Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07144
• Subject: NM_001282515.2
• Aligned Length: 1935
• Identities: 1889
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGTCGGTCTCCAGCGGCGACCAGATTCTGACAAAGCCAGAGACCGTGGACCGGAGGAGAAGTGCGGAAACGAC  74
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGTCTCCAGCGGCGTCCAGATTCTGACAAAGCCAGAGACCGTGGACCGGAGGAGAAGTGCGGAAACGAC  74

Query   75  CAAAGAGGCCGGGCGACCACTGGAGATGGCTGTGTCCGAGCCCGAGGCCAGCGCCGC-----------------  131
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct   75  CAAAGAGGCCGGGCGACCACTGGAGATGGCTGTGTCCGAGCCCGAGGCCAGCGCCGCGGTATCAGTAACATTCA  148

Query  132  ----------------------------GGAATGGAAGCAACTGGATCCTGCTCAGAGCAACCTGTATAATGAT  177
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACATGTGACTATGGCCTTTACCCAGAAGGAATGGAAGCAACTGGATCCTGCTCAGAGCAACCTGTATAATGAT  222

Query  178  GTGATGCTGGAGAACTACTGCAACCAAGCCTCAATGGGGTGTCAAGCTCCCAAACCAGACATGATCTCCAAGTT  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGATGCTGGAGAACTACTGCAACCAAGCCTCAATGGGGTGTCAAGCTCCCAAACCAGACATGATCTCCAAGTT  296

Query  252  GGAAAAAGGAGAAGCACCATGGTTGGGGAAGGGGAAAAGACCCAGTCAAGGTTGTCCAAGTAAAATAGCAAGAC  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAAAAAGGAGAAGCACCATGGTTGGGGAAGGGGAAAAGACCCAGTCAAGGTTGTCCAAGTAAAATAGCAAGAC  370

Query  326  CCAAGCAAAAAGAAACTGATGGAAAAGTCCAGAAAGATGATGACCAGCTTGAAAATATCCAGAAATCTCAAAAC  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAAGCAAAAAGAAACTGATGGAAAAGTCCAGAAAGATGATGACCAGCTTGAAAATATCCAGAAATCTCAAAAC  444

Query  400  AAACTCCTCAGGGAAGTTGCAGTCAAGAAGAAAACTCAAGCTAAGAAGAATGGCAGTGACTGTGGTTCACTGGG  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACTCCTCAGGGAAGTTGCAGTCAAGAAGAAAACTCAAGCTAAGAAGAATGGCAGTGACTGTGGTTCACTGGG  518

Query  474  GAAAAAAAATAATTTGCATAAAAAACATGTTCCTTCAAAGAAAAGGCTTCTTAAATTTGAGTCATGTGGAAAAA  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAAAAAATAATTTGCATAAAAAACATGTTCCTTCAAAGAAAAGGCTTCTTAAATTTGAGTCATGTGGAAAAA  592

Query  548  TTTTGAAACAGAATTTAGATTTACCTGATCACTCAAGAAACTGTGTAAAAAGGAAATCTGATGCAGCTAAAGAA  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTGAAACAGAATTTAGATTTACCTGATCACTCAAGAAACTGTGTAAAAAGGAAATCTGATGCAGCTAAAGAA  666

Query  622  CACAAGAAGTCATTCAACCATAGCTTATCTGATACAAGGAAAGGCAAAAAGCAAACTGGAAAGAAACATGAGAA  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACAAGAAGTCATTCAACCATAGCTTATCTGATACAAGGAAAGGCAAAAAGCAAACTGGAAAGAAACATGAGAA  740

Query  696  ATTATCCAGCCATAGCTCATCTGATAAGTGTAACAAAACTGGCAAAAAACATGACAAATTATGCTGTCATAGTT  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTATCCAGCCATAGCTCATCTGATAAGTGTAACAAAACTGGCAAAAAACATGACAAATTATGCTGTCATAGTT  814

Query  770  CATCCCATATTAAACAGGACAAAATTCAAACTGGAGAGAAACATGAGAAATCACCCAGCCTTAGCTCATCTACT  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATCCCATATTAAACAGGACAAAATTCAAACTGGAGAGAAACATGAGAAATCACCCAGCCTTAGCTCATCTACT  888

Query  844  AAGCATGAAAAACCTCAAGCTTGTGTGAAACCCTATGAATGTAATCAATGTGGAAAGGTTCTCAGCCATAAACA  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCATGAAAAACCTCAAGCTTGTGTGAAACCCTATGAATGTAATCAATGTGGAAAGGTTCTCAGCCATAAACA  962

Query  918  AGGACTCATTGACCATCAGAGAGTTCATACTGGGGAGAAACCATATGAATGTAATGAATGTGGGATAGCCTTTA  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGACTCATTGACCATCAGAGAGTTCATACTGGGGAGAAACCATATGAATGTAATGAATGTGGGATAGCCTTTA  1036

Query  992  GCCAAAAGTCACACCTTGTTGTACATCAGAGAACTCACACCGGAGAAAAACCATATGAATGTATTCAGTGTGGC  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCAAAAGTCACACCTTGTTGTACATCAGAGAACTCACACCGGAGAAAAACCATATGAATGTATTCAGTGTGGC  1110

Query 1066  AAAGCCCATGGTCATAAACATGCACTCACTGACCATCTAAGAATTCATACTGGAGAAAAGCCCTATGAATGTGC  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCCCATGGTCATAAACATGCACTCACTGACCATCTAAGAATTCATACTGGAGAAAAGCCCTATGAATGTGC  1184

Query 1140  TGAATGTGGGAAAACCTTCAGACACAGCTCAAACCTTATTCAACATGTGAGATCTCACACAGGTGAGAAGCCAT  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAATGTGGGAAAACCTTCAGACACAGCTCAAACCTTATTCAACATGTGAGATCTCACACAGGTGAGAAGCCAT  1258

Query 1214  ATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGTCTTTTAGGTATAACTCATCTCTTACCGAACATGTGAGAACACATACAGGT  1287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGTCTTTTAGGTATAACTCATCTCTTACCGAACATGTGAGAACACATACAGGT  1332

Query 1288  GAAATACCATATGAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAAGTATAGCTCATCCCTTACTAAACACATGAGAAT  1361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAATACCATATGAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAAGTATAGCTCATCCCTTACTAAACACATGAGAAT  1406

Query 1362  TCATACAGGTGAGAAACCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCAGCAAGAAGTCACACCTCATTATAC  1435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCATACAGGTGAGAAACCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCAGCAAGAAGTCACACCTCATTATAC  1480

Query 1436  ATCAAAGAACTCATACTAAGGAGAAACCTTATAAATGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTGGACATAGCTCATCT  1509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCAAAGAACTCATACTAAGGAGAAACCTTATAAATGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTGGACATAGCTCATCT  1554

Query 1510  CTTACTTACCATATGAGAACTCATACAGGTGAAAGTCCCTTTGAATGTAATCAATGTGGGAAAGGCTTTAAACA  1583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTTACTTACCATATGAGAACTCATACAGGTGAAAGTCCCTTTGAATGTAATCAATGTGGGAAAGGCTTTAAACA  1628

Query 1584  AATTGAAGGCCTTACTCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCGTATGAGTGTAATGAATGTGGGAAAG  1657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AATTGAAGGCCTTACTCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCGTATGAGTGTAATGAATGTGGGAAAG  1702

Query 1658  CCTTTAGCCAAAAGTCTCACCTCATTGTACATCAGAGAACTCATACTGGGGAGAAACCTTATGAATGTAACGAA  1731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTTTAGCCAAAAGTCTCACCTCATTGTACATCAGAGAACTCATACTGGGGAGAAACCTTATGAATGTAACGAA  1776

Query 1732  TGTGAAAAAGCCTTTAATGCAAAATCACAGCTTGTTATACATCAGCGATCCCACACTGGAGAAAAACCCTATGA  1805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGTGAAAAAGCCTTTAATGCAAAATCACAGCTTGTTATACATCAGCGATCCCACACTGGAGAAAAACCCTATGA  1850

Query 1806  ATGTAATGAATGTGGGAAAACTTTCAAACAAAATGCATCCCTAACCAAACATGTGAAAACTCATTCAGAAGATA  1879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATGTAATGAATGTGGGAAAACTTTCAAACAAAATGCATCCCTAACCAAACATGTGAAAACTCATTCAGAAGATA  1924

Query 1880  AATCTCATGAG  1890
            |||||||||||
Sbjct 1925  AATCTCATGAG  1935