGACAAACAGCCGTATAGCAAGC  148

Query  149  TCCCAGGTGTCTCTCTTCTGAAACCACTGAAAGGGGTAGATCCTAACTTAATCAACAACCTGGAAACATTCTTT  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  149  TCCCTGGTGTCTCTCTTCTGAAGCCACTGAAGGGGGTGGATCCTAACCTAATCAACAACTTGGAGACATTCTTT  222

Query  223  GAATTGGATTATCCCAAATATGAAGTGCTCCTTTGTGTACAAGATCATGATGATCCAGCCATTGATGTATGTAA  296
            |||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACTGGATTATCCCAAATATGAAGTACTCCTTTGTGTACAAGATCATGATGATCCAGCCATTGATGTATGTAA  296

Query  297  GAAGCTTCTTGGAAAATATCCAAATGTTGATGCTAGATTGTTTATAGGTGGCAAAAAAGTTGGCATTAATCCTA  370
            |||..|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  GAAATTGCTTGGAAAATACCCAAATGTCGATGCTAGATTATTTATAGGTGGCAAAAAGGTTGGCATTAACCCTA  370

Query  371  AAATTAATAATTTAATGCCAGGATATGAAGTTGCAAAGTATGATCTTATATGGATTTGTGATAGTGGAATAAGA  444
            |||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAATTAATAATTTGATGCCAGCATATGAAGTTGCAAAATATGATCTCATATGGATTTGTGATAGTGGAATAAGA  444

Query  445  GTAATTCCAGATACACTTACTGACATGGTGAATCAAATGACAGAAAAAGTAGGCTTGGTTCACGGGCTGCCTTA  518
            ||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  445  GTCATCCCAGACACATTAACTGACATGGTGAATCAGATGACAGAGAAAGTGGGGTTGGTCCACGGGCTGCCGTA  518

Query  519  CGTAGCAGACAGACAGGGCTTTGCTGCCACCTTAGAGCAGGTATATTTTGGAACTTCACATCCAAGATACTATA  592
            .|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  519  TGTAGCCGACAGACAAGGCTTTGCTGCCACCTTAGAGCAGGTATATTTTGGAACTTCACACCCAAGATCCTATA  592

Query  593  TCTCTGCCAATGTAACTGGTTTCAAATGTGTGACAGGAATGTCTTGTTTAATGAGAAAAGATGTGTTGGATCAA  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.
Sbjct  593  TCTCTGCCAATGTAACTGGCTTCAAATGTGTGACGGGGATGTCTTGTTTGATGAGGAAGGATGTGCTAGATCAG  666

Query  667  GCAGGAGGACTTATAGCTTTTGCTCAGTACATTGCCGAAGATTACTTTATGGCCAAAGCGATAGCTGACCGAGG  740
            ||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||    
Sbjct  667  GCAGGAGGGCTCATAGCCTTTGCTCAGTACATTGCTGAAGATTACTTTATGGCCAAAGCAATAGCCGACC----  736

Query  741  TTGGAGGTTTGCAATGTCCACTCAAGTTGCAATGCAAAACTCTGGCTCATATTCAATTTCTCAGTTTCAATCCA  814
                                                                                      
Sbjct  737  --------------------------------------------------------------------------  736

Query  815  GAATGATCAGGTGGACCAAACTACGAATTAACATGCTTCCTGCTACAATAATTTGTGAGCCAATTTCAGAATGC  888
                     |||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  ---------GGTGGACCAAATTGAGAATTAACATGCTTCCTGCTACAATAATTTGTGAGCCAATTTCAGAATGC  801

Query  889  TTTGTTGCCAGTTTAATTATTGGATGGGCAGCCCACCATGTGTTCAGATGGGATATTATGGTATTTTTCATGTG  962
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  802  TTTGTTGCCAGTTTAATTATTGGGTGGGCAGCCCACCATGTATTCAGATGGGATATCATGGTCTTCTTCATGTG  875

Query  963  TCATTGCCTGGCATGGTTTATATTTGACTACATTCAACTCAGGGGTGTCCAGGGTGGCACACTGTGTTTTTCAA  1036
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  CCACTGCCTGGCATGGTTTATATTTGACTACATTCAACTCAGGGGTGTCCAGGGTGGCACACTGTGTTTTTCAA  949

Query 1037  AACTTGATTATGCAGTCGCCTGGTTCATCCGCGAATCCATGACAATATACATTTTTTTGTCTGCATTATGGGAC  1110
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||
Sbjct  950  AACTTGATTATGCTGTGGCCTGGTTCATCCGTGAATCCATGACAATCTACATTTTCCTGTCGGCATTATGGGAC  1023

Query 1111  CCAACTATAAGCTGGAGAACTGGTCGCTACAGATTACGCTGTGGGGGTACAGCAGAGGAAATCCTAGATGTA  1182
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1024  CCGACTATAAGCTGGAGAACTGGTCGCTACAGGTTACGCTGTGGGGGGACAGCAGAGGAGATCCTGGATGTG  1095