Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07176
• Subject: NM_001129996.2
• Aligned Length: 1478
• Identities: 1269
• Gaps: 37

Alignment

Query    1  ATGA-CCATGTC--------------------------CA-AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGG  46
            |||| |.|| ||                          || ||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct    1  ATGATCGAT-TCAGGAGAAAAGAAGCCTGGGCGGAGAGCAGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGA  73

Query   47  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAAC  120
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct   74  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAAC  147

Query  121  TTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTT  194
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  148  TTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCATTCCATGGAGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTT  221

Query  195  TTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTC  268
            ||||.||||||..|.|.|||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  222  TTGGGTGATGGGGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGAATTTGGGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTC  295

Query  269  CAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCT  342
            |||||||||||.|||||||||..|..||||||.||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  296  CAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCT  369

Query  343  CAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGTTCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATC  416
            |||||..|.|||||||..|.|||||||||.||||||||.|.|||...||.|||||||.||.|.|.|.||.||||
Sbjct  370  CAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATC  443

Query  417  TATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCCAATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTG  490
            ||.|.|.||||||.||.|.|||||||.|.|..|||..||.||||||||.|.||||||||||.|.|||.||||||
Sbjct  444  TACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTG  517

Query  491  ATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGAGAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC  564
            |||||||||||||..||...||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC  591

Query  565  TCAGCACTTCATATTCATCAGAGAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATT  638
            |||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||.||||..||.|||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  592  TCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATT  665

Query  639  CAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTG  712
            .||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  666  TAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTG  739

Query  713  GGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGT  786
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  740  GGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGT  813

Query  787  GAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCC  860
            |||..||||||||.|||.|||||.||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  814  GAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCC  887

Query  861  ATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGCTTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAG  934
            ||||||||||||.||||||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct  888  ATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAG  961

Query  935  GAAAGAAAC----CAAACAGCACTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCA  1004
            .|.||||||    ||||    .|||...|.|||||||.|||.||||||..||||||.||||||..|||||||||
Sbjct  962  CAGAGAAACTGTACAAA----TCTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCA  1031

Query 1005  GACGATCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTT  1078
            ||.|||.||.|..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||
Sbjct 1032  GATGATTCATATGGGACAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTT  1105

Query 1079  TGATCCATCAGCGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAG  1152
            ||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1106  TGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAG  1179

Query 1153  TCAGGTCTTGACTTGCACCACAGAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTT  1226
            ||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1180  TCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTT  1253

Query 1227  TAGACAGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTG  1300
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||||.||||||.||||.||.|||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1254  TAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTG  1327

Query 1301  GAAAGAAGCTTGTATACCGGTCATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGT  1374
            ||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1328  GAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGT  1401

Query 1375  GAAGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG  1446
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1402  GAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1473