Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07170
• Subject: XM_006516597.3
• Aligned Length: 2291
• Identities: 1877
• Gaps: 118

Alignment

Query    1  ATGGAAGATCTGTCCTCTCCAGACTCCACCCTTCTCCAAGGGGGACATAATCTACTCTCATCAGCCAGTTTTCA  74
            ||||.||.||||||||.|.|||||||..||..||||||.|.|||||.|...||||||..|.||.|.|||||||.
Sbjct    1  ATGGCAGGTCTGTCCTTTGCAGACTCTGCCAGTCTCCACGAGGGACGTCCCCTACTCCTACCATCTAGTTTTCG  74

Query   75  GGAATCGGTGACTTTCAAGGATGTGATAGTGGACTTTACCCAGGAAGAATGGAAACAGCTGGACCCTGGCCAGA  148
            ||||||.|||||.||||||||||||.|.|||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||...||||
Sbjct   75  GGAATCAGTGACCTTCAAGGATGTGGTCGTGAACTTCACTCAGGAAGAATGGAAACACCTGGATCCTATACAGA  148

Query  149  GAGATTTGTTCAGGGATGTGACATTGGAAAATTATACACACCTGGTCTCTATAGGACTCCAAGTTTCTAAACCT  222
            |||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  149  GAGATTTGTTCAGAGATGTGACACTGGAAAATTATACACATCTGGTCTCTATAGGGCTCCAGGTTTCCAAACCT  222

Query  223  GATGTGATTTCCCAGTTAGAGCAAGGGACAGAGCCATGGA-TCATGGAGCCAAGCATTCCAGTAGGTACCTGTG  295
            |||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||| |.| |||..|..|||||||.||.|||.|||..|
Sbjct  223  GATATGATTTCCCAACTAGAGCAAGGGACAGAGCCATGGACTGA-GGATTCGTGCATTCCTGTCGGTCCCTTGG  295

Query  296  CAGACTGGGAGACAAGACTTGAAAATAGTGTGTCAGCCCCAGAGCCTGACATTTCTGAAGAAGAGCTATCTC-C  368
            .|||||||.|||.||||..||.|||||||||||||.|||.|||.|.|||||||||||||||..|.|||| || |
Sbjct  296  AAGACTGGAAGAAAAGAGCTGGAAATAGTGTGTCATCCCTAGAACTTGACATTTCTGAAGAGCATCTAT-TCTC  368

Query  369  AGAGGTAATAGTGGAAA--AACA-CAAAAGAGATGATTCTTGGAGTTCCAACTTGCTAGAAAGTTGGGAATATG  439
            ||||   |.|||.|.||  |||| ||||||.||||||                                     
Sbjct  369  AGAG---ACAGTAGTAACCAACAGCAAAAGGGATGAT-------------------------------------  402

Query  440  AAGGCAGTTTAGAGAGACAGCAGGCAAACCAACAGACACTGCCAAAGGAAAT--AAAGGTAACCGAAAAGACAA  511
              ||.||||||||||..|..||.|||||||||||||..|||||||.||||.|  |||  ||||.||.||.|||.
Sbjct  403  --GGGAGTTTAGAGAAGCTTCAAGCAAACCAACAGATGCTGCCAAGGGAAGTCCAAA--TAACGGAGAAAACAG  472

Query  512  TACCCAGTTGGGAAA--AAGGCCCTGTAAATAATGAATTTGGGAAAAGTGTCAATGTGAGTTCAAACCTTGTAA  583
            .|||||.|||.||.|  ||  ||                           |||.||||||.||||.|.|..|||
Sbjct  473  CACCCACTTGTGAGAGCAA--CC---------------------------TCAGTGTGAGCTCAAGCTTCATAA  517

Query  584  CACAA---GAACCATCTCCAGAAGAGACCTCTACTAAAAGAAGCATCAAACAGAATTCAAACCCAGTTAAAAAA  654
            |||||   |||..|.|||..||..||.|.||.|||||||.|||...|||.||||||||..|||||||||||||.
Sbjct  518  CACAAACGGAAGTAGCTCTCGATCAGCCTTCCACTAAAACAAGAGCCAAGCAGAATTCCCACCCAGTTAAAAAG  591

Query  655  GAGAAATCT-TGTAAGTGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTATTGTTCAGCTCTTATTCGCCATCAGAGAA  727
            ||| ||.|| |||||||||||.||||||||.|||||.||||.|||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct  592  GAG-AAGCTGTGTAAGTGCAACGAATGTGGTAAAGCTTTTACTTACTGTTCTGCTCTCATTCGCCACCAAAGAA  664

Query  728  CACATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTAATGAATGTGAAAAAGCCTTCAGCCGGAGTGAAAACCTTATAAAC  801
            |.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  665  CGCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTAACAAAGCTTTCAGCAGAAGTGAAAACCTTATAAAC  738

Query  802  CATCAAAGAATTCATACTGGAGATAAACCATATAAATGTGATCAGTGTGGAAAAGGCTTCATTGAGGGTCCATC  875
            |||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  739  CATCAGAGAATCCATACGGGAGATAAACCGTACAAATGTGACCAGTGTGGAAAGGGTTTCATTGAGGGTCCATC  812

Query  876  TCTTACTCAACATCAAAGAATTCATACTGGAGAAAAACCATATAAATGTGATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTC  949
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  813  TCTCACTCAACATCAAAGAATTCACACTGGAGAAAAGCCCTATAAATGTGATGAATGTGGGAAGGCCTTTAGTC  886

Query  950  AGAGGACCCATCTTGTTCAGCATCAGAGAATTCATACTGGCGAGAAGCCATACACTTGTAATGAGTGTGGAAAA  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||..||||||||.|||
Sbjct  887  AGAGGACCCATCTTGTTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAGCCATATACTTGTACCGAGTGTGGGAAA  960

Query 1024  GCCTTTAGCCAGAGAGGCCACTTTATGGAACATCAGAAAATTCATACGGGAGAAAAACCTTTTAAATGTGATGA  1097
            .||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  961  TCCTTCAGCCAGAGAGGTCACTTTATGGAGCACCAGAAAATTCATACAGGAGAAAAACCTTTCAAGTGTGAGGA  1034

Query 1098  ATGTGATAAAACCTTCACCAGGAGCACACACCTTACTCAACATCAAAAAATTCATACTGGAGAAAAAACCTATA  1171
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1035  GTGTGAGAAAACCTTCACCAGGAGCACACACCTCACTCAACATCAGAAAATTCACACTGGGGAGAAAACTTACA  1108

Query 1172  AATGTAATGAATGTGGAAAGGCCTTCAACGGGCCCTCAACTTTTATCCGTCATCATATGATTCATACTGGTGAA  1245
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1109  AGTGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAACGGCCCATCAACGTTTATCCGTCACCATATGATTCATACTGGAGAA  1182

Query 1246  AAACCGTACGAATGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGCACTCAAACCTCACTCAGCATCAAAAAACTCA  1319
            ||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1183  AAGCCTTATGAGTGTAATGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCAGCACTCCAACCTGACTCAGCATCAGAAAACACA  1256

Query 1320  TACTGGGGAGAAACCCTATGATTGTGCAGAATGTGGAAAATCTTTTAGTTACTGGTCATCCCTTGCTCAACACC  1393
            .||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1257  CACTGGGGAGAAACCCTATGACTGTGCAGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTACTGGTCATCCCTAGCTCAGCACC  1330

Query 1394  TGAAAATTCATACTGGAGAAAAACCTTACAAATGCAATGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTTACTGCTCATCCCTT  1467
            |||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|..||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1331  TGAAAATTCATACAGGAGAGAAGCCCTACAAGTGTAGCGACTGCGGGAAGGCCTTCAGTTACTGCTCCTCCCTT  1404

Query 1468  ACTCAACATCGGAGAATTCACACGAGAGAAAAGCCCTTTGAATGCAGTGAATGTGGAAAGGCTTTCAGTTATCT  1541
            |||||.||||||||.||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1405  ACTCAGCATCGGAGGATTCACACCCGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCAGTGAGTGTGGAAAGGCTTTCAGCTATCT  1478

Query 1542  CTCAAACCTTAATCAGCATCAGAAAACTCATACTCAAGAGAAAGCTTATGAATGTAAAGAATGTGGGAAAGCTT  1615
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1479  GTCAAACCTTAATCAGCATCAGAAAACTCACACCCAGGAGAAAGCCTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCT  1552

Query 1616  TTATTCGGAGTTCATCTCTTGCTAAGCATGAAAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATCAGTGTCATGAATGT  1689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1553  TTATTCGGAGTTCATCTCTTGCTAAGCATGAAAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCTTATCAATGTCATGAATGT  1626

Query 1690  GGGAAAACCTTCAGTTATGGTTCATCCCTTATTCAGCATAGGAAGATCCATACTGGAGAACGACCTTACAAGTG  1763
            ||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 1627  GGAAAAACCTTCAGCTATGGCTCATCTCTTATTCAGCATAAGAAAATCCATACTGGTGAAAGACCTTACAAGTG  1700

Query 1764  TAATGAGTGTGGGAGAGCATTCAACCAGAACATACACCTTACACAGCATAAGAGAATTCATACAGGAGCCAAGC  1837
            ||||||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1701  TAATGAATGTGGGCGAGCCTTCAACCAGAAAATACACCTTACACAACACAAGAGAATTCATACAGGAGCAAAGC  1774

Query 1838  CTTATGAGTGTGCTGAGTGTGGTAAAGCCTTTCGACATTGTTCATCTCTTGCTCAACATCAAAAAACTCACACA  1911
            |.||||..||..|..||||.||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775  CGTATGCCTGCCCCAAGTGCGGGAAGACCTTTCGACACTGTTCATCTCTTGCTCAACATCAAAAAACTCACACA  1848

Query 1912  GAAGAAAAACCCTACCAGTGTAATAAATGTGAAAAGACCTTTAGCCAGAGCTCCCATCTAACTCAGCATCAACG  1985
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct 1849  GAAGAAAAACCCTACCAGTGTAACAAATGTGAAAAAACCTTCAGCCAGAACTCCCGTCTGACTCAGCATCAGCG  1922

Query 1986  AATTCACACTGGGGAGAAGCCCTATAAGTGCAATGAATGTGACAAAGCCTTTAGCCGGAGCACTCATCTGACTG  2059
            ||||||.||.||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||..|||||.|.|||||...||.|||||||
Sbjct 1923  AATTCATACGGGAGAGAAGCCTTATAAGTGCAGTGAATGTGACAAATGCTTTACCGGGAGCGTGCACCTGACTG  1996

Query 2060  AACATCAGAATACTCATACTGGAGAGAAACCTTATAACTGTAATGAATGCAGAAAGACTTTTAGCCAGAGCACA  2133
            ||||||.||.||||||.|||||||||||||||||.||||   .|||.|||..|.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1997  AACATCGGAGTACTCACACTGGAGAGAAACCTTACAACT---CTGAGTGCCCACAGACTTTCAGCCAGAGCACA  2067

Query 2134  TATCTCATTCAGCACCAGAGAATTCATTCAGGAGAGAAGCCTTTTGGATGTAATGATTGTGGAAAATCCTT-CA  2206
            ||.||||.||||||.||||..|||||||||||||||||||.|||.||.|||.|.||.||||.||||.|||| ||
Sbjct 2068  TACCTCACTCAGCATCAGAAGATTCATTCAGGAGAGAAGCTTTTGGGGTGTGAGGACTGTGAAAAAGCCTTCCA  2141

Query 2207  GATATCGCTCTGCTCTCAACAAACATCAGAGACTGCATCC-----TGGC----ATA---------------  2253
            | |.||.|||||||||||.||||||.||||||.||||.||     ||||    .||               
Sbjct 2142  G-TGTCACTCTGCTCTCACCAAACACCAGAGATTGCACCCTGCTGTGGCTGCTGTAGGAACATCATTAACA  2211