Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07176
• Subject: XM_005259208.3
• Aligned Length: 1456
• Identities: 1263
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGACCATGTCCAAG------GAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGG  68
                  |||.|.|||      ||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGGCAAAGCTCTACGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGATCTTCACTGAGGAGGAGCTGGG  68

Query   69  GCTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGG  142
            |||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   69  GCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGG  142

Query  143  GGCATCAACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACC  216
            ||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||..|.|.|||.|
Sbjct  143  GGCATCAACCATTCCATGGAGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGGTGATGGGGACAACAAGC  216

Query  217  CAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGG  290
            ||||||||||||||||..|||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  217  CAAAGAGAAGGGAATTTGGGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGA  290

Query  291  GTGGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCT  364
            .|..||||||.||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||..|.|||||||..|.||
Sbjct  291  ATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACT  364

Query  365  CTCAGTTCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATCTATAATGCACACAGGACAGAAA  438
            |||||||.||||||||.|.|||...||.|||||||.||.|.|.|.||.||||||.|.|.||||||.||.|.|||
Sbjct  365  CTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAA  438

Query  439  CCTTCCAATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTC  512
            ||||.|.|..|||..||.||||||||.|.||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||..||...||
Sbjct  439  CCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTC  512

Query  513  AGCAGAGAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCACTTCATATTCATCAGA  586
            ||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  513  AGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGA  586

Query  587  GAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAA  660
            |.||||||.||||||.||||..||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.||.|||||||
Sbjct  587  GGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAA  660

Query  661  ACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATC  734
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  661  ACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATC  734

Query  735  AGCACTTACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCA  808
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||..||||||||.|||.||||
Sbjct  735  AGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCA  808

Query  809  TTCATGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGT  882
            |.||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct  809  TGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGT  882

Query  883  GTGAGCTTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAAC----CAAACAGCA  952
            ..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||.|.||||||    ||||    .
Sbjct  883  AAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAA----T  952

Query  953  CTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAA  1026
            |||...|.|||||||.|||.||||||..||||||.||||||..|||||||||||.|||.||.|..|||.|||||
Sbjct  953  CTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAA  1026

Query 1027  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACAC  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 1027  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACAC  1100

Query 1101  TGGAGAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGACTTGCACCACA  1174
            ||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1101  TGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATA  1174

Query 1175  GAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTCAAGTATTTTG  1248
            ||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1175  GAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTG  1248

Query 1249  AATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTGTATACCGGTC  1322
            ||||||||||.||||||.||||.||.|||.|||||.||||||||.||.||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1249  AATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTC  1322

Query 1323  ATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGGAAGCGCTACA  1396
            ||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1323  ATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACA  1396

Query 1397  AGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG  1446
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1397  AGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1446