Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07140
- Subject:
- NM_001354726.1
- Aligned Length:
- 2820
- Identities:
- 2239
- Gaps:
- 579
Alignment
Query 1 ATGGCTCGGAAACGCGCGGCCGGCGGGGAGCCGCGGGGACGCGAACTGCGCAGCCAGAAATCCAAGGCCAAGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAGGCCCGGCGTGAGGAGGAGGAGGAGGATGCCTTTGAAGATGAGAAACCCCCAAAGAAGAGCCTTCTCTCCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AAGTTTCACAAGGAAAGAGGAAAAGAGGCTGCAGTCATCCTGGGGGTTCAGCAGATGGTCCAGCAAAAAAGAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTGGCCAAGGTGACTGTTAAATCTGAAAACCTCAAGGTTATAAAGGATGAAGCCCTCAGCGATGGGGATGACCT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAGGGACTTTCCAAGTGACCTCAAGAAGGCACACCATCTGAAGAGAGGGGCTACCATGAATGAAGACAGCAATG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AAGAAGAGGAAGAAAGTGAAAATGATTGGGAAGAGGTTGAAGAACTTAGTGAGCCTGTGCTGGGTGACGTGAGA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GAAAGTACAGCCTTCTCTCGATCTCTTCTGCCTGTGAAGCCAGTGGAGATAGAGATTGAAACGCCAGAGCAGGC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GAAGACAAGAGAAAGAAGTGAAAAGATAAAACTGGAGTTTGAGACATATCTTCGGAGGGCGATGAAACGTTTCA 592
|||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------ATGAAACGTTTCA 13
Query 593 ATAAAGGGGTCCATGAGGACACACACAAGGTTCACCTTCTCTGCCTGCTAGCAAATGGCTTCTATCGAAATAAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 ATAAAGGGGTCCATGAGGACACACACAAGGTTCACCTTCTCTGCCTGCTAGCAAATGGCTTCTATCGAAATAAC 87
Query 667 ATCTGCAGCCAGCCAGATCTGCATGCTATTGGCCTGTCCATCATCCCAGCCCGCTTTACCAGAGTGCTGCCTCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 ATCTGCAGCCAGCCAGATCTGCATGCTATTGGCCTGTCCATCATCCCAGCCCGCTTTACCAGAGTGCTGCCTCG 161
Query 741 AGATGTGGACACCTACTACCTCTCAAACCTGGTGAAGTGGTTCATTGGAACATTTACAGTTAATGCAGAACTTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 AGATGTGGACACCTACTACCTCTCAAACCTGGTGAAGTGGTTCATTGGAACATTTACAGTTAATGCAGAACTTT 235
Query 815 CAGCCAGTGAACAAGATAACCTGCAGACTACATTGGAAAGGAGATTTGCTATTTACTCTGCTCGAGATGATGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 CAGCCAGTGAACAAGATAACCTGCAGACTACATTGGAAAGGAGATTTGCTATTTACTCTGCTCGAGATGATGAG 309
Query 889 GAATTGGTCCATATATTCTTACTGATTCTCCGGGCTCTGCAGCTCTTGACCCGGCTGGTATTGTCTCTACAGCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 GAATTGGTCCATATATTCTTACTGATTCTCCGGGCTCTGCAGCTCTTGACCCGGCTGGTATTGTCTCTACAGCC 383
Query 963 AATTCCTCTGAAGTCAGCAACAGCAAAGGGAAAGAAACCTTCCAAGGAAAGATTGACTGCGGATCCAGGAGGCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 AATTCCTCTGAAGTCAGCAACAGCAAAGGGAAAGAAACCTTCCAAGGAAAGATTGACTGCGGATCCAGGAGGCT 457
Query 1037 CCTCAGAAACTTCCAGCCAAGTTCTAGAAAACCACACCAAACCAAAGACCAGCAAAGGAACCAAACAAGAGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 CCTCAGAAACTTCCAGCCAAGTTCTAGAAAACCACACCAAACCAAAGACCAGCAAAGGAACCAAACAAGAGGAA 531
Query 1111 ACCTTTGCTAAGGGCACCTGCAGGCCAAGTGCCAAAGGGAAGAGGAACAAGGGAGGCAGAAAGAAACGGAGCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 ACCTTTGCTAAGGGCACCTGCAGGCCAAGTGCCAAAGGGAAGAGGAACAAGGGAGGCAGAAAGAAACGGAGCAA 605
Query 1185 GCCCTCCTCCAGCGAGGAAGATGAGGGCCCAGGAGACAAGCAGGAGAAGGCAACCCAGCGACGTCCGCATGGCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 GCCCTCCTCCAGCGAGGAAGATGAGGGCCCAGGAGACAAGCAGGAGAAGGCAACCCAGCGACGTCCGCATGGCC 679
Query 1259 GGGAGCGGCGGGTGGCCTCCAGGGTGTCTTATAAAGAGGAGAGTGGGAGTGATGAGGCTGGCAGCGGCTCTGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 GGGAGCGGCGGGTGGCCTCCAGGGTGTCTTATAAAGAGGAGAGTGGGAGTGATGAGGCTGGCAGCGGCTCTGAT 753
Query 1333 TTTGAGCTCTCCAGTGGAGAAGCCTCTGATCCCTCTGATGAGGATTCCGAACCTGGCCCTCCAAAGCAGAGGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 TTTGAGCTCTCCAGTGGAGAAGCCTCTGATCCCTCTGATGAGGATTCCGAACCTGGCCCTCCAAAGCAGAGGAA 827
Query 1407 AGCCCCCGCTCCTCAGAGGACAAAGGCTGGGTCCAAGAGTGCCTCCAGGACCCATCGTGGGAGCCATCGTAAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 AGCCCCCGCTCCTCAGAGGACAAAGGCTGGGTCCAAGAGTGCCTCCAGGACCCATCGTGGGAGCCATCGTAAGG 901
Query 1481 ACCCAAGCTTGCCAGCGGCATCCTCAAGCTCTTCAAGCAGTAAAAGAGGCAAGAAAATGTGCAGCGATGGTGAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 ACCCAAGCTTGCCAGCGGCATCCTCAAGCTCTTCAAGCAGTAAAAGAGGCAAGAAAATGTGCAGCGATGGTGAG 975
Query 1555 AAGGCAGAAAAAAGAAGCATAGCTGGTATAGACCAGTGGCTAGAGGTGTTCTGTGAGCAGGAGGAAAAGTGGGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 AAGGCAGAAAAAAGAAGCATAGCTGGTATAGACCAGTGGCTAGAGGTGTTCTGTGAGCAGGAGGAAAAGTGGGT 1049
Query 1629 ATGTGTAGACTGTGTGCACGGTGTGGTGGGCCAGCCTCTGACCTGTTACAAGTACGCCACCAAGCCCATGACCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 ATGTGTAGACTGTGTGCACGGTGTGGTGGGCCAGCCTCTGACCTGTTACAAGTACGCCACCAAGCCCATGACCT 1123
Query 1703 ATGTGGTGGGCATTGACAGTGACGGCTGGGTCCGAGATGTCACACAGAGGTACGACCCAGTCTGGATGACAGTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 ATGTGGTGGGCATTGACAGTGACGGCTGGGTCCGAGATGTCACACAGAGGTACGACCCAGTCTGGATGACAGTG 1197
Query 1777 ACCCGCAAGTGCCGGGTTGATGCTGAGTGGTGGGCCGAGACCTTGAGACCATACCAGAGCCCATTTATGGACAG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 ACCCGCAAGTGCCGGGTTGATGCTGAGTGGTGGGCCGAGACCTTGAGACCATACCAGAGCCCATTTATGGACAG 1271
Query 1851 GGAGAAGAAAGAAGACTTGGAGTTTCAGGCAAAACACATGGACCAGCCTTTGCCCACTGCCATTGGCTTATATA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272 GGAGAAGAAAGAAGACTTGGAGTTTCAGGCAAAACACATGGACCAGCCTTTGCCCACTGCCATTGGCTTATATA 1345
Query 1925 AGAACCACCCTCTGTATGCCCTGAAGCGGCATCTCCTGAAATATGAGGCCATCTATCCCGAGACAGCTGCCATC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 AGAACCACCCTCTGTATGCCCTGAAGCGGCATCTCCTGAAATATGAGGCCATCTATCCCGAGACAGCTGCCATC 1419
Query 1999 CTTGGGTATTGTCGTGGAGAAGCGGTCTACTCCAGGGATTGTGTGCACACTCTGCATTCCAGAGACACGTGGCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1420 CTTGGGTATTGTCGTGGAGAAGCGGTCTACTCCAGGGATTGTGTGCACACTCTGCATTCCAGGGACACGTGGCT 1493
Query 2073 GAAGAAAGCAAGAGTGGTGAGGCTTGGAGAAGTACCCTACAAGATGGTGAAAGGCTTTTCTAACCGTGCTCGGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 GAAGAAAGCAAGAGTGGTGAGGCTTGGAGAAGTACCCTACAAGATGGTGAAAGGCTTTTCTAACCGTGCTCGGA 1567
Query 2147 AAGCCCGACTTGCTGAGCCCCAGCTGCGGGAAGAAAATGACCTGGGCCTGTTTGGCTACTGGCAGACAGAGGAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568 AAGCCCGACTTGCTGAGCCCCAGCTGCGGGAAGAAAATGACCTGGGCCTGTTTGGCTACTGGCAGACAGAGGAG 1641
Query 2221 TATCAGCCCCCAGTGGCCGTGGACGGGAAGGTGCCCCGGAACGAGTTTGGGAATGTGTACCTCTTCCTGCCCAG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1642 TATCAGCCCCCAGTGGCCGTGGACGGGAAGGTGCCCCGGAACGAGTTTGGGAATGTGTACCTCTTCCTGCCCAG 1715
Query 2295 CATGATGCCTATTGGCTGTGTCCAGCTGAACCTGCCCAATCTACACCGCGTGGCCCGCAAGCTGGACATCGACT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 CATGATGCCTATTGGCTGTGTCCAGCTGAACCTGCCCAATCTACACCGCGTGGCCCGCAAGCTGGACATCGACT 1789
Query 2369 GTGTCCAGGCCATCACTGGCTTTGATTTCCATGGCGGCTACTCCCATCCCGTGACTGATGGATACATCGTCTGC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 GTGTCCAGGCCATCACTGGCTTTGATTTCCATGGCGGCTACTCCCATCCCGTGACTGATGGATACATCGTCTGC 1863
Query 2443 GAGGAATTCAAAGACGTGCTCCTGACTGCCTGGGAAAATGAGCAGGCAGTCATTGAAAGGAAGGAGAAGGAGAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1864 GAGGAATTCAAAGACGTGCTCCTGACTGCCTGGGAAAATGAGCAGGCAGTCATTGAAAGGAAGGAGAAGGAGAA 1937
Query 2517 AAAGGAGAAGCGGGCTCTAGGGAACTGGAAGTTGCTGGCCAAAGGTCTGCTCATCAGGGAGAGGCTGAAGCGTC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1938 AAAGGAGAAGCGGGCTCTAGGGAACTGGAAGTTGCTGGCCAAAGGTCTGCTCATCAGGGAGAGGCTGAAGCGTC 2011
Query 2591 GCTACGGGCCCAAGAGTGAGGCAGCAGCTCCCCACACAGATGCAGGAGGTGGACTCTCTTCTGATGAAGAGGAG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2012 GCTACGGGCCCAAGAGTGAGGCAGCAGCTCCCCACACAGATGCAGGAGGTGGACTCTCTTCTGATGAAGAGGAG 2085
Query 2665 GGGACCAGCTCTCAAGCAGAAGCGGCCAGGATACTGGCTGCCTCCTGGCCTCAAAACCGAGAAGATGAAGAAAA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2086 GGGACCAGCTCTCAAGCAGAAGCGGCCAGGATACTGGCTGCCTCCTGGCCTCAAAACCGAGAAGATGAAGAAAA 2159
Query 2739 GCAGAAGCTGAAGGGTGGGCCCAAGAAGACCAAAAGGGAAAAGAAAGCAGCAGCTTCCCACCTGTTCCCATTTG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 GCAGAAGCTGAAGGGTGGGCCCAAGAAGACCAAAAGGGAAAAGAAAGCAGCAGCTTCCCACCTGTTCCCATTTG 2233
Query 2813 AGAAGCTG 2820
||.|||||
Sbjct 2234 AGCAGCTG 2241