Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07167
- Subject:
- XM_024451486.1
- Aligned Length:
- 1789
- Identities:
- 1373
- Gaps:
- 185
Alignment
Query 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCATGTTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACCGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
Query 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
||||..|.||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGACGTTTCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTCATGCTGGAGAACTTCAGAAACCTGCTATCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA 222
|||..|.|||||.||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 149 AACTTTCCCACCGAGATACTTTTCACTTCCAAAGAGAAGAAAAGTTTTGGATCATGGAGACAGCAACCCAAAGA 222
Query 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAACAGGACCACATGAAGAGTGGTC 296
Query 297 CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT 370
.||||||||||||||||||||||.|||||..||.|||||.||..||||.||||| |||||.||.||||||||
Sbjct 297 TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGAGTTAACTAGACCTCAAGACTC---CATAAGTAGCTCTCAGT 367
Query 371 TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC 444
|||....|.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|.||||||.|.||||.|||.||||||.
Sbjct 368 TCTCCACACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGACGCAGGACTATCTATAATTCACATAGGAGAGACACCTTCT 441
Query 445 CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA 518
.||..|||||||||||||.|.|.||||||||||||..|||||.|||||||||.|||.||.|||.||||||.|.|
Sbjct 442 GAGCATGGGAAGTGTAAAAAATTCTTCAGTGATGTCTCCATCCTTGATCTTCATCAACAATTACACTCAGGAAA 515
Query 519 GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC 592
||..||..||||||||.||||||...|.||.||..|||||||.|.||||||||||..|.|||||||||.|||.|
Sbjct 516 GATATCCCATACATGTAATGAGTACAGGAAGAGATTCTGTTATAGCTCAGCTCTTTGTCTTCATCAGAAAGTTC 589
Query 593 ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT 666
||.||||||||||||.||.||.|||||||||||||.|.||||.|||||||||.|.||||||.||||||||||||
Sbjct 590 ACATGGGAGAGAAACGCTATAAGTGTGATGTGTGTAGTAAGGCATTTAGTCAGAACTCACAACTGCAAACTCAT 663
Query 667 CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT 740
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||.|.|
Sbjct 664 CAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAAGTTTCAGCCGTAGATCAGGAAT 737
Query 741 TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG 814
..||||||||...|||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||..
Sbjct 738 GTATGTTCATTGCAAATTACACACAGGAGAAAAACCTCATATTTGTGAGGAATGTGGGAAGGCCTTCATTCACA 811
Query 815 ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC 888
|||||||||||..|||||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 812 ATTCCCAGCTTCGGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTTATATATGTGGTAAGAGC 885
Query 889 TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACA--CAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACA 960
|||.||..|||.||||..|||||.||.|||||||||||.|||| || |||.|||.|||||||.||||||||.
Sbjct 886 TTCCATAGTAGATCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTCCACATGCA--AGAGAAATCATTTAGATGTGATACC 957
Query 961 TGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAG 1034
|||..|||.||||||..|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||..||||||||..||||.
Sbjct 958 TGTAGTAATAGCTTTGGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTGCATGGACCACACAAAAGAGAAACTATACAA 1031
Query 1035 ATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGA 1108
||||||..|.|||||||...||||.|.|.||||||.||||.|||.||||||||||.|||.|||.||||||||.|
Sbjct 1032 ATGTGAAGAATGTGGAAGGAGCTTCACTTGTAGGCAAGATCTTTGTAAGCATCAGATGGACCATACAGGAGACA 1105
Query 1109 AACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCAC 1182
||||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||..|..||||||||.||||||
Sbjct 1106 AACCATATAATTGTAATGTATGTGGGAAGGGCTTCAGGTGGTCCTCATGTCTTTCAAGACATCAGCGGGTCCAC 1179
Query 1183 AGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTC--TTCCCAT 1254
|.||||||||.||..|||||.||.||.|.||||||||||.|||||||||..|||||||| .|.| |||.|||
Sbjct 1180 AATGGAGAAACAACATTCAAGTGCGACGGATGTGGGAAGAGATTTTATATGAATTCACA--GGGCCATTCACAT 1251
Query 1255 CAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCT 1328
||||||.||.|.||.|..|||.|.|..|||||||||.||.||||||||||||||||..|||.||||||||||||
Sbjct 1252 CAGAGAGCCTATAGAGAAGAAGAACTGTATAAATGTCAGAAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTTTAATCT 1325
Query 1329 TGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGG 1402
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||..|||
Sbjct 1326 TGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTCAGGTGGG 1399
Query 1403 CCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCC--ACTGCCAGA-AAAAACCATT---------------------- 1451
|||||.|||||||||..||||||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 1400 CCTCAGGTATTTTGAGACATAAGAGACTCCATACTG---GAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAG 1470
Query 1452 --------------------------------------------------------------CAAATGTGAGGA 1463
||||||||||||
Sbjct 1471 AGGTTTACTGAGAATTCAAAACTTCGTTTCCATCAAAGAATTCACACTGGAGAAAAGCCTTACAAATGTGAGGA 1544
Query 1464 CTGTGGAAA----------------------------------------------------------------- 1472
.||||||||
Sbjct 1545 GTGTGGAAAGGGATTCAGATGGGCCTCAACTCATCTAACCCATCAAAGACTCCACAGCAGAGAAAAACTATTCC 1618
Query 1473 -----GAGGCTTGT--------------ACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAA 1527
||||.|||| .|||||..|||.||.|.|||||||.|..||.|||.|.|||||.|||
Sbjct 1619 AATGTGAGGATTGTGGGAAGAGCAGTGAGCACAGTTCATGCCTTCAAGACCAACAAAGCGACCACAGTGGAGAA 1692
Query 1528 AACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATT 1601
||..||||||||||||||||.|||||||..||||||.||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 1693 AAAACATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACGAGAGGCGCTTGAATCTAGATATGATTTTATCATTATT 1766
Query 1602 TCTAAATGACACA 1614
|.|||||||.|.|
Sbjct 1767 TTTAAATGATATA 1779