Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07170
• Subject: XM_006516598.3
• Aligned Length: 2291
• Identities: 1690
• Gaps: 343

Alignment

Query    1  ATGGAAGATCTGTCCTCTCCAGACTCCACCCTTCTCCAAGGGGGACATAATCTACTCTCATCAGCCAGTTTTCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAATCGGTGACTTTCAAGGATGTGATAGTGGACTTTACCCAGGAAGAATGGAAACAGCTGGACCCTGGCCAGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAGATTTGTTCAGGGATGTGACATTGGAAAATTATACACACCTGGTCTCTATAGGACTCCAAGTTTCTAAACCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATGTGATTTCCCAGTTAGAGCAAGGGACAGAGCCATGGA-TCATGGAGCCAAGCATTCCAGTAGGTACCTGTG  295
               .||||||||||..|||||||||||||||||||||||| |.| |||..|..|||||||.||.|||.|||..|
Sbjct    1  ---ATGATTTCCCAACTAGAGCAAGGGACAGAGCCATGGACTGA-GGATTCGTGCATTCCTGTCGGTCCCTTGG  70

Query  296  CAGACTGGGAGACAAGACTTGAAAATAGTGTGTCAGCCCCAGAGCCTGACATTTCTGAAGAAGAGCTATCTC-C  368
            .|||||||.|||.||||..||.|||||||||||||.|||.|||.|.|||||||||||||||..|.|||| || |
Sbjct   71  AAGACTGGAAGAAAAGAGCTGGAAATAGTGTGTCATCCCTAGAACTTGACATTTCTGAAGAGCATCTAT-TCTC  143

Query  369  AGAGGTAATAGTGGAAA--AACA-CAAAAGAGATGATTCTTGGAGTTCCAACTTGCTAGAAAGTTGGGAATATG  439
            ||||   |.|||.|.||  |||| ||||||.||||||                                     
Sbjct  144  AGAG---ACAGTAGTAACCAACAGCAAAAGGGATGAT-------------------------------------  177

Query  440  AAGGCAGTTTAGAGAGACAGCAGGCAAACCAACAGACACTGCCAAAGGAAAT--AAAGGTAACCGAAAAGACAA  511
              ||.||||||||||..|..||.|||||||||||||..|||||||.||||.|  |||  ||||.||.||.|||.
Sbjct  178  --GGGAGTTTAGAGAAGCTTCAAGCAAACCAACAGATGCTGCCAAGGGAAGTCCAAA--TAACGGAGAAAACAG  247

Query  512  TACCCAGTTGGGAAA--AAGGCCCTGTAAATAATGAATTTGGGAAAAGTGTCAATGTGAGTTCAAACCTTGTAA  583
            .|||||.|||.||.|  ||  ||                           |||.||||||.||||.|.|..|||
Sbjct  248  CACCCACTTGTGAGAGCAA--CC---------------------------TCAGTGTGAGCTCAAGCTTCATAA  292

Query  584  CACAA---GAACCATCTCCAGAAGAGACCTCTACTAAAAGAAGCATCAAACAGAATTCAAACCCAGTTAAAAAA  654
            |||||   |||..|.|||..||..||.|.||.|||||||.|||...|||.||||||||..|||||||||||||.
Sbjct  293  CACAAACGGAAGTAGCTCTCGATCAGCCTTCCACTAAAACAAGAGCCAAGCAGAATTCCCACCCAGTTAAAAAG  366

Query  655  GAGAAATCT-TGTAAGTGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTATTGTTCAGCTCTTATTCGCCATCAGAGAA  727
            ||| ||.|| |||||||||||.||||||||.|||||.||||.|||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct  367  GAG-AAGCTGTGTAAGTGCAACGAATGTGGTAAAGCTTTTACTTACTGTTCTGCTCTCATTCGCCACCAAAGAA  439

Query  728  CACATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTAATGAATGTGAAAAAGCCTTCAGCCGGAGTGAAAACCTTATAAAC  801
            |.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  440  CGCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTAACAAAGCTTTCAGCAGAAGTGAAAACCTTATAAAC  513

Query  802  CATCAAAGAATTCATACTGGAGATAAACCATATAAATGTGATCAGTGTGGAAAAGGCTTCATTGAGGGTCCATC  875
            |||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  514  CATCAGAGAATCCATACGGGAGATAAACCGTACAAATGTGACCAGTGTGGAAAGGGTTTCATTGAGGGTCCATC  587

Query  876  TCTTACTCAACATCAAAGAATTCATACTGGAGAAAAACCATATAAATGTGATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTC  949
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  588  TCTCACTCAACATCAAAGAATTCACACTGGAGAAAAGCCCTATAAATGTGATGAATGTGGGAAGGCCTTTAGTC  661

Query  950  AGAGGACCCATCTTGTTCAGCATCAGAGAATTCATACTGGCGAGAAGCCATACACTTGTAATGAGTGTGGAAAA  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||..||||||||.|||
Sbjct  662  AGAGGACCCATCTTGTTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAGCCATATACTTGTACCGAGTGTGGGAAA  735

Query 1024  GCCTTTAGCCAGAGAGGCCACTTTATGGAACATCAGAAAATTCATACGGGAGAAAAACCTTTTAAATGTGATGA  1097
            .||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  736  TCCTTCAGCCAGAGAGGTCACTTTATGGAGCACCAGAAAATTCATACAGGAGAAAAACCTTTCAAGTGTGAGGA  809

Query 1098  ATGTGATAAAACCTTCACCAGGAGCACACACCTTACTCAACATCAAAAAATTCATACTGGAGAAAAAACCTATA  1171
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct  810  GTGTGAGAAAACCTTCACCAGGAGCACACACCTCACTCAACATCAGAAAATTCACACTGGGGAGAAAACTTACA  883

Query 1172  AATGTAATGAATGTGGAAAGGCCTTCAACGGGCCCTCAACTTTTATCCGTCATCATATGATTCATACTGGTGAA  1245
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  884  AGTGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAACGGCCCATCAACGTTTATCCGTCACCATATGATTCATACTGGAGAA  957

Query 1246  AAACCGTACGAATGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGCACTCAAACCTCACTCAGCATCAAAAAACTCA  1319
            ||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  958  AAGCCTTATGAGTGTAATGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCAGCACTCCAACCTGACTCAGCATCAGAAAACACA  1031

Query 1320  TACTGGGGAGAAACCCTATGATTGTGCAGAATGTGGAAAATCTTTTAGTTACTGGTCATCCCTTGCTCAACACC  1393
            .||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1032  CACTGGGGAGAAACCCTATGACTGTGCAGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTACTGGTCATCCCTAGCTCAGCACC  1105

Query 1394  TGAAAATTCATACTGGAGAAAAACCTTACAAATGCAATGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTTACTGCTCATCCCTT  1467
            |||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|..||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1106  TGAAAATTCATACAGGAGAGAAGCCCTACAAGTGTAGCGACTGCGGGAAGGCCTTCAGTTACTGCTCCTCCCTT  1179

Query 1468  ACTCAACATCGGAGAATTCACACGAGAGAAAAGCCCTTTGAATGCAGTGAATGTGGAAAGGCTTTCAGTTATCT  1541
            |||||.||||||||.||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1180  ACTCAGCATCGGAGGATTCACACCCGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCAGTGAGTGTGGAAAGGCTTTCAGCTATCT  1253

Query 1542  CTCAAACCTTAATCAGCATCAGAAAACTCATACTCAAGAGAAAGCTTATGAATGTAAAGAATGTGGGAAAGCTT  1615
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1254  GTCAAACCTTAATCAGCATCAGAAAACTCACACCCAGGAGAAAGCCTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCT  1327

Query 1616  TTATTCGGAGTTCATCTCTTGCTAAGCATGAAAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATCAGTGTCATGAATGT  1689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1328  TTATTCGGAGTTCATCTCTTGCTAAGCATGAAAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCTTATCAATGTCATGAATGT  1401

Query 1690  GGGAAAACCTTCAGTTATGGTTCATCCCTTATTCAGCATAGGAAGATCCATACTGGAGAACGACCTTACAAGTG  1763
            ||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 1402  GGAAAAACCTTCAGCTATGGCTCATCTCTTATTCAGCATAAGAAAATCCATACTGGTGAAAGACCTTACAAGTG  1475

Query 1764  TAATGAGTGTGGGAGAGCATTCAACCAGAACATACACCTTACACAGCATAAGAGAATTCATACAGGAGCCAAGC  1837
            ||||||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1476  TAATGAATGTGGGCGAGCCTTCAACCAGAAAATACACCTTACACAACACAAGAGAATTCATACAGGAGCAAAGC  1549

Query 1838  CTTATGAGTGTGCTGAGTGTGGTAAAGCCTTTCGACATTGTTCATCTCTTGCTCAACATCAAAAAACTCACACA  1911
            |.||||..||..|..||||.||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  CGTATGCCTGCCCCAAGTGCGGGAAGACCTTTCGACACTGTTCATCTCTTGCTCAACATCAAAAAACTCACACA  1623

Query 1912  GAAGAAAAACCCTACCAGTGTAATAAATGTGAAAAGACCTTTAGCCAGAGCTCCCATCTAACTCAGCATCAACG  1985
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct 1624  GAAGAAAAACCCTACCAGTGTAACAAATGTGAAAAAACCTTCAGCCAGAACTCCCGTCTGACTCAGCATCAGCG  1697

Query 1986  AATTCACACTGGGGAGAAGCCCTATAAGTGCAATGAATGTGACAAAGCCTTTAGCCGGAGCACTCATCTGACTG  2059
            ||||||.||.||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||..|||||.|.|||||...||.|||||||
Sbjct 1698  AATTCATACGGGAGAGAAGCCTTATAAGTGCAGTGAATGTGACAAATGCTTTACCGGGAGCGTGCACCTGACTG  1771

Query 2060  AACATCAGAATACTCATACTGGAGAGAAACCTTATAACTGTAATGAATGCAGAAAGACTTTTAGCCAGAGCACA  2133
            ||||||.||.||||||.|||||||||||||||||.||||   .|||.|||..|.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1772  AACATCGGAGTACTCACACTGGAGAGAAACCTTACAACT---CTGAGTGCCCACAGACTTTCAGCCAGAGCACA  1842

Query 2134  TATCTCATTCAGCACCAGAGAATTCATTCAGGAGAGAAGCCTTTTGGATGTAATGATTGTGGAAAATCCTT-CA  2206
            ||.||||.||||||.||||..|||||||||||||||||||.|||.||.|||.|.||.||||.||||.|||| ||
Sbjct 1843  TACCTCACTCAGCATCAGAAGATTCATTCAGGAGAGAAGCTTTTGGGGTGTGAGGACTGTGAAAAAGCCTTCCA  1916

Query 2207  GATATCGCTCTGCTCTCAACAAACATCAGAGACTGCATCC-----TGGC----ATA---------------  2253
            | |.||.|||||||||||.||||||.||||||.||||.||     ||||    .||               
Sbjct 1917  G-TGTCACTCTGCTCTCACCAAACACCAGAGATTGCACCCTGCTGTGGCTGCTGTAGGAACATCATTAACA  1986