Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07185
• Subject: NM_001308222.1
• Aligned Length: 1203
• Identities: 1114
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGCAAGTCTCCATAGCCTGCACAGAGCACAATTTGAAGAGTCGGAATGGTGAGGACCGACTTCTGAGCAAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAAGTCTCCATAGCCTGCACAGAGCACAATTTGAAGAGTCGGAATGGTGAGGACCGACTTCTGAGCAAGCA  74

Query   75  GAGCTCCACCGCCCCCAATGTGGTAAACGCAGCCCGGGCCAAATTCCGCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGCTCCACCGCCCCCAATGTGGTGAACGCAGCCCGGGCCAAATTCCGCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCC  148

Query  149  TGGGGACGTTCACGCCTCAGCATCACATTTCTCTCAAAGAGTCCACCGCAAAGCAGACTGGCATGAAATATAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGGACGTTCACGCCTCAGCATCACATTTCTCTCAAAGAGTCCACCGCAAAGCAGACTGGCATGAAATATAGG  222

Query  223  AATCTTGGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATCTTGGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTTC  296

Query  297  AGATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCT  370

Query  371  ATGCTGCTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGCTGCTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGTC  444

Query  445  ATAACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATTGAAGG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  445  ATAACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATT-----  513

Query  519  ATTGAAGGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAGTAACA  592
                                                                                      
Sbjct  514  --------------------------------------------------------------------------  513

Query  593  CTCCCATGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCG  666
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  --------GAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCG  579

Query  667  AGATGGAGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  AGATGGAGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTGA  653

Query  741  ACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  ACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGTG  727

Query  815  TTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  TTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGT  801

Query  889  TCCAGGGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  TCCAGGGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAAA  875

Query  963  CAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  CAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGCC  949

Query 1037  TGAGAAACGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGCC  1110
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  TGAGAAATGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGCC  1023

Query 1111  ATTCAGGTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  ATTCAGGTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACAG  1097

Query 1185  CAAGAAGGACTATAGATCA  1203
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1098  CAAGAAGGACTATAGATCA  1116