Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07331
• Subject: NM_001282112.2
• Aligned Length: 2586
• Identities: 2584
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAAGACTGTGCTCATGGTTGCTGAAAAGCCGTCCTTGGCACAGTCAATTGCCAAAATCCTCTCTAGAGGGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGACTGTGCTCATGGTTGCTGAAAAGCCGTCCTTGGCACAGTCAATTGCCAAAATCCTCTCTAGAGGGAG  74

Query   75  CCTGTCCTCACACAAAGGGCTGAACGGGGCCTGCTCAGTCCACGAGTACACTGGGACCTTTGCTGGCCAGCCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGTCCTCACACAAAGGGCTGAACGGGGCCTGCTCAGTCCACGAGTACACTGGGACCTTTGCTGGCCAGCCAG  148

Query  149  TGCGCTTCAAGATGACGTCTGTCTGTGGTCACGTGATGACCCTGGATTTCCTGGGAAAATACAACAAATGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCGCTTCAAGATGACGTCTGTCTGTGGTCACGTGATGACCCTGGATTTCCTGGGAAAATACAACAAATGGGAC  222

Query  223  AAAGTGGACCCCGCAGAACTGTTCAGCCAAGCTCCCACGGAGAAGAAAGAAGCTAACCCCAAGCTGAACATGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGTGGACCCCGCAGAACTGTTCAGCCAAGCTCCCACGGAGAAGAAAGAAGCTAACCCCAAGCTGAACATGGT  296

Query  297  GAAGTTCCTGCAGGTGGAGGGCAGAGGCTGCGACTACATCGTGCTGTGGCTGGACTGCGACAAGGAGGGGGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGTTCCTGCAGGTGGAGGGCAGAGGCTGCGACTACATCGTGCTGTGGCTGGACTGCGACAAGGAGGGGGAGA  370

Query  371  ACATCTGCTTTGAGGTTCTTGATGCTGTTCTGCCCGTCATGAACAAGGCCCATGGTGGCGAGAAGACCGTGTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATCTGCTTTGAGGTTCTTGATGCTGTTCTGCCCGTCATGAACAAGGCCCATGGTGGCGAGAAGACCGTGTTC  444

Query  445  CGGGCCAGGTTTAGCTCCATCACGGACACAGACATCTGTAATGCCATGGCCTGCCTAGGCGAGCCTGACCACAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGGGCCAGGTTTAGCTCCATCACGGACACAGACATCTGTAATGCCATGGCCTGCCTAGGCGAGCCTGACCACAA  518

Query  519  CGAGGCGCTCTCAGTGGATGCTCGCCAGGAGCTGGACCTGCGAATCGGCTGTGCATTCACCAGGTTTCAGACTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAGGCGCTCTCAGTGGATGCTCGCCAGGAGCTGGACCTGCGAATCGGCTGTGCATTCACCAGGTTTCAGACTA  592

Query  593  AATATTTCCAGGGGAAATACGGTGATTTAGACAGCTCTCTCATCTCCTTTGGGCCGTGTCAGACTCCAACCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AATATTTCCAGGGGAAATACGGTGATTTAGACAGCTCTCTCATCTCCTTTGGGCCGTGTCAGACTCCAACCCTG  666

Query  667  GGATTCTGTGTGGAGAGACATGATAAAATCCAGTCCTTCAAACCAGAGACCTACTGGGTGCTGCAGGCCAAGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGATTCTGTGTGGAGAGACATGATAAAATCCAGTCCTTCAAACCAGAGACCTACTGGGTGCTGCAGGCCAAGGT  740

Query  741  TAACACTGACAAAGACAGATCTCTCCTTTTGGACTGGGACCGAGTAAGAGTGTTTGACCGGGAGATCGCACAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAACACTGACAAAGACAGATCTCTCCTTTTGGACTGGGACCGAGTAAGAGTGTTTGACCGGGAGATCGCACAGA  814

Query  815  TGTTTTTAAACATGACAAAGCTGGAGAAGGAAGCCCAGGTGGAGGCCACAAGCAGGAAAGAAAAGGCCAAGCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTTTTTAAACATGACAAAGCTGGAGAAGGAAGCCCAGGTGGAGGCCACAAGCAGGAAAGAAAAGGCCAAGCAG  888

Query  889  AGGCCCCTGGCCCTGAACACTGTGGAGATGCTGCGTGTGGCCAGCTCTTCTCTGGGCATGGGGCCGCAGCATGC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  AGGCCCCTGGCCCTGAACACTGTGGAGATGCTGCGTGTGGCCAGCTCTTCTCTGGGCATGGGGCCGCAGCACGC  962

Query  963  CATGCAGACGGCTGAGCGGCTCTACACGCAAGGCTACATCAGCTACCCACGGACAGAGACCACCCACTACCCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATGCAGACGGCTGAGCGGCTCTACACGCAAGGCTACATCAGCTACCCACGGACAGAGACCACCCACTACCCTG  1036

Query 1037  AGAACTTTGACCTGAAGGGCTCTCTGCGGCAGCAGGCCAACCACCCCTACTGGGCCAACACGGTGAAGCGGTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAACTTTGACCTGAAGGGCTCTCTGCGGCAGCAGGCCAACCACCCCTACTGGGCCGACACGGTGAAGCGGTTG  1110

Query 1111  TTAGCAGAAGGTATCAACCGCCCGCGGAAAGGCCATGACGCCGGCGACCATCCCCCCATCACCCCCATGAAGTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTAGCAGAAGGTATCAACCGCCCGCGGAAAGGCCATGACGCCGGCGACCATCCCCCCATCACCCCCATGAAGTC  1184

Query 1185  TGCCACAGAGGCCGAATTAGGGGGTGACGCGTGGCGGCTCTATGAGTACATCACCAGACACTTCATCGCCACGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCACAGAGGCCGAATTAGGGGGTGACGCGTGGCGGCTCTATGAGTACATCACCAGACACTTCATCGCCACGG  1258

Query 1259  TCAGCCATGACTGCAAGTACCTGCAGAGCACCATCTCCTTCAGAATTGGGCCCGAGCTCTTCACCTGCTCCGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGCCATGACTGCAAGTACCTGCAGAGCACCATCTCCTTCAGAATTGGGCCCGAGCTCTTCACCTGCTCCGGG  1332

Query 1333  AAGACCGTCCTCTCACCAGGCTTCACGGAGGTCATGCCCTGGCAGAGCGTGCCCCTGGAGGAGAGCCTGCCCAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGACCGTCCTCTCACCAGGCTTCACGGAGGTCATGCCCTGGCAGAGCGTGCCCCTGGAGGAGAGCCTGCCCAC  1406

Query 1407  TTGCCAGCGGGGTGATGCCTTCCCTGTGGGCGAGGTGAAGATGCTGGAGAAGCAGACGAACCCACCCGACTACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTGCCAGCGGGGTGATGCCTTCCCTGTGGGCGAGGTGAAGATGCTGGAGAAGCAGACGAACCCACCCGACTACC  1480

Query 1481  TGACGGAGGCCGAGCTCATCACGCTCATGGAGAAGCATGGCATCGGCACGGATGCCAGCATCCCTGTGCATATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGACGGAGGCCGAGCTCATCACGCTCATGGAGAAGCATGGCATCGGCACGGATGCCAGCATCCCTGTGCATATC  1554

Query 1555  AACAACATCTGCCAGCGCAACTATGTCACGGTGGAGAGCGGGCGCCGGCTCAAGCCCACCAACCTCGGCATCGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACAACATCTGCCAGCGCAACTATGTCACGGTGGAGAGCGGGCGCCGGCTCAAGCCCACCAACCTCGGCATCGT  1628

Query 1629  CCTGGTGCACGGCTACTATAAGATTGATGCAGAGCTGGTGCTCCCCACCATCCGCAGTGCAGTGGAGAAGCAGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCTGGTGCACGGCTACTATAAGATTGATGCAGAGCTGGTGCTCCCCACCATCCGCAGTGCAGTGGAGAAGCAGC  1702

Query 1703  TGAACCTGATCGCCCAGGGCAAGGCCGACTACCGCCAGGTCCTGGGCCACACCCTGGACGTGTTCAAGAGGAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGAACCTGATCGCCCAGGGCAAGGCCGACTACCGCCAGGTCCTGGGCCACACCCTGGACGTGTTCAAGAGGAAG  1776

Query 1777  TTCCACTACTTTGTCGACTCCATTGCTGGCATGGATGAGTTGATGGAGGTGTCTTTCTCGCCCCTGGCGGCCAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCCACTACTTTGTCGACTCCATTGCTGGCATGGATGAGTTGATGGAGGTGTCTTTCTCGCCCCTGGCGGCCAC  1850

Query 1851  AGGCAAGCCCCTCTCACGCTGTGGGAAGTGCCACCGCTTCATGAAGTACATCCAGGCCAAGCCAAGCCGCCTGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGCAAGCCCCTCTCACGCTGTGGGAAGTGCCACCGCTTCATGAAGTACATCCAGGCCAAGCCAAGCCGCCTGC  1924

Query 1925  ACTGCTCCCACTGCGATGAGACCTACACGCTCCCCCAGAACGGCACCATCAAGCTCTACAAGGAGCTCCGCTGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACTGCTCCCACTGCGATGAGACCTACACGCTCCCCCAGAACGGCACCATCAAGCTCTACAAGGAGCTCCGCTGC  1998

Query 1999  CCTCTGGATGACTTCGAGCTGGTCCTGTGGTCATCAGGCTCTCGGGGCAAGAGCTACCCGCTGTGCCCCTACTG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCTCTGGATGACTTCGAGCTGGTCCTGTGGTCATCAGGCTCTCGGGGCAAGAGCTACCCGCTGTGCCCCTACTG  2072

Query 2073  CTACAACCACCCACCCTTCCGAGACATGAAGAAAGGCATGGGCTGCAACGAGTGTACGCACCCCTCCTGCCAGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTACAACCACCCACCCTTCCGAGACATGAAGAAAGGCATGGGCTGCAACGAGTGTACGCACCCCTCCTGCCAGC  2146

Query 2147  ACTCGCTGAGCATGCTGGGCATCGGCCAGTGCGTGGAATGTGAGAGCGGGGTGCTGGTGCTGGACCCCACCTCG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ACTCGCTGAGCATGCTGGGCATCGGCCAGTGCGTGGAATGTGAGAGCGGGGTGCTGGTGCTGGACCCCACCTCG  2220

Query 2221  GGCCCCAAGTGGAAGGTGGCCTGCAACAAGTGCAACGTGGTAGCGCACTGCTTCGAGAACGCCCACCGCGTGCG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGCCCCAAGTGGAAGGTGGCCTGCAACAAGTGCAACGTGGTAGCGCACTGCTTCGAGAACGCCCACCGCGTGCG  2294

Query 2295  GGTGTCCGCCGACACCTGCAGTGTCTGTGAGGCCGCCTTGCTTGATGTGGACTTCAACAAGGCCAAGTCCCCAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGTGTCCGCCGACACCTGCAGTGTCTGTGAGGCCGCCTTGCTTGATGTGGACTTCAACAAGGCCAAGTCCCCAC  2368

Query 2369  TCCCGGGCGATGAGACGCAGCACATGGGCTGCGTCTTTTGTGACCCCGTCTTCCAGGAGCTGGTGGAGCTGAAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCCCGGGCGATGAGACGCAGCACATGGGCTGCGTCTTTTGTGACCCCGTCTTCCAGGAGCTGGTGGAGCTGAAG  2442

Query 2443  CATGCGGCCTCCTGCCACCCCATGCACCGCGGTGGACCAGGGAGAAGGCAGGGTCGAGGGCGGGGCCGGGCCAG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CATGCGGCCTCCTGCCACCCCATGCACCGCGGTGGACCAGGGAGAAGGCAGGGTCGAGGGCGGGGCCGGGCCAG  2516

Query 2517  GAGGCCCCCTGGGAAGCCCAACCCCAGACGGCCCAAGGACAAGATGTCAGCCCTGGCCGCCTACTTTGTA  2586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GAGGCCCCCTGGGAAGCCCAACCCCAGACGGCCCAAGGACAAGATGTCAGCCCTGGCCGCCTACTTTGTA  2586