Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07155
- Subject:
- NM_001256280.2
- Aligned Length:
- 1599
- Identities:
- 1501
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATGGCCACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTGGGGATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTGGGGATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTG 74
Query 75 GGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACC 148
Query 149 TGATATCAGTGGGGTATCATGGTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAAGATCCATGGATA 222
|||||||||||
Sbjct 149 TGATATCAGTG--------------------------------------------------------------- 159
Query 223 ATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAGAGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 160 ---------------------------------GATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCT 200
Query 297 TGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 TGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAA 274
Query 371 GACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 GACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAG 348
Query 445 AATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 AATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAA 422
Query 519 CTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 CTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAG 496
Query 593 GAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 GAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGA 570
Query 667 GTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 GTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGT 644
Query 741 CCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCAC 718
Query 815 AGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 AGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGT 792
Query 889 TTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 TTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAA 866
Query 963 AGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 AGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTG 940
Query 1037 ATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 ATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTAT 1014
Query 1111 CAATGCGGCGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGA 1184
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CAATGCGGTGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGA 1088
Query 1185 GAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACAC 1162
Query 1259 ACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 ACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACAT 1236
Query 1333 CAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 CAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACT 1310
Query 1407 TCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 TCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGA 1384
Query 1481 AGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACACTGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 AGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACACCGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCC 1458
Query 1555 TTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGAAGACTCATAAA 1599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459 TTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGAAGACTCATAAA 1503