Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07176
- Subject:
- NM_013360.2
- Aligned Length:
- 1456
- Identities:
- 1182
- Gaps:
- 113
Alignment
Query 1 ATGACCATGTCCAAG------GAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGG 68
|||.|.||| ||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------ATGGCAAAGCTCTACGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGATCTTCACTGAGGAGGAGCTGGG 68
Query 69 GCTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGG 142
|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 69 GCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTG- 141
Query 143 GGCATCAACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACC 216
Sbjct 142 -------------------------------------------------------------------------- 141
Query 217 CAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGG 290
|||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 142 ------------------GGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGA 197
Query 291 GTGGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCT 364
.|..||||||.||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||..|.|||||||..|.||
Sbjct 198 ATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACT 271
Query 365 CTCAGTTCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATCTATAATGCACACAGGACAGAAA 438
|||||||.||||||||.|.|||...||.|||||||.||.|.|.|.||.||||||.|.|.||||||.||.|.|||
Sbjct 272 CTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAA 345
Query 439 CCTTCCAATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTC 512
||||.|.|..|||..||.||||||||.|.||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||..||...||
Sbjct 346 CCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTC 419
Query 513 AGCAGAGAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCACTTCATATTCATCAGA 586
||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 420 AGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGA 493
Query 587 GAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAA 660
|.||||||.||||||.||||..||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.||.|||||||
Sbjct 494 GGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAA 567
Query 661 ACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATC 734
||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 568 ACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATC 641
Query 735 AGCACTTACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCA 808
||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||..||||||||.|||.||||
Sbjct 642 AGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCA 715
Query 809 TTCATGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGT 882
|.||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 716 TGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGT 789
Query 883 GTGAGCTTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAAC----CAAACAGCA 952
..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||.|.|||||| |||| .
Sbjct 790 AAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAA----T 859
Query 953 CTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAA 1026
|||...|.|||||||.|||.||||||..||||||.||||||..|||||||||||.|||.||.|..|||.|||||
Sbjct 860 CTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAA 933
Query 1027 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACAC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 934 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACAC 1007
Query 1101 TGGAGAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGACTTGCACCACA 1174
||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1008 TGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATA 1081
Query 1175 GAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTCAAGTATTTTG 1248
||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1082 GAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTG 1155
Query 1249 AATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTGTATACCGGTC 1322
||||||||||.||||||.||||.||.|||.|||||.||||||||.||.||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1156 AATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTC 1229
Query 1323 ATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGGAAGCGCTACA 1396
||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1230 ATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACA 1303
Query 1397 AGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG 1446
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1304 AGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA 1353