Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07176
- Subject:
- NM_001260486.1
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1270
- Gaps:
- 168
Alignment
Query 1 ATGACCATGTCCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
|||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
Query 75 GGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC 148
|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGA 222
||||.|||||||.||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|.|||||||||||||
Sbjct 149 AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA 222
Query 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTC 296
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC 296
Query 297 CTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGT 370
|||||||||.|||||||||.|||||||||..||.|||||||||.||||.|||||||.||||||.|.||||||||
Sbjct 297 CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT 370
Query 371 TCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCC 444
||||||||.|.|||||||.||.||||||||||||.|.||||.||.|.|.|||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC 444
Query 445 AATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGA 518
.|..||||||||||||||||.||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||..||..|||||.|||
Sbjct 445 CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA 518
Query 519 GAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCACTTCATATTCATCAGAGAGTCC 592
|||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 519 GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC 592
Query 593 ACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCAT 666
||.||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 593 ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT 666
Query 667 CAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT 740
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 667 CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT 740
Query 741 TACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATG 814
||..||||||.|.||||||||||..||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 741 TAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG 814
Query 815 ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGC 888
|||.|||||||.||.|||||.|||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||.||..||.|
Sbjct 815 ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC 888
Query 889 TTCCGTCTTAGGTCAAG--------------------------------------------------------- 905
|||..|.||||||||||
Sbjct 889 TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG 962
Query 906 ---------------------------TCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAACCAAACAGCA 952
.||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||..||||..
Sbjct 963 TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT 1036
Query 953 CTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAA 1026
.||.|.|.|.||||||||||||.|||.|||||||.|||||.|.||||||||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA 1110
Query 1027 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACAC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1111 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG 1184
Query 1101 TGGA---------------------------------------------------------------------- 1104
||||
Sbjct 1185 TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA 1258
Query 1105 --------------GAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGAC 1164
|||||||||||.||||||||..|||||||||||.||||..|||||||||....|||||||
Sbjct 1259 GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC 1332
Query 1165 TTGCACCACAGAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTC 1238
||||||||.||.|.||||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||.||||||.|.||||||
Sbjct 1333 TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC 1406
Query 1239 AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTG 1312
|||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1407 AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG 1480
Query 1313 TATACCGGTCATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGG 1386
||.||.||.||||||||||||||||.|..|.|.||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1481 TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG 1554
Query 1387 AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG 1446
|..|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1555 AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA 1614