Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07167
- Subject:
- XM_017027232.2
- Aligned Length:
- 1873
- Identities:
- 1399
- Gaps:
- 281
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGACCAC 8
||||||||
Sbjct 1 ATGATTTCACCTTCACTTGAACTGCTTCATTCAGGACTCTGCAAATTCCCTGAAGTAGAAGGAAAAATGACCAC 74
Query 9 ATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG 82
||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATTCAAAGAGGCAGTGACATTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG 148
Query 83 CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTC 156
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||
Sbjct 149 CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTAGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATCAACCATTC 222
Query 157 CACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAA-GAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGA 229
|||||||||||||.|||||| ||.|||||| |||||||||||||.||||..||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 223 CACCAAGATACTTTCCACTT-CTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGAAGATGAAGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGA 295
Query 230 ATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAG 303
|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 296 ATTCAGGAGGCAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGAGTGGTCCTGTCAG 369
Query 304 CAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGA 377
|||||.||||||||||||||||..|||.|||||||||||||..||||.||.|..||.|.||||||||||||..|
Sbjct 370 CAAATATGGGAACAAATTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGGAACAGCTCTCAGTTCTTCAA 443
Query 378 AAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCA--TACAGGACAGAAACCTTCCCAGGG 449
|.|.|||||||||||||.||||.||||.|||.|||||.|.|.||.||| |.|| |||||||||||.|| |
Sbjct 444 AGAAGGTGATGTCCCCTGCCAGATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCA--ACAGAAACCTTACC---G 512
Query 450 TGG----GAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAG 519
|.| ||| ||||||||||||||||||||||||.|..||||||||||||.|||.||.|.|.||||||.||||
Sbjct 513 TTGTAATGAA-TGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAGGAGAG 585
Query 520 AAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCA 593
||.|||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 586 AAATCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGAGTCCA 659
Query 594 CGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATC 667
..|||||||.|||..||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TATGGGAGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAATCAGAGCTCACATCTGCAAACTCATC 733
Query 668 AGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTT 741
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||..|.||||||||||||||
Sbjct 734 AGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGGGCAATGTGGGAAAGGCTTCCATAGTAGATCAGCACTT 807
Query 742 AATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGA 815
|||||||||...|||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct 808 AATGTTCATTGCAAATTGCACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTCATTCATGA 881
Query 816 TTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCT 889
|||.||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 882 TTCACAGCTTCAAGAACATCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGAGCT 955
Query 890 TCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGT 963
||..|.||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 956 TCCGTGTTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTCAGATGTGATACATGT 1029
Query 964 GATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATG 1037
|..||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.||||||.||.||||.|||
Sbjct 1030 GGCAAGAACTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTCCATGGTCCACATAGAAGAGAAGCCATACAAATG 1103
Query 1038 TGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAAC 1111
||||||.||||||||||||||.|||.||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 TGAGCAATGTGGAAAAGGCTTCATTTGTAGGCGAGATTTTTGTAAGCATCAGATGGTCCACACAGGAGAGAAAC 1177
Query 1112 CATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGT 1185
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1178 CATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGACCTTCAGATGGTCCTCATGTCTTTTGAACCATCAGCAAGTCCACAGT 1251
Query 1186 GGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAG 1259
|||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||
Sbjct 1252 GGACAAAAATCCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACGACGATCTTCCCATCAGAG 1325
Query 1260 ATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACT 1333
||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||.||||...|..|.|||..|||||||.|
Sbjct 1326 ATCCCACAATGGAGAAAAGCCATATAACTGTGAGGAGTGTGGTAAGGACTATAAAAGGAGGTTGGATCTTGAGT 1399
Query 1334 TGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCA 1407
|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||.||.|||||||.
Sbjct 1400 TTCACCAGAGGGTCCACACGGGTGAGAGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGCAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCC 1473
Query 1408 AGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTT-- 1479
.||.|||||||.|||.|||||||||||.|...|.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||..||
Sbjct 1474 TGTCTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAGTGGGGAAAAACCTTTCAAATGTGAAGAGTGTGGAAAGAGATTTAC 1547
Query 1480 -----GTACACAGGA---CATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAG 1545
||.|||| | |||.| |||.|.||.|..|.|||.|||.|||||.|.||.||||||||||
Sbjct 1548 TCAGAGTTCACA--ACTTCATTC--------CCATCAGACATGCCATACTGGAGAAAAGCTATACAAATGTGAG 1611
Query 1546 GATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGA----------------------------------TA 1585
.|.||||.||...|.|||||.||....||.|||||.|| ||
Sbjct 1612 CAGTGTGAGAAGGGGTACAACAGTAAATTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACGGGGGAGAGCGACCCTA 1685
Query 1586 TACTTTTA-----------------------------TCAT-TATTTCTAAATGACACA--------------- 1614
||.||.|| |||| |.||| |||.|||
Sbjct 1686 TAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTTGGCTGGGCTTCATGTCTTT-----TGAAACATCAGAGACTCCACAG 1754
Query 1615 -------------------------------------------------------------------------- 1614
Sbjct 1755 TGGAGAAAAGCCATTGAAATCTGGAGTGTGGGAAGAGATCTACTCAGAATTCACAGCTTCATTTACATCAGTAA 1828
Query 1615 ----------------------- 1614
Sbjct 1829 GTCTATGTGGGAGAAAAGCCATA 1851