Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07176
- Subject:
- NM_006300.4
- Aligned Length:
- 1450
- Identities:
- 1246
- Gaps:
- 32
Alignment
Query 1 ATGACCATGTCCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
|||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT 74
Query 75 GGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC 148
|||||.||||||||||||||||||.|.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGA 222
|||||||||||| ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 149 AACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA 216
Query 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTC 296
|||||.||||||||.||| ||||||.||.|.|||||||||||||||||||..||..|
Sbjct 217 GAAGGAAATTCAGGCGGC------------------AAGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC 272
Query 297 CTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGT 370
.||||||||.|||||||||.|||.|||||||||.||||||..|.||||||||||.|.||||||.|..|||||.|
Sbjct 273 TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT 346
Query 371 TCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCC 444
||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||.||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 347 TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA 420
Query 445 AATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGA 518
.|...|||||||||||||||.||||||||||||.|..||||||||||||.|||||||||..|.|.|||||.|||
Sbjct 421 CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA 494
Query 519 GAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCACTTCATATTCATCAGAGAGTCC 592
||||||||||.|.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||.|
Sbjct 495 GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC 568
Query 593 ACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCAT 666
||.||.||||||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|.|..|||||||||||.|
Sbjct 569 ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT 642
Query 667 CAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT 740
.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||.|...|||
Sbjct 643 GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT 716
Query 741 TACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATG 814
|..||||||.|||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||||..|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 717 TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG 790
Query 815 ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGC 888
||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||..||||
Sbjct 791 ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC 864
Query 889 TTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAAC----CAAACAGCACTGGGG 958
|||.|.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||.|.|||||| |||| .|||.||
Sbjct 865 TTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAA----TCTGAGG 934
Query 959 AATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAACCATAT 1032
|.|.||||||||||||||.|..|||.||.||||||..|||||||||||..||.|||||||||.|||||||.||.
Sbjct 935 AGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTAC 1008
Query 1033 AATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACACTGGAGA 1106
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1009 AATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGA 1082
Query 1107 AAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGACTTGCACCACAGAGCCC 1180
|||.|||||||.||||||..|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||.||.|.||
Sbjct 1083 AAAACCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCC 1156
Query 1181 ACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTCAAGTATTTTGAATCAT 1254
|.||.|||||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 1157 ATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCAT 1230
Query 1255 AAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTGTATACCGGTCATACCG 1328
||||.||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.|.|.|
Sbjct 1231 AAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTG 1304
Query 1329 TAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGC 1402
|||||||||||||..|.||||||.|||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 TAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGC 1378
Query 1403 GCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG 1446
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct 1379 GCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG 1422