Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07155
- Subject:
- NM_001256279.2
- Aligned Length:
- 1698
- Identities:
- 1597
- Gaps:
- 99
Alignment
Query 1 ATGGCCACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTG------------------------------------------ 32
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTGGGTAGTGCTGCTGAGGAGGAGCCTGCTAATGAGCTCAAGTGT 74
Query 33 ---------------------------------------------------------GGGATTATTGTCATTCA 49
|||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAGTTCGGGAATCTTCTGGGTGTTCCTTGGGCCCAGGGAAACAGTGCCCTGCCTGAGGGATTATTGTCATTCA 148
Query 50 AGGATATATCTATGGAGTTCACCTGGGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGAT 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGATATATCTATGGAGTTCACCTGGGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGAT 222
Query 124 GTGATATTGGAAAACTATCATAACCTGATATCAGTGGGGTATCATGGTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTT 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGATATTGGAAAACTATCATAACCTGATATCAGTGGGGTATCATGGTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTT 296
Query 198 GGAACAAGGAGAAGATCCATGGATAATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAGAGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAAT 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAACAAGGAGAAGATCCATGGATAATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAGAGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAAT 370
Query 272 GGTACCAGAACAATCAAGATGAGCTTGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAAT 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGTACCAGAACAATCAAGATGAGCTTGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAAT 444
Query 346 CTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAAGACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAAGACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGC 518
Query 420 TCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAGAATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATC 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAGAATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATC 592
Query 494 AAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAACTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTC 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAACTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTC 666
Query 568 ATTGTACATCTCAGAATTCATACAGGAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAA 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTGTACATCTCAGAATTCATACAGGAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAA 740
Query 642 GTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGAGTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCT 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGAGTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCT 814
Query 716 TCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGTCCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGT 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGTCCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGT 888
Query 790 GGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCACAGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATG 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCACAGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATG 962
Query 864 CAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAAC 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAAC 1036
Query 938 CCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACA 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACA 1110
Query 1012 GGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTGATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGG 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTGATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGG 1184
Query 1086 AGTTCACACAGGAAATAATCCTTATCAATGCGGCGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTG 1159
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGTTCACACAGGAAATAATCCTTATCAATGCGGTGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTG 1258
Query 1160 CACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGAGAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCA 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGAGAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCA 1332
Query 1234 TACCTTGTTATACATAGGAGAACACACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTG 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TACCTTGTTATACATAGGAGAACACACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTG 1406
Query 1308 TGGAAAATCACAGCTGATTATACATCAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAA 1381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGGAAAATCACAGCTGATTATACATCAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAA 1480
Query 1382 AAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACTTCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGT 1455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACTTCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGT 1554
Query 1456 GAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGAAGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACACTGGAGAGAAACCATG 1529
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555 GAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGAAGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACACCGGAGAGAAACCATG 1628
Query 1530 GAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCCTTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGAAGACTCATAAA 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCCTTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGAAGACTCATAAA 1698