Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07368
• Subject: XM_011522203.2
• Aligned Length: 2085
• Identities: 1923
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGGAGAACGACCCCTCGAGACGAAGAGAGTCCATCTCTCTCACACCTGTGGCCAAGGGTCTGGAGAACATGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAACGACCCCTCGAGACGAAGAGAGTCCATCTCTCTCACACCTGTGGCCAAGGGTCTGGAGAACATGGG  74

Query   75  GGCTGATTTCTTGGAAAGCCTGGAGGAAGGCCAGCTCCCTAGGAGTGACTTGAGCCCCGCAGAGATCAGGAGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGATTTCTTGGAAAGCCTGGAGGAAGGCCAGCTCCCTAGGAGTGACTTGAGCCCCGCAGAGATCAGGAGCA  148

Query  149  GCTGGAGCGAGGCGGCGCCGAAGCCCTTCTCCAGATGGAGGAACCTGCAGCCAGCCCTGAGAGCCAGAAGCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTGGAGCGAGGCGGCGCCGAAGCCCTTCTCCAGATGGAGGAACCTGCAGCCAGCCCTGAGAGCCAGAAGCTTC  222

Query  223  TGCAGGGAGCACATGCAGCTGTTTCGATGGATCGGCACAGGCCTGCTCTGCACTGGGCTCTCTGCCTTCCTGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAGGGAGCACATGCAGCTGTTTCGATGGATCGGCACAGGCCTGCTCTGCACTGGGCTCTCTGCCTTCCTGCT  296

Query  297  GGTGGCCTGCCTCCTGGATTTCCAGAGGGCCCTGGCTCTGTTTGTCCTCACCTGTGTGGTCCTCACCTTCCTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGGCCTGCCTCCTGGATTTCCAGAGGGCCCTGGCTCTGTTTGTCCTCACCTGTGTGGTCCTCACCTTCCTGG  370

Query  371  GCCACCGCCTGCTGAAACGGCTTCTGGGGCCAAAGCTGAGGAGGTTTCTCAAGCCTCAGGGCCATCCCCGCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCACCGCCTGCTGAAACGGCTTCTGGGGCCAAAGCTGAGGAGGTTTCTCAAGCCTCAGGGCCATCCCCGCCTG  444

Query  445  CTGCTCTGGTTTAAGAGGGGTCTAGCTCTTGCTGCTTTCCTGGGCCTGGTCCTGTGGCTGTCTCTGGACACCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCTCTGGTTTAAGAGGGGTCTAGCTCTTGCTGCTTTCCTGGGCCTGGTCCTGTGGCTGTCTCTGGACACCTC  518

Query  519  CCAGCGGCCTGAGCAACTGGTGTCCTTCGCAGGAATCTGCGTGTTCGTCGCTCTCCTCTTTGCCTGCTCAAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGCGGCCTGAGCAACTGGTGTCCTTCGCAGGAATCTGCGTGTTCGTCGCTCTCCTCTTTGCCTGCTCAAAGC  592

Query  593  ATCATTGCGCAGTGTCCTGGAGGGCCGTGTCTTGGGGACTTGGACTGCAGTTTGTACTTGGACTCCTCGTCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCATTGCGCAGTGTCCTGGAGGGCCGTGTCTTGGGGACTTGGACTGCAGTTTGTACTTGGACTCCTCGTCATC  666

Query  667  AGAACAGAACCAGGATTCATTGCGTTCGAGTGGCTGGGCGAGCAGATCCGGATCTTCCTGAGCTACACGAAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAACAGAACCAGGATTCATTGCGTTCGAGTGGCTGGGCGAGCAGATCCGGATCTTCCTGAGCTACACGAAGGC  740

Query  741  TGGCTCCAGCTTCGTGTTTGGGGAGGCGCTGGTCAAGGATGTCTTTGCCTTTCAGGTTCTGCCCATCATTGTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCTCCAGCTTCGTGTTTGGGGAGGCGCTGGTCAAGGATGTCTTTGCCTTTCAGGTTCTGCCCATCATTGTCT  814

Query  815  TTTTCAGCTGTGTCATATCCGTTCTCTACCACGTGGGCCTCATGCAGTGGGTGATCCTGAAGATTGCCTGGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTTCAGCTGTGTCATATCCGTTCTCTACCACGTGGGCCTCATGCAGTGGGTGATCCTGAAGATTGCCTGGCTG  888

Query  889  ATGCAAGTCACCATGGGCACCACAGCCACTGAGACCCTGAGTGTGGCTGGAAACATCTTTGTGAGCCAGACCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGCAAGTCACCATGGGCACCACAGCCACTGAGACCCTGAGTGTGGCTGGAAACATCTTTGTGAGCCAGACCGA  962

Query  963  GGCTCCATTACTGATCCGGCCCTACTTGGCAGACATGACACTCTCTGAAGTCCACGTTGTCATGACCGGAGGTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTCCATTACTGATCCGGCCCTACTTGGCAGACATGACACTCTCTGAAGTCCACGTTGTCATGACCGGAGGTT  1036

Query 1037  ACGCCACCATTGCTGGCAGCCTGCTGGGTGCCTACATCTCCTTTGGGATCGATGCCACCTCGTTGATTGCAGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGCCACCATTGCTGGCAGCCTGCTGGGTGCCTACATCTCCTTTGGGATCGATGCCACCTCGTTGATTGCAGCC  1110

Query 1111  TCTGTGATGGCTGCCCCTTGTGCCTTGGCCCTCTCCAAACTGGTCTACCCGGAGGTGGAGGAGTCCAAGTTTAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGTGATGGCTGCCCCTTGTGCCTTGGCCCTCTCCAAGCTGGTCTACCCGGAGGTGGAGGAGTCCAAGTTTAG  1184

Query 1185  GAGGGAGGAAGGAGTGAAACTGACCTATGGAGATGCTCAGAACCTCATAGAAGCAGCCAGCACTGGGGCCGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGGAGGAAGGAGTGAAACTGACCTATGGAGATGCTCAGAACCTCATAGAAGCAGCCAGCACTGGGGCCGCCA  1258

Query 1259  TCTCCGTGAAGGTGGTCGCCAACATCGCTGCCAACCTGATTGCGTTCCTGGCTGTGCTGGACTTTATCAATGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTCCGTGAAGGTGGTCGCCAACATCGCTGCCAACCTGATTGCGTTCCTGGCTGTGCTGGACTTTATCAATGCT  1332

Query 1333  GCCCTCTCCTGGCTGGGAGACATGGTGGACATCCAGGGGCTCAGCTTCCAGCTCATCTGCTCCTACATCCTGCG  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCCTCTCCTGGCTGGGAGACATGGTGGACATCCAAGGGCTCAGCTTCCAGCTCATCTGCTCCTACATCCTGCG  1406

Query 1407  GCCTGTAGCCTTCTTGATGGGTGTGGCGTGGGAGGACTGCCCAGTGGTAGCTGAGCTGCTGGGGATCAAGCTGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCTGTAGCCTTCTTGATGGGTGTGGCGTGGGAGGACTGCCCAGTGGTAGCTGAGCTGCTGGGGATCAAGCTGT  1480

Query 1481  TTCTGAACGAGTTTGTGGCCTATCAAGACCTCTCCAAGTACAAGCAATGCCGCCTGGCAGGGGCCGAGGAGTGG  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCTGAACGAGTTTGTGGCCTATCAAGACCTCTCCAAGTACAAGCAACGCCGCCTGGCAGGGGCCGAGGAGTGG  1554

Query 1555  GTCGGCGACAGGAAGCAGTGGATCTCCGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCCCTCTGTGGATTTGCCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTCGGCGACAGGAAGCAGTGGATCTCCGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCCCTCTGTGGATTTGCCAA  1628

Query 1629  TTTCAGCTCCATTGGGATCATGCTGGGAGGCTTGACCTCCATGGTCCCCCAACGGAAGAGCGACTTCTCCCAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTCAGCTCCATTGGGATCATGCTGGGAGGCTTGACCTCCATGGTCCCCCAACGGAAGAGCGACTTCTCCCAGA  1702

Query 1703  TAGTGCTCCGGGCGCTCTTCACGGGAGCCTGTGTGTCCCTGGTGAACGCCTGTATGGCAGGGATCCTCTACATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TAGTGCTCCGGGCGCTCTTCACGGGAGCCTGTGTGTCCCTGGTGAACGCCTGTATGGCAGGGATCCTCTACATG  1776

Query 1777  CCCAGGGGGGCTGAAGTTGACTGCATGTCCCTCTTGAACACGACCCTCAGCAGCAGTAGCTTTGAGATTTACCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCCAGGGGGGCTGAAGTTGACTGCATGTCCCTCTTGAACACGACCCTCAGCAGCAGTAGCTTTGAGATTTACCA  1850

Query 1851  GTGCTGCCGTGAGGCCTTCCAGAGCGTCAATCCA-GAGTTCAGCCCA----------GAGGCCCTGGACAAC--  1911
            |||||||||||||||||||||||  |.||.|.|| ||||..||..||          ||.|||    |.|||  
Sbjct 1851  GTGCTGCCGTGAGGCCTTCCAGA--GACAGTGCATGAGTCAAGAGCAAGTCGAAGATGAAGCC----AGAACAC  1918

Query 1912  ----TGCTGTCGG-----TTT------TACAA----------------CCACACGAT-----CTG---------  1940
                ||  ||.||     |||      |||||                ||||| |||     |||         
Sbjct 1919  AGCATG--GTGGGACTCATTTCTCATCTACAAGTAAGAAGGCAGTAACCCACA-GATCAAGACTGCCAACCAGA  1989

Query 1941  TGCACAG-------------------------------------------------------------------  1947
            ||.|||.                                                                   
Sbjct 1990  TGGACACACGAAATGCTGCTACACACTCTCCTACACGTCAGTAAATTCCTTGCATCCAATGACTCCATGTGCTT  2063

Query 1948  -------------  1947
                         
Sbjct 2064  CAGTGACGGACCA  2076