Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07314
• Subject: XM_030246641.1
• Aligned Length: 3033
• Identities: 2181
• Gaps: 528

Alignment

Query    1  ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGCTCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACCGTGTATGCAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCAAAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCT  370
                                                                      |||||||||||.||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------ATGAACAACATCATCT  16

Query  371  CCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGAGTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAA  444
            |.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct   17  CGTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAAGGAGATCTGAAAGGAGTAAAAGGGGATCTGAAAAAGCCCTTTGATAAA  90

Query  445  GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAAGGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct   91  GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAAATAGAAAAGGAGAAAAAGGAGCATGCCAAGCTCCACGGGAT  164

Query  519  GATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGATGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGA  592
            ||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  165  GATTCGTACTGAAATAAGCGGGGCTGAGATTGCAGAGGAGATGGAGAAGGAAAGACGGTTCTTCCAGCTGCAGA  238

Query  593  TGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAAAAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAA  666
            ||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  239  TGTGTGAGTACCTGCTGAAGGTCAATGAAATCAAGGTGAAAAAGGGAGTGGATTTGCTTCAGAATCTGATCAAG  312

Query  667  TACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAAAGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAAC  740
            ||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  313  TACTTTCACGCCCAGTGCAATTTTTTCCAGGATGGATTGAAAGCAGTAGAAAGCCTCAAGCCTTCCATCGAGAC  386

Query  741  GCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATGAAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATA  814
            |||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|..|.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct  387  GCTCTCCACGGACCTCCACACCATCAAACAGGCCCAGGATGAGGAACGGCGACAGCTGATACAACTTCGAGATA  460

Query  815  TTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAG---------GACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTAT  879
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||||||         |||||.|||.||||.||.||.|||||.||.
Sbjct  461  TTTTGAAGTCAGCATTGCAGGTGGAACAGAAAGAGTCTAGGAGAGACTCACAACTTCGCCAAAGTACAGCCTAC  534

Query  880  AGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGAGCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGG  953
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||.|.|||||||||||||||.||.||
Sbjct  535  AGCTTACATCAACCTCAGGGAAACAAGGAGCATGGAACAGAGAGGAACGGGAACCTCTACAAGAAGAGCGATGG  608

Query  954  GATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTA  1027
            ||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  609  GATCCGGAAAGTGTGGCAGAAGAGGAAGTGTTCCGTTAAAAATGGCTTCCTCACCATCTCCCACGGCACTGCCA  682

Query 1028  ACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGAC  1101
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  683  ACCGGCCACCTGCCAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAATCCTGAGGAGAAGAAGTGTTTCGAC  756

Query 1102  CTTATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGATGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCT  1175
            ||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  757  CTCATATCACATGACAGGACGTACCACTTCCAAGCGGAAGACGAACAAGAATGTCAGATATGGATGTCTGTACT  830

Query 1176  GCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCC  1249
            |||.||.|||||.|||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  GCAGAACAGCAAGGAAGAAGCTCTGAACAACGCCTTTAAGGGTGATGACAACACTGGAGAAAATAACATCGTCC  904

Query 1250  AAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCG  1323
            ||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  905  AAGAGCTGACCAAGGAGATCATCTCGGAGGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTGTGCTGCGACTGTGGGGCA  978

Query 1324  CCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCT  1397
            ||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct  979  CCAGATCCGACGTGGCTCTCTACCAACCTGGGCATCCTGACTTGCATCGAGTGCTCTGGGATCCACCGGGAGCT  1052

Query 1398  GGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATGTACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGA  1471
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1053  GGGGGTTCATTACTCCAGGATGCAGTCCCTGACATTAGATGTATTGGGAACGTCTGAGCTTCTGCTTGCCAAGA  1126

Query 1472  ATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCA  1545
            ||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||..||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1127  ATATCGGGAATGCAGGCTTTAATGAAATTATGGAGTGTTGCCTACCGTCTGAGGACCCAGTCAAGCCCAACCCA  1200

Query 1546  GGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCA  1619
            |||||.|||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||
Sbjct 1201  GGCAGTGACATGATTGCAAGGAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATGGAGAGGAGATATGCACGGAAAAAGCA  1274

Query 1620  CGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCGTCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAG  1693
            .||.||.|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1275  TGCCGACACCGCGGCGAAGCTCCACAGCCTTTGCGAGGCCGTCAAGACCAGAGACATTTTTGGGTTACTCCAAG  1348

Query 1694  CTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTC  1767
            |||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1349  CTTATGCTGATGGTGTGGACCTGACAGAGAAAATCCCACTGGCCAATGGGCATGAGCCAGATGAGACAGCCCTC  1422

Query 1768  CACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACATTGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCT  1841
            ||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||..|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1423  CATCTTGCAGTCAGATCTGTGGACCGGACTTCCCTTCACATTGTAGACTTCCTGGTCCAGAACAGTGGGAACCT  1496

Query 1842  GGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGT  1915
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.
Sbjct 1497  GGATAAACAGACAGGCAAGGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACAGACAATGCTGAGTGCCTCAAGC  1570

Query 1916  TGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAGTCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGC  1989
            |.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.
Sbjct 1571  TCCTCCTGCGGGGAAAAGCCTCCATTGAGATAGCCAATGAGTCAGGAGAGACCCCGTTGGACATTGCTAAGCGG  1644

Query 1990  CTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTTATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGA  2063
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1645  CTCAAGCACGAACACTGTGAGGAACTGCTCACTCAGGCCTTGTCGGGGCGGTTTAACTCCCATGTTCACGTCGA  1718

Query 2064  ATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTC  2137
            .|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..||||.|||||..|.|||||.||||
Sbjct 1719  GTATGAATGGCGGCTGCTGCACGAGGACCTGGATGAGAGCGACGACGATGTGGACGAGAAGCTACAGCCTAGTC  1792

Query 2138  CCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCT  2211
            |||||||.|||||.||||||||..|.|||||||||||||||||.||||.||||.|||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1793  CCAACCGACGGGAGGACCGGCCTGTTAGCTTCTACCAGCTGGGGTCCAGCCAGTTTCAGTCCAATGCTGTGTCT  1866

Query 2212  TTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGACAAGCAGA-GGGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGA  2284
            ||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||| ||||||| ..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867  TTGGCCAGAGATACTGCAAACCTCACCAAGGACAAGCAGAGGGGCTTT-GGGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGA  1939

Query 2285  CTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCG  2358
            |.||.||||||.||||||||||||||||.||..||.|||||.|...|.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1940  CCTATGGAGCCATCCTGAGTGGCAGCCCGCCCTCCTCCCAGTCAATACCCCCCAGCACCACCAGCGCACCCCCG  2013

Query 2359  CTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAG-------------------------------------------------  2383
            ||.||.||.||||||||||||||||                                                 
Sbjct 2014  CTCCCACCTCGGAATGTTGGCAAAGTTCAGACAGCCACCTCAGCTAACACCCTGTGGAAGACAAACTCTGTAGG  2087

Query 2384  --------------------------------------------------------------------------  2383
                                                                                      
Sbjct 2088  TGTGGACGGTATCAGCAGGCAGCGATCTTCGTCAGATCTGCCAGCTGTCCACCCACCGCTGCCCCCTCTTCGAG  2161

Query 2384  ------------ATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCGTTGCCAAGACGCCCAGC-GTAA---TGGAAGC  2441
                        |||||||||||.||||.||.|||||.||.||.||.||||    ||.| |.||   |.|||||
Sbjct 2162  TGACATCTACCAATCCCCTGACCACCACACCACCCCCTCCTGTGGCTAAGA----CATCAGGAACTCTAGAAGC  2231

Query 2442  CTTGAGCCAGCCGAGCAAG-CCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCACCTCTGCCCCCACAGCCG  2514
            |.|||.||||||||||||| ||| |||..|||||||.||||||||.||.||||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 2232  CATGAACCAGCCGAGCAAGTCCT-CCCAACCTGGGACCTCACAGAGCAAGCCCCCGCCCCTGCCACCTCAGCCA  2304

Query 2515  CCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTCCACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACC  2588
            |||||||||||.||.||||||||.||.||..|.|||.||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2305  CCCAGCCGCCTGCCTCAGAAGAAACCAGCTTCCGGGACTGACAAGCCAACCCCGCTGACCAACAAAGGACAGCC  2378

Query 2589  GAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAATGCTATGGTCCTGCAGCCCCCTG  2662
            ||||||||||                  ||||||..|||||||||||||||.||.||||.||||||||||||.|
Sbjct 2379  GAGAGGACCT------------------GAAGCTTCGGGTCCTCTGTCCAACGCCATGGCCCTGCAGCCCCCAG  2434

Query 2663  CACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCGCTCTATAACTGTGTGGCT  2736
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||..|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 2435  CACCCATGCCTAGGAAGTCACAGGCGACCAAGTCAAAGCCCAAGCGAGTGAAAGCACTCTACAACTGCGTGGCT  2508

Query 2737  GACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGTGGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTG  2810
            ||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2509  GACAACCCAGACGAGCTGACTTTCTCTGAGGGCGACGTGATCATTGTGGATGGGGAAGAGGATCAGGAGTGGTG  2582

Query 2811  GATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTGTGCACTTTATCGCTGAC  2883
            |||.||||||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 2583  GATCGGCCACATCGATGGAGAGCCCAGCCGCAAAGGAGCGTTTCCCGTATCGTTTGTGCACTTTATTGCTGAC  2655