Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07155
- Subject:
- XM_017019921.1
- Aligned Length:
- 1639
- Identities:
- 1590
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGGCCACCAGT------TTCCGGACAGCTTC---GTG--------------------------CTG-----GG 34
|||..|.|.||| |||.||| |.|||| ||| ||| ||
Sbjct 1 ATGAGCTCAAGTGTCAAGTTCGGGA-ATCTTCTGGGTGTTCCTTGGGCCCAGGGAAACAGTGCCCTGCCTGAGG 73
Query 35 GATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTGGGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAG 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 GATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTGGGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAG 147
Query 109 TACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACCTGATATCAGTGGGGTATCATGGTACCAAGCCTGA 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 TACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACCTGATATCAGTGGGGTATCATGGTACCAAGCCTGA 221
Query 183 CTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAAGATCCATGGATAATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAGAGCTGTCCAG 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 CTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAAGATCCATGGATAATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAGAGCTGTCCAG 295
Query 257 ATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCTTGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTG 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 ATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCTTGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTG 369
Query 331 TTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAAGACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTT 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 TTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAAGACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTT 443
Query 405 GACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAGAATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCAT 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAGAATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCAT 517
Query 479 ATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAACTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGT 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 ATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAACTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGT 591
Query 553 TGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAGGAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAG 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAGGAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAG 665
Query 627 AGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGAGTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGAGTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTG 739
Query 701 AGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGTCCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTAT 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 AGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGTCCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTAT 813
Query 775 GGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCACAGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCACAGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGT 887
Query 849 GAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTC 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTC 961
Query 923 ATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCAC 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 ATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCAC 1035
Query 997 ATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTGATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACT 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 ATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTGATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACT 1109
Query 1071 CATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTATCAATGCGGCGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGA 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTATCAATGCGGTGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGA 1183
Query 1145 AGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGAGAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCT 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 AGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGAGAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCT 1257
Query 1219 TTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACACACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTG 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACACACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTG 1331
Query 1293 TGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACATCAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAAT 1366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 TGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACATCAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAAT 1405
Query 1367 GCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACTTCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACTTCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAA 1479
Query 1441 CCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGAAGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACAC 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 CCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGAAGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACAC 1553
Query 1515 TGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCCTTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGA 1588
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 CGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCCTTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGA 1627
Query 1589 AGACTCATAAA 1599
|||||||||||
Sbjct 1628 AGACTCATAAA 1638