Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07340
- Subject:
- XR_001743731.2
- Aligned Length:
- 2156
- Identities:
- 1454
- Gaps:
- 701
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GTAGTGCTCCTGCTTCCTGGCCGAGGGCGGGCGAGCGGAGCCTGCTTTCGCAGCGATCGCGAGCGTGTGGCGAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGCTTCTGTCTGTTATTTAGATATGGAAGCTGAGGGGATGCACAGAGGCAGCCAGAACCTAGGTCAGGGTCTCG 148
Query 1 ----------------------------------ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCG 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCGGTGCTGACCGCCCCCGGGGTCGAGTAGGCGATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCG 222
Query 41 GTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGATGAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTG 114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGATGAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTG 296
Query 115 ACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAACTGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCA 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAACTGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCA 370
Query 189 CTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGGACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGA 262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGGACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGA 444
Query 263 ACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTCCATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTG 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTCCATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTG 518
Query 337 GAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAGTTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTC 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAGTTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTC 592
Query 411 CCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAGGAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAG 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAGGAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAG 666
Query 485 CAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAAATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCA 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAAATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCA 740
Query 559 GTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTACACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGA 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTACACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGA 814
Query 633 GCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCTGGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAG 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCTGGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAG 888
Query 707 CCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACAGATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACAGATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAA 962
Query 781 ATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGAATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGT 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGAATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGT 1036
Query 855 TGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAGTCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAG 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAGTCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAG 1110
Query 929 TGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGAACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAG 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGAACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAG 1184
Query 1003 GACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGGAGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAA 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGGAGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAA 1258
Query 1077 GGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAAGAATTAGAGCAGACCAA----------------------- 1127
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAAGAATTAGAGCAGACCAAGGTACTGGAAAGAAGATGGAAGT 1332
Query 1128 ---------GGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGATGTGCTAG 1192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTAGAATTTGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGATGTGCTAG 1406
Query 1193 AGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCCACAGTTTC 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCCACAGTTTC 1480
Query 1267 TGCTCCTACTGTATCAATGAATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCCCATTTGTCGGAAGGACATTAAGTCCAA 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGCTCCTACTGTATCAATGAATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCCCATTTGTCGGAAGGACATTAAGTCCAA 1554
Query 1341 AACATACTCTTTGGTTCTGGACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCTGAGCTCAGAAGTGAAAGAACGAC 1414
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACGTACTCTTTGGTTCTGGACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCTGAGCTCAGAAGTGAAAGAACGAC 1628
Query 1415 GAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC--------------------------------- 1455
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTCTGAAGACCGTGCTCTAAGGGCATTTGAAAGACT 1702
Query 1456 -------------------------------------------------------------------------- 1455
Sbjct 1703 GCCAGGTAGTGCGAGCCTGAGATGGTCTGGAGGATTCTCTCTAGCCGTGACTCCGCTGCTCTGAAGGTCAACTG 1776
Query 1456 -------------------------------------------------------------------------- 1455
Sbjct 1777 AGAAGTCTTGTGGGACAGAGACTTGAGTTAGGAAGCCCTCAGTCACTTGCCTTCCACGGTGGCCAGCCCTGCTG 1850
Query 1456 -------------------------------------------------------------------------- 1455
Sbjct 1851 CCATCATTGGCTGAAGCACCACCAGGATTCACGGCACCCAACTGCTTCAGGGTACTTCGTAGACTCTGCCTCAC 1924
Query 1456 -------------------------------------------------------------------------- 1455
Sbjct 1925 TACATGTCGAAAGAGTTATTTGAGTTCTCTTCTGTTTTTTTTTAATTTGTTGTTGTTGTTACTGTTTTGATACC 1998
Query 1456 -------------------------------------------------------------------------- 1455
Sbjct 1999 TCGGAAACACCTCCGTTGACAGTTGTTTTGGATAGGTTGGGTGTACCCCATGGCTGCCTCTGAAGGCAGTGTCT 2072
Query 1456 -------------------------------------------------------------------------- 1455
Sbjct 2073 ATTTTGAGAGGATGGCTTACCTCTTCTTTGTGAAAATACTATCTCATTTCCTGGAAATAAAATGTAAAACCTGT 2146
Query 1456 ---------- 1455
Sbjct 2147 CAGTTGCTCA 2156